cover
Article Per Year (5 Year)
All
Home Page
OAI Link
Editorial Team
Contact
Reviewer
Google Scholar
Contact Name
-
Contact Email
-
Phone
-
Journal Mail Official
-
Editorial Address
-
Location
Kota adm. jakarta pusat,
Dki jakarta
INDONESIA
Jurnal Biotek Medisiana Indonesia
Published by Badan Penelitian dan Pengembangan Kesehatan, Kementerian Kesehatan
ISSN : 23015810     EISSN : 23548800     DOI : -
Core Subject : Health,
Health Professions
Jurnal Biotek Medisiana Indonesia published 2 times a year. This journal is a medium of information and research results and development areas for non-communicable diseases and public health program managers, as well as a means of communication the researchers /enthusiasts in the field of non-communicable diseases and infectious.
Arjuna Subject : -
Articles 7 Documents
 1 
Search results for , issue " Vol 4, No 2 (2015)" : 7 Documents clear
Metode Nucleic Acid Test untuk Uji Saring Virus Hepatitis B pada Darah Donor dengan Hepatitis B Occult Suryani, Ulfah; Setiawaty, Vivi
Jurnal Biotek Medisiana Indonesia Vol 4, No 2 (2015)
Publisher : Puslitbang Biomedis dan Teknologi Dasar Kesehatan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22435/jbmi.v4i2.5123.51-58

Abstract

HBsAg is the primary screening at the Blood Transfusion Unit (UTD) in Indonesia. Blood with HBsAg negative still have potential to transmit the Hepatitis B Virus (HBV) infection. To improve blood safety, examination needs to be done is the detection of HBV DNA in window period. This study aim to determine the NAT can detect HBV DNA positive in blood donors with Occult Hepatitis B (HBO). A cross-sectional study on 4973 blood samples from the donor 4 UTD: DKI Jakarta, Tangerang district and municipality, Depok. Examination of HBsAg, anti - HBc, anti - HBs done UTD while NAT, quantitative and qualitative PCR, performed at the Eijkman Institute for Molecular Biology . Quantitative and qualitative PCR performed to measure viral load that is used as a confirmation of HBV were detected by the method of NAT. A 20 of 4973 subjects (0.4%) had negative results and NAT multiplex HBsAg positive. 16 of the 20 subjects of HBsAg negative and positive discriminatory NAT. Results of the examination of anti-HBc anti-HBs negative and positive / negative feedback only one subject (6.25%), 9 samples positive anti-HBc and anti-HBs negative (56.25%), the results of anti-HBc and anti- HBs positive 5 samples (31.25%). The results of qualitative and quantitative PCR obtained three samples (18.75%) are not detectable, 6 (37.5%) samples showed results of a high viral load and 7 samples (43.75%) showed low detection. The NAT assay which was performed as a screening of donor blood parameters are effective to detect HBV DNA in blood donors with HBO.Key words. Hepatitis B occult, Nucleic Acid Test, Blood DonorAbstrakHBsAg merupakan pemeriksaan utama di Unit Transfusi Darah (UTD) di Indonesia. Darah HBsAg negatif masih berpotensi menularkan infeksi Virus Hepatitis B (VHB). Untuk meningkatkan keamanan darah, perlu dilakukan pemeriksaan yang dapat mendeteksi DNA VHB pada window period. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pemeriksaan Nucleic Acid Test (NAT) dalam mendeteksi DNA VHB pada darah donor dengan Hepatitis B Occult (HBO). Penelitian potong lintang terhadap 4973 sampel darah donor dari 4 UTD, yaitu DKI Jakarta, kota dan kabupaten Tangerang, kota Depok. Pemeriksaan HBsAg, anti-HBc, anti-HBs dilakukan UTD sedangkan NAT, PCR kuantitatif dan kualitatif, dilakukan di Lembaga Biologi Molekuler Eijkman. Pemeriksaan PCR kuantitatif dan kualitatif dilakukan untuk menghitung viral load yang digunakan sebagai konfirmasi VHB yang berhasil dideteksi dengan metode NAT. Sebanyak 20 dari 4973 subjek (0,4%) mempunyai hasil HBsAg negatif dan NAT multipleks positif. 16 dari 20 subyek HBsAg negatif dan NAT discriminatory positif. Hasil pemeriksaan anti-HBc negatif dan anti-HBs positif/negatif didapatkan hanya satu subyek (6,25%), 9 sampel anti-HBc positif dan anti-HBs negatif (56,25%), hasil pemeriksaan anti-HBc dan anti-HBs positif 5 sampel (31,25%). Hasil pemeriksaan PCR kualitatif dan kuantitatif didapatkan 3 sampel (18,75%) tidak terdeteksi, 6 (37,5%) sampel menunjukkan hasil viral load yang tinggi dan 7 sampel (43,75%)menunjukkan low detection. Pemeriksaan NAT sebagai parameter uji saring darah donor efektif untuk mendeteksi DNA VHB pada darah donor dengan HBO.Kata kunci: Hepatitis B Occult, Nucleic Acid Test, Donor Darah
Morbiditas dan Multi Morbiditas Pada Kelompok Lanjut Usia di Indonesia Anorital, Anorital
Jurnal Biotek Medisiana Indonesia Vol 4, No 2 (2015)
Publisher : Puslitbang Biomedis dan Teknologi Dasar Kesehatan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22435/jbmi.v4i2.5124.77-88

