Claim Missing Document
Check
Articles

Found 4 Documents
Search

Transformasi cDNA Gen 1-Aminosiklopropan-1-Asam Karboksilat Oksidase untuk Penundaan Kematangan pada Pepaya Dampit dan Sarirona Makful, -; Subandiyah, S; Priyambada, I D; Artama, W T
Jurnal Hortikultura Vol 14, No 1 (2004): Maret 2004
Publisher : Indonesian Center for Horticultural Research and Development

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Penelitian ini dilaksanakan dari bulan Januari 2002 sampai Februari 2003. Penelitian bertujuan untuk mendapatkankalus transforman gen 1-aminosiklopropan-1-asam karboksilat (ACC) oksidase yang mampu hidup dan dapatberdiferensiasi, wahana untuk membuat pepaya transgenik tahan simpan, telah dilakukan di Laboratorium BiologiMolekuler, Balai Penelitian Bioteknologi dan Sumber Daya Genetik Pertanian, Bogor. Mutu buah pepaya salahsatunya ditentukan oleh kesegaran buah saat dikonsumsi. Proses pemasakan buah pepaya berlangsung sangat cepat,hal ini menyulitkan dalam transportasi pepaya, terutama untuk menjangkau tempat yang jauh. Proses pemasakan buahdikontrol oleh meningkatnya konsentrasi hormon etilen dan disintesis dari 1-aminosiklopropan-1-asam karboksilat.Produksi etilen dapat ditekan dengan memblok jalur biosintesis etilen. Mekanismenya adalah membuat antisens genreg u la tor biosintesis etilen. Transformasi pepaya varietas dampit dan sarirona dilakukan menggunakan par ti cle bom -bard ment. Rancangan percobaan adalah deskriptif kuantitatif dengan rancangan acak lengkap. Sumber eksplanpepaya berupa embrio zigotik yang digunakan untuk optimasi taraf kematian terhadap kanamisin, uji gusmenggunakan plasmid pRQ6 (gen gus, NPH, promotor 35S, dan ter mi na tor NOS) dan introduksi gen interes dalamplasmid pGA643 SM4 (gen antisens ACC oksidase, NPT II, promotor 35S, dan ter mi na tor NOS) pada me dia seleksi.Hasil penelitian menunjukkan bahwa kedua eksplan pepaya op ti mal pada kanamisin 150 mg/l, di mana padakonsentrasi ini eksplan mati seluruhnya. Pengujian gus terbanyak pada varietas sarirona 25% (25 spot biru) jarak 9cm, sedangkan varietas dampit 10% (9 spot biru) jarak 5 cm. Spot biru menandakan gen yang disisipi telah terintegrasipada gen tanaman. Efisiensi gen antisens ACC oksidase pada me dia seleksi kanamisin 150 mg/l menunjukkan 16%(14 embrio kotiledon) pada varietas dampit, sedangkan varietas sarirona tidak tumbuh. Tumbuhnya transforman padame dia seleksi menunjukkan eksplan tersebut sudah tersisipi pGA643 SM4 yang mengandung gen tahan terhadapkanamisin (gen NPT II ).Trans for ma tion of cDNAACC ox i dize gene for de lay rip en ing on pa paya dampit and sarirona. This re search was con ducted from Jan u ary2002 to Feb ru ary 2003. The aim of this re search was to find out trans formed cal lus by ACC ox i dize gene, there are via -ble and be able to dif fer en ti a tion, the means to de velop pa paya trans gen ic for de lay rip en ing. The re search was con -ducted at the Lab o ra tory of Mo lec u lar Bi ol ogy of Re search In sti tute for Bio tech nol ogy and Ag ri cul tural Ge neticRe sources, Bogor. One part of pa paya qual ity was de ter mined by fruit re fresh ment. The pro cess of pa paya ma tu ritywas went on very fast. This prob lem made dif fi cult for pa paya tranportation, ex cel lence to reach out long place. Thepro cess of ma tu rity was controled by incresing con cen tra tion of eth yl ene hor mone and it was syn the sized from ACC(1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid). One of ef fort pressed eth yl ene pro duc tion with to block eth yl enebiosynthesis path way. Mech a nism of block ing eth yl ene biosynthesis path way was made antisens of gen reg u la tor.The trans for ma tion of pa paya dampit and sarirona va ri ety have been de rived by bom bard ment par ti cle. The ex per i -men tal de sign is de scrip tive quan ti ta tive and ran dom ized com plete de sign. The zy gotic em bryo as explant sourcewere used for op ti miz ing kanamycin lev els, gus as say with pRQ6 plasmid (gus gene, NPH, 35S pro moter, NOS ter mi -na tor) and in tro duc tion in ter est gene with pGA643 SM4 plasmid (antisens ACC ox i dize gene, NPT II, 35S pro moter,NOS ter mi na tor) on the se lec tive me dium. The re sult in di cated the op ti miz ing of both pa paya on 150 mg/l kanamycin.This concentration made explant die all of it. Gus as say pref er ence of sarirona 25% (25 blue spot) in dis tance 9 cm anddampit 10% (9 blue spot) in dis tance 5 cm. Ef fi ciency of antisens ACC ox i dize gene on se lec tive me dium con tain ing150 mg/l kanamycin in di cated 16% (14 cotyledonae em bryo) in dampit but in sarirona do not growth. Transformangrowth on se lec tive me dium in di cated pGA643 SM4 have in sert to zy gotic em bryo be cause plasmid con tain ing se lec -tion gene of kanamycin (NPT II gene).
MP-10 Subcloning Gene Encoding Rophtry 1 (ROP1) Toxoplasma gondii WTA Isolate Purmaningtyas Kusumaningsih; W T Artama; S Moeljoparwiro
Hemera Zoa Proceedings of the 20th FAVA & the 15th KIVNAS PDHI 2018
Publisher : Hemera Zoa

