Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search

Ekstrak Kasar Isolat Bacillus sp Sebagai Agen Peluruh Biofilm Gultom, Mangihot Tua; William Thamrin; Mariana Wahjudi; Suhartono
Keluwih: Jurnal Kesehatan dan Kedokteran Vol. 4 No. 2 (2023): Keluwih: Jurnal Kesehatan dan Kedokteran (June)
Publisher : Direktorat Penerbitan dan Publikasi Ilmiah, Universitas Surabaya

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24123/kesdok.V4i2.5676

Abstract

Abstract–Biofilms play an important role in the distribution and pathogenicity of bacteria. In our previous research, we demonstrated that our isolated Bacillus sp. (collection of Microbiology Lab, Universitas Surabaya) exhibited in vitro antibiofilm activity. Bacilli generally produce cellulase, which is one of the enzymes responsible for bacterial biofilm degradation. Based on this fact, this study aimed (1) to determine whether or not the crude extract of our Bacillus sp. isolate is able to degrade biofilms formed by Escherichia coli, Staphylococcus aureus, and water-crane bacteria, and (2) to determine whether such crude extract contains active cellulase. The research steps began with the preparation of Bacillus sp. crude extract, biofilm degradation assay, cellulase activity assay on CMC Agar, and cellulase detection by SDS-PAGE and electrophoresis zymogram. The crude extract of Bacillus sp. effectively degraded the biofilm 30 min after contact. The crude extract decreased biofilms of Escherichia coli 23,56%, Staphylococcus aureus 27,78%, and water-crane bacteria 37,98%. Based on the zymogram result, it was shown that the crude extract contained active cellulase, with a size of approximately 35 kDA. It was concluded that the crude extract of Bacillus sp. has potential as an anti-biofilm agent and exhibits active cellulase activity. Keywords: Bacillus sp., crude extract, biofilm, SDS-PAGE, zymogram Abstrak–Biofilm mempunyai peran penting dalam penyebaran dan sifat patogenitas bakteri patogen. Pada penelitian sebelumnya telah dibuktikan bahwa isolat Bacillus sp. (koleksi Laboratorium Mikrobiologi, Universitas Surabaya) mempunyai aktivitas anti-biofilm secara in vitro. Bacillus umumnya menghasilkan selulase sedangkan selulase diketahui dapat meluruhkan biofilm bakteri. Berdasarkan hal di atas, penelitian ini bertujuan (1) untuk mengetahui apakah ekstrak kasar isolat Bacillus sp. ini dapat meluruhkan biofilm Escherichia coli dan Staphylococcus aureus, dan bakteri air keran; dan (2) untuk mengetahui apakah dalam ekstrak kasar terdapat selulase. Metode penelitian ini meliputi penyiapan ekstrak kasar sel Bacillus sp., pengujian aktifitas meluruhkan biofilm, uji aktivitas selulase pada Agar CMC, dan analisis keberadaan aktivitas selulase pada ekstrak kasar Bacillus sp. menggunakan SDS-PAGE dan elektroforesis zymogram. Hasil penelitian menunjukkan bahwa ektrak kasar isolat Bacillus sp. bekerja paling baik pada perlakuan 30 menit setelah kontak dengan biofilm bakteri. Pemberian ekstrak kasar dapat menurunkan biofilm Escherichia coli sebesar 23,56%; dan biofilm bakteri Staphylococcus aureus sebesar 27,78%, dan biofilm bakteri air keran sebesar 37,98%. Berdasarkan hasil zymogram, telihat bahwa ekstrak kasar isolat Bacillus sp. memiliki selulase aktif dengan ukuran sekitar 35 kDa. Dapat disimpulkan bahwa ekstrak kasar isolat Bacillus sp. berpotensi sebagai agen peluruh biofilm dan memiliki selulase aktif. Kata kunci: Bacillus sp., ekstrak kasar, biofilm, SDS-PAGE, zymogram
Stenotrophomonas maltophilia, Bakteri Resisten Merkuri pada Limbah Pertambangan Logam Gultom, Mangihot Tua; Shienen Sisilia; Mariana Wahjudi
Keluwih: Jurnal Sains dan Teknologi Vol. 3 No. 1 (2022): Keluwih: Jurnal Sains dan Teknologi (February)
Publisher : Direktorat Penerbitan dan Publikasi Ilmiah, Universitas Surabaya

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24123/saintek.v3i1.4910

Abstract

Abstract—Mercuric-resistant bacterium isolate coded 22 was previously obtained from metal mining (tailing) wastewater samples. From the total 24 bacteria which had been isolated, isolate 22 exhibited the highest resistance toward high concentration of Hg. In this paper it is reported results of 16S rDNA-based identification of isolate 22 as well as its growth and resistance characteristics when growing on Mercuric containing Nutrient Broth medium. Isolate 22 is closely related to the bacterium, Stenotrophomonas maltophilia (identity 99% and query covered 90%). Isolate 22 grew very well in the NB-Hg medium containing Hg concentration of 50 and 100 ppm. Increasing Hg concentration clearly lengthened lag phase although cell quantity (culture turbidity, OD600) at the initial phase were the same. Keywords: isolate22, Hg, identification, sequencing, 16S rRNA gene Abstrak—Isolat 22 adalah kode isolat bakteri resisten logam Merkuri (Hg) yang didapatkan pada sampel air limbah pertambangan logam (tailing). Isolat 22 adalah isolat yang paling berdaya tahan tinggi terhadap Hg, dari total 24 isolat yang berhasil diisolasi. Pada paper ini akan dilaporkan hasil identifikasi spesies bakteri isolat 22 menggunakan teknik PCR - sekuensing gen 16S rRNA dan karakter pertumbuhan dan resistensi isolat 22 terhadap Hg. Dari hasil sekuensing 16S rRNA, diketahui bahwa isolat 22 sangat dekat kekerabatannya dengan spesies Stenotrophomonas maltophilia (identity 99% dan query covered 90%). Isolat 22 tumbuh dengan baik pada medium NB-Hg dengan kadar Hg 50 dan 100 ppm. Semakin tinggi kadar Hg dalam medum, semakin lama fase lag, walaupun jumlah sel pada medium di fase awal sama. Kata kunci: isolat 22, hg, identifikasi, sekuensing, gen 16S rRNA