Jurnal Pseudocode
Vol 1, No 2 (2014)

Implementasi Algoritma Smith–Waterman Pada Local Alignment Dalam Pencarian Kesamaan Pensejajaran Barisan DNA (Studi Kasus: DNA Tumor Wilms)

Ernawati Ernawati (Unknown)
Diyah Puspitaningrum (Universitas Bengkulu)
Ambar Pravitasari (Universitas Bengkulu)

Article Info

Publish Date
04 Feb 2015

Abstract

Pencarian kesamaan pensejajaran barisan DNA dengan menggunakan algoritma Smith – Waterman pada local alignment ini digunakan untuk mencari persentase kesamaan yang dihasilkan untuk mengetahui tingkat kesamaan pensejajaran 2 buah sekuen. DNA merupakan suatu makro molekul yang tersusun oleh nukleotida sebagai molekul dasar yang membawa sifat gen. Aplikasi pencarian kesamaan pensejajaran barisan DNA ini diharapkan dapat memberikan kemudahan dalam melakukan pensejajaran 2 buah sekuen  sehingga menampilkan tingkat kemiripan dari kedua sekuen DNA tersebut. Pada penelitian ini, sebagai masukannya menggunakan string barisan DNA yang di peroleh dari National Center for Biotechnology Information (www.ncbi.nlm.nih.gov) yang memiliki keluaran berupa persentase kesamaan serta lamanya waktu proses dijalankan.Kata kunci : local alignment, Smith – Waterman, DNA

Copyrights © 2014




Citation Download
RIS
EndNote, Reference Manager, ProCite
BibTex
Latex, Jabref
Full PDF
4604.999 KB
Original Source
Download Original
Google Scholar
Check in Google Scholar
Journal Info
Jurnal Pseudocode
Website

Abbrev

pseudocode

Publisher

Universitas Bengkulu

Subject

Computer Science & IT Control & Systems Engineering Decision Sciences, Operations Research & Management Electrical & Electronics Engineering

Description

Pseudocodeis a scientific journal in the information science family that contains the results of informatics research, scientific literature on informatics, and reviews of the development of theories, methods, and application of informatics engineering science. Pseudocode is published by the ...