Nurhayati Awik
Departemen Biologi, Fakultas Sains, Institut Teknologi Sepuluh Nopember (ITS), Surabaya-60111

Published : 1 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search

Visualisasi Interaksi Ligan Ibuprofen terhadap Protein Cyclooxygenase secara Komputasi Nurhayati Awik; A Rihandoko; M Santoso; E Setiawan
Proceeding Biology Education Conference: Biology, Science, Enviromental, and Learning Vol 16, No 1 (2019): Proceeding Biology Education Conference
Publisher : Universitas Sebelas Maret

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Enzim Cyclooxygenase-2 (COX-2) bertanggung jawab terhadap proses inflamasi dan rasa nyeri. Pemberian senyawa Ibuprofen (IBP) dapat berperan sebagai inhibitor cyclooxygenase-2 yang menghambat aktifitas enzim COX-2 dalam mensintesis prostaglandin yang merespon rasa nyeri dan proses inflamasi. Tujuan dalam penelitian ini untuk mengetahui interaksi antara ibuprofen dengan protein Cyclooxygenases secara komputasi. Metode yang digunakan dalam penelian ini molecular dinamyc simulation (MD) untuk membuat reaksi kimia secara virtual. Hasil RMSD kompleks IBP dengan COX-2 adalah ~0,76 hingga ~2,37Å, Hasil RMSF menunjukkan COX-2 tingkat fleksibilitas yang tinggi. Jumlah ikatan Hidrogen intramolekuler berkisar 0 hingga 2 dan ikatan hidrogen intermolecular berada pada ARG12@O2, ARG12@O1, ARG438@O1. Interaksi antara Ibuprofen dengan Cyclooxygenase-2 menunjukkan terbentuknya ikatan Hidrogen dan membentuk kompleks protein.