Claim Missing Document
Check
Articles

Found 6 Documents
Search
Journal : Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek)

Prediksi Kandidat Protein Target Senyawa Alami Anti-Aging Scopoletin dari Morinda Citrifolia secara In Silico Istiningrum, Reni; Amin, Mohamad; Lestari, Umie
Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek) 2016: Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek)
Publisher : Universitas Muhammadiyah Surakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (570.018 KB)

Abstract

Aging terjadi akibat penurunan progresif kapasitas metabolisme seluler dan aktivitas proliferasi yang disertai dengan hilangnya potensi ekspresi gen, akumulasi mutasi somatik, serta struktur dan fungsi elastisitas kulit berkurang Salah satu upaya yang sering dilakukan untuk menekan terjadinya aging adalah penggunaan kosmetik berbahan kimia yang tanpa disadari justru berdampak buruk bagi kesehatan misalnya dapat menimbulkan kanker. Untuk mengatasi masalah tersebut maka solusi yang dapat dilakukan adalah melalui penggunaan bahan alami yang lebih aman bagi tubuh. Berdasarkan laporan dari penelitian sebelumnya dapat diketahui bahwa tumbuhan Morinda citrifolia memiliki potensi sebagai anti-aging sebab memiliki senyawa alami yaitu berupa senyawa scopoletin. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi apakah senyawa scopoletin dapat menghambat aging pada manusia dengan menggunakan metode reverse docking. Penelitian ini diawali dengan pemodelan struktur 3D senyawa alami scopoletin menggunakandatabase PubChem. Struktur 3D tersebut digunakan untuk menentukan protein target pada manusia dengan WebServer Swiss Target Prediction, PharmMapper, dan SuperPred. Dari tahapan ini diperoleh Carbonic Anhydrase 1 (CA1) dan Carbonic Anhydrase 2 (CA2) sebagai protein protein target pada manusia. Setelah dilakukan Protein Targets Profiling dan Prediksi Protein-protein Network menggunakan String-db menunjukkan bahwa protein target pada manusia untuk Scopoletin adalah CA1 yang berperan pada proses skin aging.
Perkembangan Konsentrasi Hormon Pertumbuhan untuk Metamorfosis Ulat Sutera (Bombyx Mori L.) Putro, Sulistyo Dwi Kartining; Lestari, Umie; Lukiati, Betty
Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek) 2016: Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek)
Publisher : Universitas Muhammadiyah Surakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (705.58 KB)

Abstract

Peranan hormon dalam metamorfosis meliputi proses pengelupasan kulit larva, dan pembentukan pupa pada serangga holometabola. Hormon Juvenil menjadi salah satu kunci hormon yang berperan dalam mengatur aktivitas pertumbuhan serangga.Tujuan dari penelitian ini adalah untuk melakukan isolasi 10kDa yang merupakan hormon juvenil sebagai pengatur utama hormon pertumbuhan dan prekursor utama diapause hormon.Penelitian ini merupakan penelitian eksploratif. Materi hormon 10kDa diisolasi dari hemolympha ulat sutera (Bombyx mori L.) fase Instar 3, instar 4, instar 5, serta fase pupa menggunakan phosphate buffered saline kemudian di running menggunakan SDS-PAGE dan dikoleksi dengan elektroelusi. Karkterisasi hormon 10 kDa pada instar 3, 4, 5 dan pupa meliputi penentuan berat molekul melalui SDS-PAGE dan kandungan protein dengan metode nanodrop spectrophotometer.Hasil running isolat hormon menggunakan metode SDS-PAGE diperoleh pita protein hormon yang terdiri atas 5 pita dengan berat molekul 62,42; 39,10; 30,94; 15,34; dan 10,3 kDa. Kadar Isolat protein hormon 10 kDa diperoleh dengan purifikasi menggunakan metode elektroelusi. Kandungan protein dalam isolate protein hormon 10 kDa pada instar 3 sebesar sebesar 0,121 mg/ml, instar 4 sebesar 0,012 mg/ml, dan instar 5 sebesar 0,117 mg/ml.
Aktivitas Antifertilitas Ekstrak Daun Pacing Costus Speciosus (Koen.) J.E. Smith pada Sperma Tikus Wistar Jantan Wulanzani, Urla Tri; Lestari, Umie; Syamsuri, Istamar
Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek) 2016: Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek)
Publisher : Universitas Muhammadiyah Surakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (574.965 KB)

