Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2021 - 2026
0.23
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Sinergi : Jurnal Ilmiah Multidisiplin
Abdurrahman Ilyas Al Muflih
Universitas Padjadjaran, Sumedang, Indonesia
Aerospace Engineering Humanities Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Education Environmental Science Health Professions Immunology & microbiology Physics Social Sciences

Published : 1 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search

 1 
Pemanfaatan Pemodelan Struktur Protein dan Simulasi Dinamika Molekuler dalam Menganalisis Dampak Mutasi terhadap Struktur dan Stabilitas Protein: Suatu Tinjauan Abdurrahman Ilyas Al Muflih
Sinergi : Jurnal Ilmiah Multidisiplin Vol. 2 No. 8 (2026): Sinergi: Jurnal Ilmiah Multidisiplin
Publisher : PT. AHLAL PUBLISHER NUSANTARA

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.66914/gxg84y27

Abstract

Mutasi asam amino dapat mengubah interaksi molekuler dan memengaruhi struktur, dinamika, serta stabilitas protein, tetapi dampaknya tidak selalu dapat dijelaskan melalui struktur statis. Tinjauan ini bertujuan mengkaji pemanfaatan pemodelan struktur protein dan simulasi dinamika molekuler untuk menganalisis konsekuensi mutasi pada tingkat molekuler. Kajian dilakukan melalui penelusuran dan sintesis literatur mengenai pemodelan struktur protein, prinsip simulasi dinamika molekuler, serta parameter analisis trajektori. Hasil kajian menunjukkan bahwa pemodelan struktur memberikan konteks spasial untuk mengidentifikasi perubahan pada residu dan lingkungan strukturalnya, sedangkan simulasi dinamika molekuler memungkinkan perubahan konformasi dan interaksi protein ditelusuri sepanjang waktu. Analisis RMSD, RMSF, Rg, struktur sekunder, SASA, hydrogen bond, jarak antarresidu, DCCM, dan PCA memberikan informasi yang saling melengkapi mengenai perubahan struktur dan dinamika protein. Integrasi kedua pendekatan tersebut dapat digunakan untuk menelusuri hubungan antara perubahan urutan asam amino, reorganisasi struktur dan interaksi molekuler, serta perubahan dinamika protein yang berkaitan dengan stabilitas dan fungsi biologis.   Kata kunci: mutasi protein; pemodelan struktur; dinamika molekuler; stabilitas protein; analisis struktural.
Co-Authors