Ikan sebelah (Psettodes erumei) merupakan spesies yang diklasifikasikan sebagai kekurangan data (data deficient) dalam IUCN Red List. Identifikasi spesies yang akurat merupakan prasyarat penting bagi pengelolaan perikanan yang berkelanjutan serta konservasi keanekaragaman hayati. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies ikan sebelah yang berasal dari perairan Cilacap, Indonesia, melalui pendekatan integratif morfologi dan molekuler. Empat spesimen dikumpulkan pada Maret dan Juni 2025 untuk dianalisis menggunakan pendekatan terpadu morfologi dan molekuler. Identifikasi morfologi didasarkan pada analisis morfometrik dan meristik terperinci, yang diverifikasi ulang dengan panduan taksonomi standar. Identifikasi molekuler melibatkan ekstraksi DNA, amplifikasi PCR gen Cytochrome C Oxidase Subunit I (COI) mitokondria, elektroforesis, sekuensing, dan perbandingan dengan basis data genetik global menggunakan BLAST. Karakteristik morfologi selaras dengan deskripsi P. erumei, meskipun perbedaan morfometrik yang signifikan dari referensi historis mengindikasikan potensi variasi fenotipik lokal. Barcoding DNA mengonfirmasi identitas dengan kemiripan sekuens 100% terhadap konspesifik dari wilayah Indo-Pasifik lainnya (aksesi GenBank: PX599017.1). Analisis filogenetik lebih lanjut menempatkan sampel dari Cilacap ke dalam kluster genetik yang homogen dari P. erumei di seluruh perairan Indonesia. Hasil penelitian ini memberikan kontribusi pada basis data keanekaragaman hayati dan pustaka DNA barcoding Indonesia untuk spesies yang dieksploitasi secara komersial namun kurang dipelajari. Penelitian ini juga menyediakan data dasar esensial untuk menginformasikan kajian stok dan strategi konservasi di wilayahnya.