Abstract

AbstractThe increasing elderly population in Indonesia has been predicted long ago.It causes a public health problem particularly the high rate of morbidity and multi-morbidity. The results of Basic Health Research (Riskesdas) 2007 and 2013, showed six common non-communicable diseases among the elderly such as diabetes mellitus, hypertension, coronary heart disease, stroke, rheumatoid arthritis, mental and emotional disorders. In addition, four infectious diseases predominantly among the elderly, they were acute respiratory infections, pneumonia, tuberculosis, and diarrhea. Both the high morbidity infectious and non-infectious diseases also indicated a multi-morbidity among the elderly. The Riskesdas 2007 results showed only 13% of healthy elderlywere healthy, 34.8% of them suffered from one disease, and 52.2% had two or more diseases (multiple morbidity). Multiple morbidity resulted elderly people in more suffering condition, decreased their life qualityand increased their mortality, and in a broader scope lead to their social and economic burden. Principal efforts overcoming the problem of multi-morbidity is to change policy of elderly health care particularly in theequity and continuity of elderly program in primary health care centers.Keyword: Multi Morbidity, Ageing, GeriatriAbstrakMeningkatnya populasi lansia di Indonesia sudah diprediksi sejak jauh hari. Adanya peningkatan jumlah populasi lansia menimbulkan masalah kesehatan masyarakat yaitu tingginya angka morbiditas dan multi morbiditas. Dari hasil Riskesdas 2007 dan 2013, diketahui ada 6 penyakit tidak menular yaitu diabetes mellitus, hipertensi, jantung koroner, strok, penyakit sendi, dan gangguan mental emosional yang umum terjadi padalansia. Selain ke 6 penyakit tersebut di atas, diketahui juga ada 4 penyakit menular yaitu ISPA, pneumonia,tuberkulosis, dan diare. Tingginya angka morbiditas penyakit menular dan tidak menular juga mengindikasikan adanya multi morbiditas pada lansia. Dari hasil Riskesdas 2007 hanya 13% lansia yang sehat, 34,8% menderitasatu jenis penyakit, dan 52,2% menderita dua jenis penyakit atau lebih (multi morbiditas). Multi morbiditas mengakibatkan lansia semakin menderita, kualitas hidup menurun dan tingkat mortalitas pun meningkat, dalam lingkup yang lebih luas menimbulkan beban sosial dan ekonomi. Upaya pokok penanggulangan masalah multi morbiditas adalah dengan adanya perubahan kebijakan terhadap pelayanan kesehatan lansia yang dilakukan secara merata dan berkesinambungan di sentra pelayanan kesehatan dasar.Kata Kunci: Multi Moribiditas, Lanjut Usia, Geriatri
Analisis Struktur Protein Selubung Virus Dengue Serotipe 3 Pada Genotipe Yang Sama Dengan Clade Berbeda Herman, Reni; Putri, Dwi Hilda
Jurnal Biotek Medisiana Indonesia Vol 4, No 2 (2015)
Publisher : Puslitbang Biomedis dan Teknologi Dasar Kesehatan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22435/jbmi.v4i2.5125.43-50