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (581.732 KB)

Abstract

Toxoplasma gondii is an obligate intracellular parasite which could infected all organism, and built a vacuola parasitoporus for multiplicity their self in host [1]. Toxoplasmosis is the one of zoonotic diseases which could infected animal and human and involved that two organism to their life [2].Toxoplasmosis in animal is difficult to held, it cause involved the environment. Oosit could sporulated in the water, it made fish, walrus and other mamalian infected by T. gondii. Bat could be a vector of T. gondii if they bite cattle where in it bloods contain with tachyzoites [3]. Toxoplasmosis in ranch such as cattle, pork, sheep, goat and poultry focused on reproduction health that impact economics system and causes congenital disease. This condition can impact for fulfill of prime seed and good meat for human consumption [4].The invasion of T. gondii to host cell could cause immunology reaction like cytokine secretors such as IL-12, IFN-γ, TNF-α and T cells such as CD4+ and CD8+. It involved surface antigen/SAG protein and excretory-secretory antigen/ESA protein [5].Rophtry-1 protein has functioned as a penetration factor and it has 66 kDa molecular of weight. Cloning gene of rophtry-1 T. gondii RH isolate have done and result on vaccination using recombinant plasmid rop1, improving activity of natural kill cells, cell and T proliferation. Recombinant antigen of ROP1 also can use for toxoplasma diagnosis [6,7].The aim of these studies was to sub-clone the gene encoding ROP-1 protein T. gondii WTA isolate to pET-32a(+) and produced a recombinant plasmid of ROP-1 in E. coli BL-21(DE3). This recombinant plasmid will be used to produce a recombinant protein which will be able to perform preliminary studies on its stability on detect T. gondii specific antibodies.
Transformasi cDNA Gen 1-Aminosiklopropan-1-Asam Karboksilat Oksidase untuk Penundaan Kematangan pada Pepaya Dampit dan Sarirona - Makful; S Subandiyah; I D Priyambada; W T Artama
Jurnal Hortikultura Vol 14, No 1 (2004): Maret 2004
Publisher : Indonesian Center for Horticulture Research and Development