Abstract

Pacing secara empiris digunakan oleh masyarakat sebagai bahan kontrasepsi tradisional, contohnya di Pulau Wawonii Sulawesi Tenggara daun pacing digunakan untuk kontrasepsi dan perawatan pasca persalinan dengan cara direbus. Berdasarkan fakta tersebut, penelitian ini bertujuan sebagai dasar dari pembuktian secara ilmiah kemampuan daun pacing sebagai calon obat kontrasepsi khususnya pada individu jantan baik secara makroskopi maupun secara molekuler. Penelitian ini juga bertujuan untukmengetahui pengaruh ekstrak daun pacing terhadap motilitas tikus jantan strain wistar dan uji aktivitas fosforilasi protein membran spermatozoa tikus. Ekstrak daun pacing diberikan dengan variasi dosis yakni 65 dan 32 mg/kgBB, sementara itu kelompok kontrol diberikan akuades. Semua sediaan uji diberikan secara oral setiap hari selama 14 hari. Data hasil dari perhitungan motilas sperma selanjutnya dianalisis secara statistik menggunakan uji non-parametrik Kruskal-Wallis, dilanjutkan dengan uji Mann-Whitney. Hasil penelitian motilitas sperma menunjukkan pada dosis 65 dan 32 mg/kg BB, ekstrak daun Pacing mampu menurunkan motilitas spermatozoa sebesar 32-46% (P<0,05). Hasil penelitian pada tahap elektroforesis menunjukkan terbentuknya 6 pita (band) dengan berat molekul 88 kDa; 57 kDa, 47 kDa, 22 kDa, 9 kDa, 3 kDa. Perhitungan aktivitas fosforilasi protein membran spermatozoa secara manual pada protein dengan berat molekul 47 kDa kontrol sebesar 5,8 x 10-1 μmol/mL.menit; pada dosis satu 5,2 x 10-1 μmol/mL.menit; sedangkan pada dosis dua 4,4 x 10-1 μmol/mL.menit. Perhitungan aktivitas fosforilasi protein membran spermatozoa dengan berat molekul 3 kDa pada kontrol sebesar 5,3 x 10-1 μmol/mL.menit; pada dosis satu 1,2 x 10-1 μmol/mL.menit;sedangkan pada dosis dua 1,7 x 10-1 μmol/mL.menit. Nilai aktivitas fosforilasi tersebut selanjutnya dapat digunakan sebagai penunjang penentuan kalitas sperma terutama untuk motilitas sperma secara molekuler.
Analisis Virtual Screening Senyawa Alami Kandidat Agonis PPAR Rahmawati, Ritia; Amin, Mohamad; Lestari, Umie
Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek) 2016: Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek)
Publisher : Universitas Muhammadiyah Surakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (776.249 KB)