Abstract

Abstract Dengue viruses (DENV) consist of 4 serotypes and each of serotype is divided in several genotypes based on the envelope gene. To find the different in protein structure of  DENV-3 circulated in Surabaya, we conduct analysis of  two sequences of DENV-3 genotype 1 in different clade.  Information of nucleotide and amino acid were searched from the GeneBank, homology were analysed using BLAST in NCBI. The different of amino acid of 2 sequences and protein structure were analysed using software Bioedit vs 7.2.5 and PyMol respectively. We found six amino acid residu that are different in these sequences.   Three of amino acids of  the different sequences have significant different similarities. These amino acid residu are 140, 340 and 362.  Based on physic-chemistry properties, these amino acids are more hydrophobic in sequence of clade 2. 3D prediction of protein structure show that residu 140, 340, 362 and 386 have different surface protein. Physic-chemistry properties and charge of amino acid causing different 3D structure of DENV-3 envelope protein. Key words: Dengue virus, Envelope Gene,Pprotein Structure Abstrak Virus dengue (DENV) terdiri dari 4 serotipe. Masing-masing serotipe masih dibagi lagi menjadi beberapa genotipe berdasarkan gen selubung virus, karena variasi genetik terbanyak ada pada gen ini. Analisis ini membandingkan dua runutan nukleotida dan asam amino DENV-3 dengan genotipe sama namun pada clade yang berbeda, yang bersirkulasi di Surabaya. Informasi sekuen gen maupun protein diperoleh melalui situs GenBank (NCBI), analisis homologi menggunakan situs yang sama. Perbedaan  residu asam amino diidentifikasi menggunakan software Bioedit vs 7.2.5, sifat variasi asam amino diprediksi menggunakan program pada situs ExPASy. Kemiripan asam amino dinilai dengan menggunakan scoring Blosum dan prediksi struktur permukaan protein selubung ditentukan menggunakan perangkat lunak PyMOL. Perbedaan susunan asam amino kedua sekuen yang dianalisis terdapat pada 6 residu dengan posisi sekuen pada clade 1 dan 2 berturut-turut sebagai berikut, S140I, V141I, E340G, P362L, K386R, dan I412L. Tiga dari residu ini memiliki perbedaan yang cukup bermakna, yaitu pada 140, 340 dan 362. Sekuen pada clade 2 ketiga residu ini lebih bersifat non polar dan hirofobik dibandingkan pada sekuen clade 1. Sementara prediksi 3D memperlihatkan adanya perbedaan struktur permukaan pada residu140, 340, 362  dan 386. Perbedaan sifat maupun muatan asam amino memberikan perbedaan  struktur 3D protein selubung DENV-3.   Kata sandi: DENV-3, Protein Selubung, Struktur Protein  
Tinjauan Farmakogenomik Rifampisin Dalam Pengobatan Tuberkulosis Paru Sampurno, Ondri Dwi
Jurnal Biotek Medisiana Indonesia Vol 4, No 2 (2015)
Publisher : Puslitbang Biomedis dan Teknologi Dasar Kesehatan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22435/jbmi.v4i2.5126.59-70