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.21082/jhort.v14n1.2004.p1-7

Abstract

Penelitian ini dilaksanakan dari bulan Januari 2002 sampai Februari 2003. Penelitian bertujuan untuk mendapatkankalus transforman gen 1-aminosiklopropan-1-asam karboksilat (ACC) oksidase yang mampu hidup dan dapatberdiferensiasi, wahana untuk membuat pepaya transgenik tahan simpan, telah dilakukan di Laboratorium BiologiMolekuler, Balai Penelitian Bioteknologi dan Sumber Daya Genetik Pertanian, Bogor. Mutu buah pepaya salahsatunya ditentukan oleh kesegaran buah saat dikonsumsi. Proses pemasakan buah pepaya berlangsung sangat cepat,hal ini menyulitkan dalam transportasi pepaya, terutama untuk menjangkau tempat yang jauh. Proses pemasakan buahdikontrol oleh meningkatnya konsentrasi hormon etilen dan disintesis dari 1-aminosiklopropan-1-asam karboksilat.Produksi etilen dapat ditekan dengan memblok jalur biosintesis etilen. Mekanismenya adalah membuat antisens genreg u la tor biosintesis etilen. Transformasi pepaya varietas dampit dan sarirona dilakukan menggunakan par ti cle bom -bard ment. Rancangan percobaan adalah deskriptif kuantitatif dengan rancangan acak lengkap. Sumber eksplanpepaya berupa embrio zigotik yang digunakan untuk optimasi taraf kematian terhadap kanamisin, uji gusmenggunakan plasmid pRQ6 (gen gus, NPH, promotor 35S, dan ter mi na tor NOS) dan introduksi gen interes dalamplasmid pGA643 SM4 (gen antisens ACC oksidase, NPT II, promotor 35S, dan ter mi na tor NOS) pada me dia seleksi.Hasil penelitian menunjukkan bahwa kedua eksplan pepaya op ti mal pada kanamisin 150 mg/l, di mana padakonsentrasi ini eksplan mati seluruhnya. Pengujian gus terbanyak pada varietas sarirona 25% (25 spot biru) jarak 9cm, sedangkan varietas dampit 10% (9 spot biru) jarak 5 cm. Spot biru menandakan gen yang disisipi telah terintegrasipada gen tanaman. Efisiensi gen antisens ACC oksidase pada me dia seleksi kanamisin 150 mg/l menunjukkan 16%(14 embrio kotiledon) pada varietas dampit, sedangkan varietas sarirona tidak tumbuh. Tumbuhnya transforman padame dia seleksi menunjukkan eksplan tersebut sudah tersisipi pGA643 SM4 yang mengandung gen tahan terhadapkanamisin (gen NPT II ).Trans for ma tion of cDNAACC ox i dize gene for de lay rip en ing on pa paya dampit and sarirona. This re search was con ducted from Jan u ary2002 to Feb ru ary 2003. The aim of this re search was to find out trans formed cal lus by ACC ox i dize gene, there are via -ble and be able to dif fer en ti a tion, the means to de velop pa paya trans gen ic for de lay rip en ing. The re search was con -ducted at the Lab o ra tory of Mo lec u lar Bi ol ogy of Re search In sti tute for Bio tech nol ogy and Ag ri cul tural Ge neticRe sources, Bogor. One part of pa paya qual ity was de ter mined by fruit re fresh ment. The pro cess of pa paya ma tu ritywas went on very fast. This prob lem made dif fi cult for pa paya tranportation, ex cel lence to reach out long place. Thepro cess of ma tu rity was controled by incresing con cen tra tion of eth yl ene hor mone and it was syn the sized from ACC(1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid). One of ef fort pressed eth yl ene pro duc tion with to block eth yl enebiosynthesis path way. Mech a nism of block ing eth yl ene biosynthesis path way was made antisens of gen reg u la tor.The trans for ma tion of pa paya dampit and sarirona va ri ety have been de rived by bom bard ment par ti cle. The ex per i -men tal de sign is de scrip tive quan ti ta tive and ran dom ized com plete de sign. The zy gotic em bryo as explant sourcewere used for op ti miz ing kanamycin lev els, gus as say with pRQ6 plasmid (gus gene, NPH, 35S pro moter, NOS ter mi -na tor) and in tro duc tion in ter est gene with pGA643 SM4 plasmid (antisens ACC ox i dize gene, NPT II, 35S pro moter,NOS ter mi na tor) on the se lec tive me dium. The re sult in di cated the op ti miz ing of both pa paya on 150 mg/l kanamycin.This concentration made explant die all of it. Gus as say pref er ence of sarirona 25% (25 blue spot) in dis tance 9 cm anddampit 10% (9 blue spot) in dis tance 5 cm. Ef fi ciency of antisens ACC ox i dize gene on se lec tive me dium con tain ing150 mg/l kanamycin in di cated 16% (14 cotyledonae em bryo) in dampit but in sarirona do not growth. Transformangrowth on se lec tive me dium in di cated pGA643 SM4 have in sert to zy gotic em bryo be cause plasmid con tain ing se lec -tion gene of kanamycin (NPT II gene).
ANALISIS MOLEKULER PROFIL PROTEIN PILLI UNTUK MENGUNGKAP HUBUNGAN SIMILARITAS 26 STRAIN Salmonella typhi ISOLAT JAWA Sri Darmawati; - Anawar S; W T Artama
PROSIDING SEMINAR NASIONAL & INTERNASIONAL 2010: PROSIDING SEMINAR NASIONAL HASIL-HASIL PENELITIAN
Publisher : Universitas Muhammadiyah Semarang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (535.167 KB)

