Ekstraksi karagenan secara konvensional umumnya menggunakan larutan alkali, seperti kalium hidroksida (KOH), yang dapat menghasilkan limbah selama pengolahan. Deep Eutectic Solvent (DES) berbasis choline chloride–glycerol dikaji sebagai alternatif pelarut untuk ekstraksi karagenan rumput laut. Penelitian ini bertujuan mengoptimalkan ekstraksi karagenan dari Gracilaria verrucosa menggunakan Response Surface Methodology (RSM) dengan Box–Behnken Design (BBD). Variabel yang dikaji meliputi waktu ekstraksi, rasio DES terhadap bahan, dan ukuran partikel, dengan rendemen dan kadar sulfat sebagai respons. Karakteristik gugus fungsi dianalisis menggunakan Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR). Berdasarkan 15 percobaan, rendemen berkisar antara 62,62–91,95% dan kadar sulfat antara 3,4–4,6%. Model rendemen tidak signifikan (p = 0,192), sedangkan model kadar sulfat signifikan (p = 0,003). Kondisi optimum prediksi diperoleh pada waktu ekstraksi 2,899 jam, rasio DES 0,10, dan ukuran partikel 29,697 mesh. Pengujian pada kondisi aktual, yaitu waktu ekstraksi 3 jam, rasio DES 0,10, dan ukuran partikel 20 mesh, menghasilkan rendemen 86,4% dan kadar sulfat 4,601%. Spektrum FTIR menunjukkan pita serapan sekitar 1034 dan 856 cm⁻¹, sedangkan pita sekitar 930 cm⁻¹ tidak terlihat jelas. Jenis karagenan yang dihasilkan belum dapat ditentukan secara pasti berdasarkan FTIR sehingga diperlukan analisis lanjutan. Penelitian ini memberikan dasar awal untuk mengkaji penggunaan DES choline chloride–glycerol dalam ekstraksi karagenan. Kondisi optimum prediksi juga memerlukan validasi eksperimental.