Abstract

Abstract Pharmacogenomics is the study of genetic influences of individual variations in drug response. The influence of genetic in drug response has been showed about 20%–95% of variations in drug pharmacokinetics and effects. Activity of rifampicin as bactericidal  against Mycobacterium tuberculosis (M.tb.) have been demonstrated plasma concentration-dependent. ‘Concentration-dependent ’ means that increasing doses followed by increasing rifampicin plasma concentration above the M.tb’s minimum inhibition concentration (MIC) induces more rapid bactericidal effect against the M.tb. indicated by sputum conversion. On standard tuberculosis therapy, among patients have been showed wide intersubject variation of rifampicin plasma concentration. The variation was related to genetic difference among patients. Rifampicin is a substrate of  organic anion transporting polypeptide 1B1 (OATP1B1) which is expressed on the sinusoidal membrane of human hepatocytes.  OATP1B1 is coded by for the solute carrier organic anion 1B1 (SLCO1B1) gene. A large number of sequence variants have been found in the SLCO1B1 gene. SLCO1B1 rs4149032 and c.463 C>A was present in most patients pulmonary tuberculosis and was associated with substantially reducing  rifampicin plasma concentration.The allele frequency of the SLCO1B1 c.463 C>A polymorphism in Indonesian subject was showed C 30% A 70%. Individual genetic variation may cause variation in individual rifampicin response among individual pulmonary tuberculosis patient. It will impact variation in clinical outcome, in this case is sputum conversion. Key words: Pharmacogenomic, Rifampicin, Tuberculosis Abstrak Farmakogenomik adalah ilmu yang mempelajari pengaruh genetik terhadap variasi antar individu pada respon obat. Pengaruh genetik tiap individu terhadap respon obat ditunjukkan dengan adanya variasi berkisar 20--95% pada peruraian obat dalam tubuh dan efeknya. Efektivitas rifampisin sebagai bakterisida terhadap Mycobacterium tuberculosis (M.tb.) sangat bergantung pada konsentrasi rifampisin dalam plasma. Peningkatan dosis akan diikuti dengan peningkatan konsentrasi rifampisin dalam plasma di atas konsentrasi hambat minimal (MIC) M.tb dapat menginduksi lebih cepat efek bakterisida terhadap M.tb dan diindikasikan dengan outcome klinis (konversi dahak). Pada standar terapi tuberkulosis,  konsentrasi rifampisin dalam plasma antar pasien TB menunjukkan variasi yang lebar. Variasi antar pasien ini erat kaitannya dengan perbedaan genetik dari masing-masing pasien tersebut. Rifampisin merupakan substrat dari protein polipeptida transporter organik anion (OATP1B1) yang diekspresikan pada membran sinusoidal hepatosit.  Gen solute carrier organic anion 1B1 (SLCO1B1) merupakan gen penyandi OATP1B1 dan diketahui terdapat  variasi urutan gen. SLCO1B1 rs4149032 dan c.463 C>A  dijumpai pada sebagian besar pasien tuberkulosis paru dan berhubungan dengan penurunan kadar rifampisin dalam plasma. Pada subyek Indonesia menunjukkan adanya polimorfisme gen SLCO1B1 SNP c.463C>A dengan frekuensi C 30% dan A 70%. Variasi genetik antar individu ini diduga dapat menyebabkan variasi respon rifampisin antar individu pasien tuberkulosis paru yang berdampak adanya variasi outcome klinis, dalam hal ini konversi dahak. Kata kunci: Farmakogenomik, Rifampisin, Tuberkulosis
Karakteristik Pekerjaan pada Kasus Human Immunodeficiency Virus-1 dan Subtipenya di Tujuh Provinsi di Indonesia pada tahun 2011 Roselinda, Roselinda; Wibowo, Holy Arif; Setiawaty, Vivi
Jurnal Biotek Medisiana Indonesia Vol 4, No 2 (2015)
Publisher : Puslitbang Biomedis dan Teknologi Dasar Kesehatan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22435/jbmi.v4i2.5127.71-76

