Biota: Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati
Vol 14, No 2 (2009): June 2009

Molecular Identification of Genes Involved in Magnetosome Synthesis in Magnetospirillum magneticum AMB-1

Wahyudi, Aris Tri (Unknown)



Article Info

Publish Date
01 Jun 2010

Abstract

Satu mutan Magnetospirillum magneticum AMB-1 yang tidak bersifat magnetik, yang didesain NMA41, dikonstruksi melalui mutagenesis dengan transposon Mini-Tn5Km1 untuk mengidentifikasi gen yang terlibat dalam sintesis magnetosom. Mutagenesis dengan transposon dilakukan melalui konjugasi antara M. magneticum AMB-1 dan Escherichia coli S17-1 ( pir) yang membawa plasmid pUTmimi-Tn5Km1. Frekuensi transkonjugasi tertinggi berkisar 1.8 x 10-7 sel per resipien. NMA41 tidak respon terhadap bidang magnet dan kehilangan kemampuan dalam mensintesis magnetosom. Sekuens DNA/gen yang disisipi oleh transposon (dinamakan DNA pengapit) diisolasi dengan PCR yang dibalik (inverse PCR) dan diklon ke dalam plasmid pCR2.1. Penyejajaran sekuen DNA dari DNA pengapit terhadap sekuens DNA genom lengkap AMB-1 dapat mengidentifikasi sebuah kerangka baca terbuka (open reading frame, ORF2) dalam suatu operon yang terdiri dari 4 gen. Sekuen asam amino yang dideduksi dari ORF2 menunjukkan homologinya dengan protein domain GGDEF dari Magnetospirillum magnetotacticum MS-1 (identik 90%; kemiripan 95%) yang mempunyai fungsi dalam mekanisme transduksi sinyal. Gen atau operon ini diduga berfungsi selama proses sintesis magnetosom pada M. magneticum AMB-1.

Copyrights © 2009






Journal Info

Abbrev

biota

Publisher

Subject

Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology

Description

Biota: Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati merupakan jurnal ilmiah yang memuat hasil-hasil penelitian, kajian-kajian pustaka dan berita-berita terbaru tentang ilmu dan teknologi kehayatian (biologi, bioteknologi dan bidang ilmu yang terkait). Biota terbit pertama kali bulan Juli 1995 dengan ISSN ...