Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
2.808
P-Index
This Author published in this journals
All Journal HAYATI Journal of Biosciences Jurnal Ilmu Pertanian Indonesia Jurnal Akuakultur Indonesia Buletin PSP Jurnal Teknologi Perikanan dan Kelautan Jurnal Pengolahan Hasil Perikanan Indonesia Jurnal Ilmu dan Teknologi Kelautan Tropis Jurnal Ilmu-Ilmu Perairan dan Perikanan Indonesia Jurnal Veteriner ILMU KELAUTAN: Indonesian Journal of Marine Sciences JURNAL TEKNOLOGI LINGKUNGAN Jurnal Pengelolaan Sumberdaya Alam dan Lingkungan (Journal of Natural Resources and Environmental Management) Omni-Akuatika Jurnal Biologi Tropis Jurnal Pengelolaan Perikanan Tropis (Journal Of Tropical Fisheries Management) Jurnal Iktiologi Indonesia (Indonesian Journal of Ichthyology) Habitus Aquatica : Journal of Aquatic Resources and Fisheries Management Indonesian Journal of Mollusk COJ (Coastal and Ocean Journal) Depik Jurnal Ilmu-Ilmu Perairan, Pesisir dan Perikanan Depik Jurnal Ilmu-Ilmu Perairan, Pesisir, dan Perikanan Journal of Marine Studies
Nurlisa Alias Butet
Departemen Manajemen Sumberdaya Perairan, Fakultas Perikanan Dan Ilmu Kelautan, IPB University, Bogor, 16128, Indonesia
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Chemistry Decision Sciences, Operations Research & Management Earth & Planetary Sciences Education Engineering Environmental Science Immunology & microbiology Library & Information Science Social Sciences Veterinary

Published : 42 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search
Journal : Jurnal Biologi Tropis

 1 
AUTENTIKASI SPESIES IKAN KERAPU BERDASARKAN MARKA GEN MT-COI DARI PERAIRAN PEUKAN BADA, ACEH Mohammad Mukhlis Kamal; Agus Alim Hakim; Nurlisa Alias Butet; Yulia Fitrianingsih; Rika Astuti
Jurnal Biologi Tropis Vol. 19 No. 2 (2019): Juli - Desember
Publisher : Universitas Mataram

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (435.161 KB) | DOI: 10.29303/jbt.v19i2.1245