Abstract

Abstract HIV-1 sociodemographic factors and distribution are different among regions. Some jobs are at risk for contracting the disease. The purpose of the analysis is to look at the characteristics of the occupation in the case of HIV-1 in several provinces in Indonesia. Data were analyzed based on a survey of HIV-1 virus genotypes in 7 provinces in Indonesia in 2011. Respondents were selected purposively from cases of HIV / AIDS who visited the clinic Voluntary Care and Treatment (VCT) in seven provinces (North Sumatra, West Sumatra, Kepulauan Riau, South Sulawesi, North Sulawesi, Maluku and Papua). Data and specimen were collected by conducting laboratory examination and also interviews wearing a structured questionnaire. The highest proportion of cases of HIV-1 is the housewife/jobless (50.8%), and the highest is found in Papua province (92,9%). Private sector (13,3%) the highest is in North Sumatra (35,7%), Businessmen (16,9%) the highest is in Riau Island (32,9%), the Labor (11.4%) the highest is in North Sulawesi, Civil worker (3.9%) is the highest in North Sulawesi and Maluku(10%), and sexual workers (3.7%) is the highest in Riau Islands (11,4%). Meanwhile proportion of HIV-1 subtype CRF01-AE cases higher in the male,, in age group 15-30 years, in bachelor education level and in private sector. The housewife and jobless included in this group is a very vulnerable to contracting HIV-1, and it should receive attention in improving knowledge about the disease, gender equality in disease control. Key words: HIV-1, Occupations, Indonesia Abstrak Faktor sosiodemografi HIV-1 dan distribusinya  berbeda antar daerah. Beberapa pekerjaan mempunyai risiko untuk tertular penyakit ini. Tujuan analisis ialah untuk melihat karakteristik pekerjaan pada kasus HIV-1 dan subtipenya pada beberapa provinsi di Indonesia. Data yang dianalisis berasal dari survei genotipe virus HIV-1 di 7 Provinsi di Indonesia tahun 2011. Responden dipilih secara purposif dari kasus HIV/AIDS yang mengunjungi klinik Perawatan Sukarela dan Pengobatan (VCT) di tujuh provinsi (Sumatera Utara, Sumatera Barat, Kepulauan Riau, Sulawesi Selatan, Sulawesi Utara,Maluku, dan Papua). Data dan spesimen dikumpulkan dengan melakukan pemeriksaan laboratorium serta wawancara memakai kuesioner terstruktur. Proporsi terbanyak kasus HIV-1 adalah kelompok ibu rumah tangga/tidak mempunyai pekerjaan (50,8%), dan jika dilihat per propinsi ditemukan tertinggi di Papua (92,9%).  Wiraswasta (13,3%) tertinggi Sumatera Utara (35,7%), swasta (16,9%) tertinggi di Kepulauan Riau (32,9%),  buruh (11,4%)  tertinggi di Sulawesi Utara (18,6%), pegawai negri sipil (3,9%) tertinggi di Sulawesi Utara dan Maluku (10%), dan wanita penjaja seks (3,7%) tertinggi di Kepulauan Riau (11,4%). Sementara proporsi kasus HIV-1 subtipe CRF01-AE lebih banyak pada kelompok laki-laki, umur 15-30 tahun, berpendidikan akademi dan pekerjaan wiraswasta. Kelompok ibu rumah tangga dan tidak bekerja termasuk kedalam kelompok ini merupakan kelompok yang sangat rentan tertular penyakit HIV-1, perlu mendapat perhatian peningkatan pengetahuan tentang penyakit dan kesetaraan gender dalam pengendalian penyakit. Kata kunci: HIV-1, Pekerjaan, Indonesia
Determinan Hipertensi di Puskesmas dan RSUD Kabupaten Natuna Andayasari, Lelly; Opitasari, Cicih
Jurnal Biotek Medisiana Indonesia Vol 4, No 2 (2015)
Publisher : Puslitbang Biomedis dan Teknologi Dasar Kesehatan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22435/jbmi.v4i2.5128.89-98