Abstract

Senyawa alami pada tanaman berpotensi memiliki aktivitas antikanker, antioksidan, antiinflamasi, dan anti penuaan. Penuaan merupakan suatu proses yang bersifat universal, progresif, endogen, ireversibel, dan merusak. Agonis berperan dalam aktivitas PPAR-γ terkait patofisiologi osteoporosis yang berkaitan dengan usia dengan meningkatkan jumlah adiposit dalam sumsum tulang dan penurunan jumlah osteoblas, serta penyakit terkait usia, seperti diabetes tipe II, obesitas, atherosklerosis, dan penyakit kardiovaskular. Pioglitazone merupakan salah satu derivat Thiazolidinediones TZD. Oleh karena itu, penelitian ini ditujukan untuk mencari senyawa alami kandidat agonis PPAR-γ yang memiliki pola pengikatan yang sama dengan senyawa pioglitazone, dimana pioglitazone telah diketahui sebagai agonis dari PPAR-γ dan termasuk dalam kelompok thiozolidineiones. Ligand binding domain dan entry code dari PPAR-γ didapatkan dari UniPort. Entry code yang digunakan dalam penelitian ini adalah 2XKW. Pdb file dari 2XKW diperolehdari the RCSB PDB akan digunakan untuk validasi struktur 3D dan virtual screening. Validasi struktur 3D PPAR-γ menggunakan SAVES websever. Virtual screening (VS) yang dilakukan pada penelitian ini menggunakan MTiOpenScreen webserver, dan software Pyrx 0,8. Hasil virtual screening divisualisasikan dengan software PyMol dan LigPlot. Berdasarkan binding affinity dan hasil interaksi dengan menggunakan software PyMol dan LigPlot disimpulkan bahwa senyawa ochnaflavone dengan kode ZINC28462577 memiliki potensi sebagai kandidat agonis PPAR-γ karena sama-sama mengikat Cys285 dan Arg288 melalui interaksi hidrofobik.
Analisis Kebutuhan Buku Ajar berbasis Penelitian Materi Filogenetik Molekuler untuk Mahasiswa S1 Pendidikan Biologi Universitas Jember berdasarkan Model Pengembangan Addie Nuha, Ulin; Amin, Mohamad; Lestari, Umie
Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek) 2016: Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek)
Publisher : Universitas Muhammadiyah Surakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (557.98 KB)

Abstract

Filogenetik molekuler merupakan salah satu pokok bahasan dalam mata kuliah Evolusi. Tujuan penelitian ini adalah untuk menganalisis kebutuhan pengembangan buku ajar mata kuliah Evolusi materi filogenetik molekuler untuk mahasiswa S1 Program Studi Pendidikan Biologi Universitas Jember yang selanjutnya dijadikan pijakan untuk pengembangan buku ajar. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif kualitatif. Tahapan analisis merujuk pada tahap Analyze dalam model pengembangan ADDIE. Teknik pengumpulan data dilakukan dengan penyebaran angket, observasi, dan wawancara. Temuan penelitian menunjukkan bahwa: (1) pemahaman mahasiswa tentang filogenetik molekuler masih kurang, (2) salah satu upaya untuk meningkatkan pemahaman mahasiswa mengenai teknik memperoleh data molekuler adalah dengan menyediakan buku ajar berbasis penelitian yang dilengkapi dengan informasi mengenai teknik analisis biologi molekuler, (3) dalam pengembangan buku ajar perlu ditambahkan contoh yang kontekstual berupa hasil penelitian terkini agar mahasiswa dapat mengaitkan konsep filogenetik molekuler yang dipelajari secara teoritis dan mengaitkannya dengan contoh yang kontekstual sehingga pembelajaran menjadi lebih bermakna, (4) untuk pengembangan buku ajar sebaiknya menggunakan sumber literatur terbitan 10 tahun terakhir
Analisis Kebutuhan Buku Ajar berdasarkan Model Pengembangan Borg And Gall untuk Matakuliah Taksonomi Hewan Vertebrata pada Mahasiswa S1 Pendidikan Biologi Universitas Negeri Jember Setyanto, Haqqi Anajili; Amin, Mohammad; Lestari, Umie
Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek) 2016: Prosiding SNPBS (Seminar Nasional Pendidikan Biologi dan Saintek)
Publisher : Universitas Muhammadiyah Surakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (742.139 KB)

