This Author published in this journals
All Journal Jurnal Perikanan
Rozi Gunanti Mahasri
Unknown Affiliation

Published : 1 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search

DETEKSI DAN KARAKTERISASI GEN HEMOLISIN (hlyA) Aeromonas hydrophila DAN PREDIKSI EPITOP SEL T DAN B PADA IKAN GURAMI (Osphronemus gouramy) Raden Roro Salma Hayaah Megantari; Rozi Gunanti Mahasri
Vol 16 No 1 (2026): JURNAL PERIKANAN
Publisher : Universitas Mataram

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.29303/jp.v16i1.2131

Abstract

Konsumsi ikan di Indonesia terus mengalami peningkatan seiring dengan target nasional mencapai 59 kg/kapita, menjadikan ikan gurami sebagai salah satu komoditas budidaya penting. Namun, produksi gurami menghadapi tantangan serius akibat tingginya kerentanan terhadap penyakit, khususnya Motile Aeromonas Septicemia (MAS) yang disebabkan oleh Aeromonas hydrophila. Bakteri ini memiliki tingkat virulensi tinggi yang dipengaruhi oleh berbagai faktor patogenik, salah satunya enzim dan toksin hemolisin (hlyA) yang berperan dalam melisis sel darah merah, memicu nekrosis jaringan, dan memperparah infeksi. Upaya pengendalian penyakit dapat dilakukan secara organik maupun anorganik, namun pengembangan vaksin berbasis bioinformatika menjadi pendekatan yang menjanjikan dengan menargetkan gen virulensi seperti hemolisin. Penelitian ini merupakan penelitian laboratorium dengan pendekatan observasional deskriptif. Sampel diperoleh dari ikan gurami yang diduga terinfeksi MAS dan dianalisis melalui tahapan isolasi bakteri, pemurnian, serta uji biokimia. DNA bakteri kemudian diekstraksi dan gen hemolisin diamplifikasi menggunakan metode PCR dengan primer spesifik. Produk PCR dianalisis melalui elektroforesis dan disekuensing menggunakan metode Sanger. Analisis homologi dilakukan menggunakan BLAST, sementara hubungan filogenetik dianalisis dengan perangkat lunak MEGA11. Selain itu, prediksi epitop imunogenik dilakukan menggunakan perangkat bioinformatika berbasis IEDB. Hasil penelitian menunjukkan keberadaan gen hlyA dengan ukuran 592 bp pada isolat A. hydrophila. Analisis homologi menunjukkan tingkat kesamaan 98–100% dengan tujuh strain dari GenBank, serta hubungan filogenetik yang erat dengan strain asal India dan Cina. Prediksi epitop menghasilkan tujuh kandidat terbaik untuk sel B, serta 30 epitop MHC II dan 10 epitop MHC I yang bersifat antigenik, non-alergenik, tidak toksik, dan larut air. Temuan ini menunjukkan potensi gen hemolisin sebagai kandidat vaksin berbasis bioinformatika untuk pengendalian MAS pada ikan gurami.