Abstract

Abstract The result of (Basic Health Research) in 2007 showed that the highest prevalence. To describe the hypertension patients in Public Health Centre and in District Hospital in Natuna.The study used cross sectional design. The samples were collected from  all hypertension patients medical records in three Public Health Centre (Pulau Tiga, Sedanau and Ranai) and one  hospital (RSUD Natuna) during the periode of  January 1 to  December 31, 2012. Univariate analysiwas used to describe the patient’s characteristics.The 423 samples were collected from three Public Health Centre and district hospital. The  proportion of hypertension in Public Health Centre and distric hospital was 73.5% and 26.5% respectively. The highest proportion of hypertension was found in female, married, low education, and unemployed subjects, both of Public Health Centre and district hospital. The youngest age was 28 years old, while the oldest was 92 years old with the average was 57 years old. The proportion of stage 2 hypertension were 62.1% in Public Health Centre and 81.2% in district hospital. The higest proportion of comorbid diseases that become end point of hypertension in the district hospital was stroke (41,1%), cardiac enlargement/ left ventricular hypertrophy/ LVH (19.6%), coronary heart disease/ CHD (9.8%). The highest proportion of risk factors that was found along with hypertension were hypercholesterolemia (20.5%) and diabetes (10.7%). Most of hypertension patients were in stage 2 category. Hypercholesterolemia and diabetes were more common risk factors to be found along with hypertension, furthermore stroke, cardiac enlargement/ LVH (19.6%) and CHD were the most common cardiovascular disease. Prevention of hypertension, screening and hypertension management to reduce hypertension complication need to be increased Keywords: Hypertension, Public Health Centre, District Hospital, Natuna District Abstrak Berdasarkan hasil Riskesdas 2007 prevalensi hipertensi di Kabupaten Natuna tertinggi di Indonesia mendeskripsikan penderita hipertensi di Puskesmas dan di RSUD di Kabupaten Natuna.Penelitian ini menggunakan rancangan cross sectional. Sampel adalah semua pasien hipertensi yang datang ke Puskesmas (Puskesmas Pulau Tiga, Sedanau dan Ranai) dan RSUD Natuna pada periode 1 Januari—31 Desember 2012. Data dikumpulkan dari rekam medik penderita hipertensi kemudian dipindahkan ke dalam formulir pengumpulan data.  Sebanyak 423 sampel diperoleh dari tiga puskesmas dan RSUD. Proporsi  hipertensi  di Puskemas  sebesar 73,5%  dan di RSUD 26,5%. Proporsi hipertensi terbanyak  ditemukan pada perempuan,  status menikah, tingkat pendidikan rendah  dan  tidak bekerja di Puskesmas maupun di RSUD.  Umur terendah pasien hipertensi adalah 28 tahun dan tertinggi  92  tahun dengan  median 57 tahun.  Pasien dengan hipertensi stage 2 didapatkan paling banyak  yaitu  Puskesmas 62,1% dan  RSUD  81,2%.  Proporsi penyakit  penyerta di RSUD terbanyak  adalah stroke 41,1% diikuti dengan pembesaran jantung 19,6% dan jantung koroner 9,8%.Penderita hipertensi paling banyak berada dalam kategori stage 2. Faktor risiko bersama hipertensi terbanyak adalah hiperkolesterol, dan diabetes sedangkan stroke, pembesaran jantung dan jantung koroner merupakan komplikasi kardiovaskuler terbanyak yang ditemukan. Upaya pencegahan dalam menurunkan kejadian hipertensi perlu ditingkatkan, begitu pula dengan deteksi dini dan penanganan hipertensi yang tepat untuk mengurangi komplikasi hipertensi.   Kata kunci: Hipertensi, Puskesmas, RSUD
Analisis Struktur Protein Selubung Virus Dengue Serotipe 3 Pada Genotipe Yang Sama Dengan Clade Berbeda Herman, Reni; Putri, Dwi Hilda
Jurnal Biotek Medisiana Indonesia Vol 4, No 2 (2015)
Publisher : Puslitbang Biomedis dan Teknologi Dasar Kesehatan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22435/jbmi.v4i2.5132.43-50