Abstract

Variasi dan hubungan similaritas 26 strain Salmonella typhi Isolat Jawa merupakan awal untuk melacak protein sub unit pilli spesifik yang memiliki aktivitas hemaglutinasi. Tujuan penelitian analisis molekulerprofil protein pilli untuk mengungkap hubungan similaritas 26 Strain S. typhi Isolat Jawa. Analisis dilakukan terhadap 26 strain yang berasal dari Surabaya, Madiun, Malang, Salatiga, Magelang, Bandung, Bogor, Jakarta, Yogyakarta dengan elektroforesis SDS-PAGE. Analisis hubungan similaritasdigunakan program MVSP, untuk mengkonstruksi dendogram yang mencerminkan klasifikasi dari 26 strain S. typhi Isolat Jawa berdasarkan nilai indeks similaritas (S SM ) dengan algoritma UPGMA. Hasilanalisis profil protein pili menunjukkan (1) Jumlah pita protein sub unit pilli bervariasi : 8-17 pita, BM tertinggi 200 kD, terendah 10 kD, dengan 20 karakter. (2) Protein 100 kD, 50 kD, 45 kD dan 40 kD adalah protein sub unit pilli yang dimiliki oleh 26 strain S. typhi Isolat Jawa. (3) Dari 26 strain S. typhi Isolat Jawa terdiri dari dua kelompok besar yang mempunyai indeks similaritas 61,2%. Kelompok pertama adalah strain S. typhi Isolat Jawa Tengah dan Jawa Timur, dan kelompok ke dua adalah strain S. typhi Isolat Jawa Barat dan DKI. Pita 14 (12,5 kD) dan 15 (78kD) dari protein sub unit pilli hanya dimiliki strain S. typhi dari Surabaya. Pita 18(35kD) dan 20 (72kD) dari protein sub unit pilli hanya dimiliki oleh Strain S. typhi dari DKI Jakarta.Kata kunci: Protein Pilli, Hubungan similaritas, Salmonella typhi