Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
0.23
P-Index
This Author published in this journals
All Journal JURNAL PESISIR DAN LAUT TROPIS BULETIN OSEANOGRAFI MARINA
Tindi, Monalisa
Unknown Affiliation
Earth & Planetary Sciences

Published : 2 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search

 1 
DNA Barcode dan analisis filogenetik molekuler beberapa jenis bivalvia asal perairan Sulawesi Utara berdasarkan gen COI Tindi, Monalisa; Mamangkey, N. Gustaf F.; Wullur, Stenly
JURNAL PESISIR DAN LAUT TROPIS Vol 5, No 2 (2017): JURNAL PESISIR DAN LAUT TROPIS
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.35800/jplt.5.2.2017.15050

Abstract

Identifikasi Bivalvia hanya berdasarkan karakter morfologi sangat rentan terhadap kesalahan identifikasi karena adanya persamaan bentuk dan warna. Studi ini menggunakan DNA barcode sebagai alat untuk identifikasi molekuler spesies. Meskipun kepulauan Indo-Malay merupakan diversitas terbesar dari spesies laut, studi mengenai struktur genetik dan filogenetik dari organisme laut dalam daerah ini masih jarang terutama di Sulawesi Utara. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mendapatkan komposisi DNA dari gen COI dan juga untuk mengeksplore kemungkinan dari penggunaan penanda molekuler untuk analisis filogenetik dan identifikasi spesies kerang mutiara. Sekuens COI bivalvia diamplifkasi menggunakan PCR dan untuk analisis filogenetik molekuler menggunakan metode Neighbor joining. Hasil menunjukkan bahwa specimen KM 10 yang dikoleksi dari pantai Arakan merupakan spesies Atrina vexillum karena memiliki tingkat kemiripan dari Bank gen NCBI sebesar 99%. Terdapat 63 situs mutasi yang terdiri dari 26 situs insersi, 36 situs delesi dan 1 situs transversi. Fragment hasil amplifikasi sebesar 681bp, perputaran antara setengah sekuens dari primer COI yaitu LCO1490 dan HCO2198. Atrina vexillum yang berasal dari Sulawesi Utara merupakan polifiletik dengan spesies Atrina vexillum dari China dan Jepang. Sebagai tambahan, penelitian ini juga menyediakan informasi berharga mengenai studi biologi molekuler yang digunakan sebagai informasi dalam industry budidaya dari kerang mutiara.
Phylogenetic Relationships of Isognomon (Lightfoot, 1786) Oysters from North Sulawesi, Indonesia Wullur, Stenly; Rumampuk, Natalie Detty; Tilaar, Sandra Olivia; Tindi, Monalisa; Smolak, Radoslav
Buletin Oseanografi Marina Vol 13, No 1 (2024): Buletin Oseanografi Marina
Publisher : Universitas Diponegoro

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.14710/buloma.v13i1.54740

Abstract

The Isognomon (Lightfoot, 1786) is a genus of oysters found in various coastal ecosystems throughout the world. Along with other bivalves, it performs significant ecological functions in marine ecosystems by providing food and habitat for fish and invertebrate habitats, filtering water, and protecting shorelines. Taxonomic classification of the Isognomon oyster can be challenging due to the varied or cryptic phenotypic characters, particularly shell characters.  In this study, two specimens with different shell characters of Isognomon oyster were collected from mangrove waters in Likupang, North Sulawesi, Indonesia, and subjected to molecular analysis to determine their identity.  The mitochondrial cytochrome C oxidase subunit I (COI) gene was utilized as a primer for this purpose, and the genetic distance and phylogenetic position of the two specimens were determined by comparing them with the GenBank database. The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) revealed that the two specimens were of belonged to Isognomon ephippium, with a similarity of 99.84%. The genetic distance between the two specimens was calculated using the Tamura Nei model and found to be 0.00, while the genetic distance between I. ephippium and other species in the Isognomon genus ranged from 0.00 to 0.14. The results of the Neighbor Joining (NJ) tree analyses showed that the two specimens clustered together with I. ephippium, which was divided into two distinct clades with a strong bootstrap value of 100 at the node
Co-Authors N. Gustaf F. Mamangkey Rumampuk, Natalie Detty Sandra Tilaar Smolak, Radoslav Stenly Wullur