JURNAL INTEGRASI
Vol 2 No 2 (2010): Jurnal Integrasi Edisi Khusus (Seminar Nasional) - Juli 2010

Sequence Alignment Menggunakan Algoritma Smith Waterman

Inte Christinawati Bu'ulolo (Politeknik Informatika Del)
Nopelina Simamora (Politeknik Informatika Del)
Sabar Tampubolon (Politeknik Informatika Del)
Allan Pinem (Politeknik Informatika Del)



Article Info

Publish Date
05 Jul 2010

Abstract

Analisis terhadap data genetik dilakukan untuk mengetahui struktur dan fungsi data genetik tersebut. Analisis pada data genetik protein dapat dilakukan dengan melakukan penyejajaran sekuen (sequence alignment) yaitu proses menyejajarkan suatu sekuen dengan satu atau beberapa sekuen lain sehingga diperoleh tingkat kesamaan di antaranya (sequence similarity). Satu sekuen terdiri dari sejumlah simbol (residu) yang mewakili data genetik protein. Dalam proses alignment sejumlah sekuen-sekuen, dibutuhkan nilai konstanta kesamaan dan ketidaksamaan antara dua residu, sehingga dapat dihitung nilai kesamaan antar dua atau lebih sekuen tersebut. Pada makalah ini dibahas bagaimana melakukan sequence alignment pada sekuen protein menggunakan algoritma Smith-Waterman secara terkomputerisari, serta menentukan nilai konstanta yang digunakan untuk kesamaan dan ketidaksamaan residu.

Copyrights © 2010






Journal Info

Abbrev

JI

Publisher

Subject

Other

Description

Terbit dua kali setahun pada bulan April dan Oktober: mulai Volume 10, Nomor 1, April 2018. Berisi tulisan yang diangkat dari hasil penelitian di bidang Teknologi Terapan. e-ISSN: ...