Abstract

Matakuliah Taksonomi Hewan Vertebrata merupakan matakuliah yang membahas mengenai sistem pengelompokan hewan berdasarkan karakteristik morfologi, biokimia, tingkah laku, ekologi, dsb. Salah satu kajian penting dalam matakuliah ini adalah filogeni yang mempelajari hubungan kekerabatan antar makhluk hidup. Seiring berkembangnya teknologi, pendekatan nyang digunakan pada matakuliah ini adalah analisis hubungan kekerabatan makhluk hidup berdasarkan data molekular.Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menganalisis kebutuhan buku ajar pada matakuliah Taksonomi Hewan Vertebrata pada konsep pendekatan molekular untuk merekonstruksi taksonomi. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif kuantitatif dengan merujuk tahapan research and information collecting pada model pengembangan Borg and Gall. Teknik pengumpulan data dilakukan dengan penyebaran angket, observasi, dan wawancara. Temuan penelitian menunjukkan bahwa sebanyak 96,6% mahasiswa belum pernah menggunakan buku ajar berbasis penelitian yang merujuk pada pendekatan molekular, 93,7% mahasiswa belum mengenal dengan baik mengenai pendekatan molekular untuk merekonstruksi filogeni organisme dan 90,3% mahasiswa memiliki konsep yang salah mengenai hasil filogeni pendekatan molekular. analisis kebutuhan buku ajar juga menunjukkan bahwa tidak ada buku ajar yan gmembahas mengenai pendekatan molekular pada matakuliah Taksonomi Hewan Vertebrata.
Co-Authors Abdul Gofur Abdul Gofur Abdul Gofur Abdul Gofur Abu Husen Abu Husen Afifah Nur Aini Alif Yanuar Zukmadini Aloysius Duran Corebima Amin, Ihya Fakhrurizal Anton Setia Budi Ardiyas Robi Saputra Basuki B Purnomo, Basuki B Beno Wahono Beno Wahono, Beno Betty Lukiati Cicilia Novi Primiani Cicilia Novi Primiani Cicilia Novi Primiani Cicilia Novi Primiani, Cicilia Desy Putri Rahmawati Dewi Murni Dina Maulina Dina Maulina Dwi Anggorowati Rahayu Endang Suarsini Endik Deni Nugroho Fahmi, Muhammad Najib Farizha Irmawati Farizha Irmawati, Farizha Fitri, Nurul Hadi Suwono Haqqi Anajili Setyanto Haqqi Anajili Setyanto, Haqqi Anajili Herawati Susilo Ihya Fakhrurizal Amin Ika Oktaviana Ika Oktaviana, Ika Istamar Syamsuri, Istamar Istamar Syamsyuri Izza Rohman Kurniawan Setia Putra Listawati, Rizki Mei Misgiati, Misgiati Mochammad Ali Mashur Moh. Amin Mohamad Amin Mohamad Amin Mohamad Amin Mohamad Amin Mohamad Amin Mohamad Amin Mohamad Amin Mohamad Amin Mohamad Amin Mohamad Amin Mohammad Amin Mohammad Amin Mohammad Amin Monalisa PJ Taihuttu Muh. Nur Akbar Murni Sapta Sari Nafisatuzzamrudah Nafisatuzzamrudah Nanda Earlia Nandang Mufti Naning Wahyuni Nindya Ulfa Wardhani Nugrahaningsih Nugrahaningsih Nur Hayati Rahman Fadli Rahmawati D Rahmawati Darussyamsu Reni Istiningrum Reni Istiningrum, Reni Ridho, Muhammad Andi Ali Ristiana, Evi Ritia Rahmawati Ritia Rahmawati, Ritia Rizka Elan Fadilah, Rizka Elan Rizki Mei Listawati Rizkia Suciati Rizkia Suciati Saparuddin Saparuddin Sembiring, Rinawati Siti Nur Arifah Siti Rahma Lestaluhu Sri Endah Indriwati Sri Rahayu Lestari Sulistyo Dwi Kartining Putro Sulistyo Dwi Kartining Putro, Sulistyo Dwi Kartining Susriyati Mahanal Sutiman B Sumitro Sutiman B Sumitro, Sutiman Sutiman B. Sumitro Ulin Nuha Ulin Nuha, Ulin Ulya Ruwaida Umi Fitriyati Urla Tri Wulanzani Urla Tri Wulanzani, Urla Tri