Abstract

Abstrak : Variasi bentuk dan pola pewarnaan tubuh ikan kerapu (Famili Serranidae) sangat variatif, sehingga pengenalan spesies secara morfologis sering tidak akurat. Penelitian ini bertujuan untuk mengautentikasi ikan kerapu dengan menggunakan marka gen COI. Contoh ikan kerapu yang diamati berjumlah 29 ekor yang dikumpulkan dari tiga tempat pendaratan ikan di Perairan Peukan Bada, Propinsi Aceh. Secara karakter morfologis, ikan kerapu tersebut teridentifikasi lebih dari 8 spesies. Untuk analisis DNA, sebanyak 30 mg daging sirip dari setiap ikan contoh diambil untuk dilakukan isolasi dan ekstraksi DNA, kemudian visualisasi elektroforesis dan fragmentasi DNA gen COI dengan metode PCR-sekuensing. Setelah diekstraksi, diperoleh 20 sampel DNA yang tervisualisasi dengan baik, yang dari jumlah tersebut terdapat 16 sampel dapat diamplifikasi. Hasilnya menunjukkan terdapat 6 spesies yang terautentikasi. Kelompok pertama adalah Variola albimarginata, Cephalopholis urodeta, dan C. sexmaculata dengan tingkat kemiripan ≥ 97%. Berikutnya C. boenak, Epinephelus merra, dan Scolopsis vosmeri tingkat kemiripannya ≤ 97%. Bila dibandingkan hasil autentikasi DNA, hasil penelitian menunjukkan bahwa 13 sampel atau > 80% tidak teridentifikasi dengan benar secara morfologis. Berdasarkan jarak genetik, pohon filogeni membentuk 2 clade antara Serranidae dan Nemipteridae. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penggunaan marka gen COI sangat efektif untuk autentikasi spesies yang dapat dijadikan sebagai instrumen dalam pemanfaatan dan pengelolaan ikan kerapu.Kata kunci : kerapu, variasi morfologi, gen MT-COI, autentikasi.Abstract : The groupers (family Serranidae) show high variability both in body shapes and coloration leads to highly morphological-based misidentification. The research was aimed in autenthication of the grouper species using MT-COI gene. A total of 29 grouper fishes were collected from three fish landing sites of Peukan Bada, Aceh Province. These fishes were morphologically identified from which more than 8 species were obtained. A 30 mg of the fin meat of each sample was taken for DNA extraction, isolation, electrophoresis visualization, and DNA fragmentation of COI gene using PCR-sequenching.  There were 20 DNA samples was clearly visualized of which 16 has been proceeded for amplification. The results showed that V. albimarginata, C. urodeta, and C. sexmaculata showed ≥ 97% similarity, whereas C. boenak, E. merra, dan S. vosmeri with ≤ 97% similarity. Based on phylogenetic tree analysis there was 2 clearly different clades separating family of Serranidae and Nemipteridae. The use of MT-COI gene was effective and accurate tool in species authentication which could be used as an instrument for utilization and management of the grouper species.Keywords : groupers, morphological variation, MT-COI gene, autenthication.
Co-Authors . Erwyansyah . Zairion ACHMAD FARAJALLAH Agus Alim Hakim Ali Mashar Ansori , Mukhlas Arif Wibowo Arif Wibowo Ayu, Inna Puspa Azizah, Hikmatul Beginer Subhan Borbee, Erin Dedi Soedharma Dedy D. Solihin, Dedy D. Dian Rezki Muliani Dietriech Geoffrey Bengen Endah Sri Rahayu Etty Riani Eva Muhajirah Findra, Muhammad Nur Forcep Rio Indaryanto Fredinan Yulianda Gelis, Ester R. E. Gita Kusuma Rahayu Hawis H Madduppa Hemat Sirait Hikmatul Azizah Hikmatul Azizah Husain Latuconsina Inge Anggraeni Bela Putri Dewi Inggrid Wahyuni Eviasta Irianda, Nadya Jeny Isdradjad Setyobudiandi Isdradjad Setyobudiandi Kadarwan Soewardi Kadarwan Soewardi Kismanto Koroy Krisanti , Majariana Lane, Christopher Lella Herdiana Luky Adrianto Lusita Meilana M Mukhlis Kamal M Mukhlis Kamal M Mukhlis Kamal, M Mukhlis M. M. Kamal M. Mukhlis Kamal, M. Mukhlis M.M. Kamal Ma'mun Ansori Majariana Krisanti Mala Nurilmala Maya F Tamimi Mennofatria Boer Mohammad Mukhlis Kamal Muhammad Mukhlis Kamal Muhammad Reza Cordova, Muhammad Reza Mukhlis Kamal, Muhammad Nandini, Annisa Putri Nurasiah Riza Nurfajar, Nurfajar Nurfajrin Nisa Okta Simon Prasadi, Oto Rahayu, Endah Sri Rahmat Kurnia Ridwan Affandi RIDWAN AFFANDI Ridwan Affandi Rika Astuti Risa Tiuria Rudhy Gustiano Rudhy Gustiano Rugaya H. Serosero Ruzanna, Arina Sani, L. Mukhsin Iqbal Setiyadi, Benny Shofirma, Adela Sulistiono Syamsul Bachry TARUNI SRI PRAWAST MIEN KAOMINI ANY ARYANI DEDY DURYADI SOLIHIN TATI NURHAYATI Thomas Nugroho Wahyu Muzammil Yuang Dinni Aksari Yulia Fitrianingsih Yusli Wardiatno