Molecular taxonomy via DNA barcodes for species identification in selected genera of Fabaceae

I Gusti Ayu Kusuma Wardani (Tropical Silviculture Study Program, Department of Silviculture, Faculty of Forestry and Environment, IPB University, IPB Dramaga Campus, Bogor, 16680, Indonesia)
Fitri Yola Amandita (Center for Standardization of Environmental Quality Instrument, Ministry of Environment and Forestry, Building 210 Center for Science and Technology Research Area, South Tangerang, 15314, Indonesia)
Carina Carneiro de Melo Moura (Forest Genetics and Tree Breeding, University of Göttingen, Germany)
Oliver Gailing (Forest Genetics and Tree Breeding, University of Göttingen, Germany)
Iskandar Z Siregar (IPB University)

Jurnal Pengelolaan Sumberdaya Alam dan Lingkungan (Journal of Natural Resources and Environmental Management)
Vol. 12 No. 1 (2022): Jurnal Pengelolaan Sumberdaya Alam dan Lingkungan (JPSL)

Fabaceae merupakan famili yang penting secara ekologi dan ekonomi karena manfaatnya yang tinggi sebagai sumber makanan, pupuk hijau, serta tanaman obat. Namun, di Indonesia Fabaceae telah dieksploitasi secara berlebihan di Indonesia dan beberapa spesies termasuk dalam kategori terancam punah. Untuk mendukung upaya konservasi dibutuhkan teknik identifikasi yang cepat dan akurat. Saat ini, identifikasi spesies melalui DNA barcode telah menjadi teknik klasifikasi taksonomi yang efektif. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi efektivitas penanda matK, rbcL, serta kombinasinya (matK+rbcL), sebagai DNA barcode dalam identifikasi spesies dari famili Fabaceae. Hasil penelitian menunjukkan bahwa matK+rbcL dan matK memiliki tingkat identifikasi tertinggi (90% dan 82,05%) pada tingkat spesies. Selain itu, matK memiliki rata-rata jarak interspesifik tertinggi (0.314) dan jarak intraspesifik (0.0030). Selanjutnya pohon filogenetik terbaik dihasilkan dengan metode Neighbour Joining. Berdasarkan analisis secara keseluruhan matK dan matK+rbcL merupakan barcode terbaik untuk spesies terpilih dalam penelitian ini.