Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2021 - 2026
0
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Prosiding University Research Colloquium
Sri Aulia Akbar Edy Prabowo
Universitas Muhammadiyah Surakarta
Humanities Computer Science & IT Environmental Science Law, Crime, Criminology & Criminal Justice Medicine & Pharmacology

Published : 1 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search

 1 
Profil in silico Interaksi Senyawa Alam ketumbar dan Adas Bintang sebagai Inhibitor Peptida Deformilase Mycobacterium tuberculosis (3SVJ dan 1WS1) menggunakan Bantuan PyRx-Vina Sri Aulia Akbar Edy Prabowo
Prosiding University Research Colloquium Proceeding of The 7th University Research Colloquium 2018: Mahasiswa (student paper presentation)
Publisher : Konsorsium Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat Perguruan Tinggi Muhammadiyah 'Aisyiyah (PTMA) Koordinator Wilayah Jawa Tengah - DIY

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (232.133 KB)

Abstract

Pencarian profil interaksi molekular senyawa alam ketumbar dan adasbintang secara in silico telah dilakukan terhadap protein peptidadeformilase bakteri TB (3SVJ; 1WS1). Tujuan dari penelitian adalahuntuk menganalisis potensi tanaman herbal sebagai anti tuberculosismelalui docking molekuler. Langkah yang dikerjakan adalah preparasiligan-protein, docking, visualisasi, dan analisis hasil. Afinitas ikatanantara adas bintang dengan 1ws1_protein (Heriguard), adas bintangdengan 3svj_protein (Heriguard), ketumbar dengan 1ws1_protein(alpha humulene) dan ketumbar dengan 3svj_protein (2-methylenecyclopenatonol) menghasilkan binding affinity dengan nilai berturutturut-7,9;-7,5;-6,4 dan -6,8 kkal/mol sedangkan ligan native pada3SVJ dan 1WS1 binding affinitynya ditunjukkan dengan nilai -7,3hingga -,8,7 kkal/mol. Mengacu pada nilai binding affinity tersebut,hanya Adas bintang yang berpotensi sebagai anti tuberkulosis karenanilai yang hampir sama dibandingkan dengan ligan native. Nilaibinding affinity yang paling kecil menunjukkan bahwasanya energidari senyawa aktif untuk mengikat protein lebih kecil sehinggadiharapkan dapat lebih efektif sebagai anti tuberkulosis. Sedangkanketumbar interaksinya mirip dengan native, sehingga bisa dijadikansebagai ligan penuntun. Namun semuanya perlu diujikan kembalidengan berbagai kondisi komputasi virtual lainnya untuk memastikandugaan pertama ini.
Co-Authors