Abstract

Abstract Dengue viruses (DENV) consist of 4 serotypes and each of serotype is divided in several genotypes based on the envelope gene. To find the different in protein structure of  DENV-3 circulated in Surabaya, we conduct analysis of  two sequences of DENV-3 genotype 1 in different clade.  Information of nucleotide and amino acid were searched from the GeneBank, homology were analysed using BLAST in NCBI. The different of amino acid of 2 sequences and protein structure were analysed using software Bioedit vs 7.2.5 and PyMol respectively. We found six amino acid residu that are different in these sequences.   Three of amino acids of  the different sequences have significant different similarities. These amino acid residu are 140, 340 and 362.  Based on physic-chemistry properties, these amino acids are more hydrophobic in sequence of clade 2. 3D prediction of protein structure show that residu 140, 340, 362 and 386 have different surface protein. Physic-chemistry properties and charge of amino acid causing different 3D structure of DENV-3 envelope protein. Key words: Dengue virus, Envelope Gene,Pprotein Structure Abstrak Virus dengue (DENV) terdiri dari 4 serotipe. Masing-masing serotipe masih dibagi lagi menjadi beberapa genotipe berdasarkan gen selubung virus, karena variasi genetik terbanyak ada pada gen ini. Analisis ini membandingkan dua runutan nukleotida dan asam amino DENV-3 dengan genotipe sama namun pada clade yang berbeda, yang bersirkulasi di Surabaya. Informasi sekuen gen maupun protein diperoleh melalui situs GenBank (NCBI), analisis homologi menggunakan situs yang sama. Perbedaan  residu asam amino diidentifikasi menggunakan software Bioedit vs 7.2.5, sifat variasi asam amino diprediksi menggunakan program pada situs ExPASy. Kemiripan asam amino dinilai dengan menggunakan scoring Blosum dan prediksi struktur permukaan protein selubung ditentukan menggunakan perangkat lunak PyMOL. Perbedaan susunan asam amino kedua sekuen yang dianalisis terdapat pada 6 residu dengan posisi sekuen pada clade 1 dan 2 berturut-turut sebagai berikut, S140I, V141I, E340G, P362L, K386R, dan I412L. Tiga dari residu ini memiliki perbedaan yang cukup bermakna, yaitu pada 140, 340 dan 362. Sekuen pada clade 2 ketiga residu ini lebih bersifat non polar dan hirofobik dibandingkan pada sekuen clade 1. Sementara prediksi 3D memperlihatkan adanya perbedaan struktur permukaan pada residu140, 340, 362  dan 386. Perbedaan sifat maupun muatan asam amino memberikan perbedaan  struktur 3D protein selubung DENV-3. Kata sandi: DENV-3, Protein Selubung, Struktur Protein  

Page 1 of 1 | Total Record : 7

 1 

Filter by Year

2015 2015


Reset
Filter By Issues
All Issue Vol 5, No 2 (2016): : Vol 5, No 1 (2016) Vol 4, No 2 (2015) Vol 4, No 1 (2015) Vol 3, No 2 (2014) Vol 3, No 1 (2014) Vol 2, No 2 (2013) Vol 2, No 1 (2013) Vol 1, No 2 (2012) Vol 1, No 1 (2012) Vol 1, No 1 (2009) More Issue