Prosiding University Research Colloquium
Proceeding of The 16th University Research Colloquium 2022: Bidang MIPA dan Kesehatan

Pengaruh Spesifikasi Laptop terhadap Hasil Docking FlexAID pada Produk Alami dan Anti Diabetes

Broto Santoso (Universitas Muhammadiyah Surakarta)
Ratna Yuliani (Universitas Muhammadiyah Surakarta)
Y Yuliansah (Universitas Muhammadiyah Surakarta)
Mustaqim Alfarizky (Universitas Muhammadiyah Surakarta)
Diva Ratna Shabrina (Universitas Muhammadiyah Surakarta)
Dimas Satrio Utomo (Universitas Muhammadiyah Surakarta)
Rizkiananda Wardani (Universitas Muhammadiyah Surakarta)
Annisa Wifa Rizqi Madjid (Universitas Muhammadiyah Surakarta)
Monarita Puspita Dewi (Universitas Muhammadiyah Surakarta)
Naufal Farras (Universitas Muhammadiyah Surakarta)



Article Info

Publish Date
04 Jan 2023

Abstract

Laptop menjadi media komputasi yang portabel. FlexAID merupakan aplikasi docking berbasis PyMOL. Beberapa senyawa produk alami diujikan in silico pada target anti diabetes. Naskah ini ditujukan untuk menginformasikan hasil komputasi FlexAID antar laptop yang berbeda spesifikasi. FlexAID dalam aplikasi NRGSuite telah digunakan oleh 8 laptop dalam 3 kelompok protein dan ditambah 1 laptop yang sama dan disertakan di setiap kelompok dengan masing-masing 9 senyawa uji. Protein target, ligan, dan sistem docking adalah sama di setiap kelompok yang berbeda pada protein targetnya. Nilai RMSD native lebih dari 2 ditemukan pada 3 laptop di kelompok 3, namun laptop lainnya telah memenuhi nilai kesejajaran. Rentang nilai RSD (%) CF-score dan rasio secara berturut-turut untuk kelompok 1-3 adalah [3,66-25,25; 2,89-18,93], [2,44-37,35; 2,64- 35,94], dan [1,99-16,81; 4,26-16,97]. Perolehan RSD CF-score native masih di bawah 10% dimana nilai terendah didapati pada kelompok 2 sedangkan untuk 9 ligan setiap kelompok terdapat 2, 5 dan 6 senyawa yang berada di bawah nilai ini. Laptop dengan spesifikasinya mempunyai peranan penting dalam perhitungan docking FlexAID yang dimungkinkan pula dapat terjadi pada aplikasi lainnya yang serupa. Terdapat 2 senyawa potensial pada kelompok 1 dan 3 dengan nilai CF-score lebih baik dibandingkan dengan native.

Copyrights © 2022






Journal Info

Abbrev

proceeding

Publisher

Subject

Humanities Computer Science & IT Environmental Science Law, Crime, Criminology & Criminal Justice Medicine & Pharmacology

Description

University Research Colloquium (URECOL) merupakan forum seminar nasional yang memberikan kesempatan untuk diseminasi, diskusi, dan mendapatkan follow up atas luaran penelitian maupun pengabdian kepada ...