Jurnal Akuatiklestari
Vol 9 No 2 (2026): Jurnal Akuatiklestari

Identifikasi Molekuler dan Variasi Genetik Rumput Laut Halimeda sp. di Perairan Tapanuli Tengah, Sumatera Utara

Harya Bimasuci (Manajemen Sumber Daya Perairan, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara, Medan, Indonesia 20155)
Cecilya Novita Silaen (Manajemen Sumber Daya Perairan, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara, Medan, Indonesia 20155)
Astrid Fauzia Dewinta (Manajemen Sumber Daya Perairan, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara, Medan, Indonesia 20155)
Amanatul Fadhilah (Manajemen Sumber Daya Perairan, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara, Medan, Indonesia 20155)
Nur Rohim (Manajemen Sumber Daya Perairan, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara, Medan, Indonesia 20155)
Nurasiah Riza (Manajemen Sumber Daya Perairan, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara, Medan, Indonesia 20155)
Akhmad Rasyid Redha (Teknologi Budidaya Perikanan, Jurusan Ilmu Kelautan dan Perikanan, Politeknik Negeri Pontianak, Putussibau, Indonesia 78716)
Karla Amelia (Manajemen Sumberdaya Perairan, Fakultas Ilmu Kelautan dan Perikanan, Universitas Maritim Raja Ali Haji, Tanjungpinang, Indonesia 29111)



Article Info

Publish Date
29 May 2026

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies Halimeda di perairan Tapanuli Tengah menggunakan pendekatan morfologi dan molekuler dengan gen plastid tufA. Sampel yang dikumpulkan dari Pantai Batu Gajah, Pantai Pandaratan, dan Pulau Pane dianalisis berdasarkan ciri morfologis dan urutan DNA. Identifikasi morfologi menunjukkan bahwa Halimeda opuntia memiliki thallus berbentuk gumpalan padat dengan segmen reniform dan holdfast tipe sprawler, sementara Halimeda gigas memiliki thallus menggantung dengan segmen silindris dan holdfast tipe rock grower. Analisis molekuler melalui BLAST mengonfirmasi bahwa sampel menunjukkan kesamaan tinggi dengan spesimen referensi di GenBank, dengan query cover 95%-100%, percent identity 99,51%-100%, dan e-value 0.0, yang menunjukkan kesesuaian urutan DNA yang signifikan. Analisis filogenetik mengungkapkan dua klade utama, satu mewakili Halimeda opuntia dan satu lagi Halimeda gigas, dengan jarak genetik yang sangat rendah (0,000-0,005) dalam setiap spesies, sementara jarak genetik antar spesies mencapai 0,127. Penelitian ini menyimpulkan bahwa spesies Halimeda di Tapanuli Tengah yang diidentifikasi adalah H. opuntia dan H. gigas. Kedua spesies ini secara genetik terpisah dan dapat diidentifikasi secara akurat menggunakan penanda molekuler tufA.

Copyrights © 2026






Journal Info

Abbrev

akuatiklestari

Publisher

Subject

Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Environmental Science

Description

Akuatiklestari adalah jurnal ilmiah yang dikelola Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan, Universitas Maritim Raja Ali Haji yang diterbitkan secara elektronik. Akuatiklestari memiliki fokus pada isu isu Manajemen Sumberdaya Perairan seperti : biologi perikanan, ekologi perairan, pencemaran, ...