Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2021 - 2026
0.408
P-Index
This Author published in this journals
All Journal TROPICAL GENETICS Tropical Genetics
Rinti Mutiara Sari
Universitas Negeri Padang
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Computer Science & IT Decision Sciences, Operations Research & Management Medicine & Pharmacology

Published : 2 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search

 1 
Genotyping Of Sumatera Local Variety Of Citrus Using Random Amplified Polymorphism DNA (RAPD) Technique Rinti Mutiara Sari; Afifatul A Achyar; Yuni Ahda; Dwi Hilda Putri
Tropical Genetics Vol. 2 No. 2 (2022):
Publisher : Genetikawan Muda Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24036/tg.v2i2.29

Abstract

Indonesia memiliki varietas jeruk lokal yang tidak kalah dengan jeruk impor, terutama dalam hal kesegaran buah. Namun, masyarakat lebih tertarik dengan warna kulit jeruk sehingga masyarakat lebih memilih jeruk impor ketimbang jeruk lokal, khususnya di Sumatera. Oleh karena itu, perlu dilakukan upaya pelestarian dan peningkatan karakteristik jeruk ini untuk meningkatkan kualitasnya melalui pemuliaan tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk mengoptimalkan metode isolasi DNA sampel buah jeruk dengan Chelex-TE dan untuk mengetahui profil genetik jeruk lokal Sumatera dan jeruk impor menggunakan genotipe RAPD. Sampel yang digunakan adalah beberapa jeruk lokal di Sumatera (Citrus Siam Gunung Omeh, Citrus Madu, Citrus Keprok Maga, Citrus Keprok Brastepu dan Citrus Pasaman) dan Citrus impor (Citrus Sunkist, Citrus Clemengold, Citrus Murkot dan Citrus Wokam). DNA diisolasi menggunakan metode Chelex-TE 10% yang dioptimalkan untuk beberapa parameter seperti ukuran butir, kulit buah dan daun. RAPD dilakukan dengan menggunakan 10 primer RAPD. Hasil penelitian menunjukkan bahwa metode isolasi Chelex Chelex-TE 10% yang optimal adalah ukuran sampel 1 butir. Amplifikasi jeruk lokal Sumatera dan jeruk impor menggunakan 10 primer tunggal menghasilkan pita polimorfik. Nilai kesamaan jaccard menunjukkan bahwa kelima sampel jeruk tersebut merupakan varietas lokal Sumatera yang diamati memiliki variasi genetik yang tinggi dibandingkan dengan keempat jeruk impor tersebut. Indonesia memiliki varietas jeruk lokal yang tidak kalah dengan jeruk impor, terutama dalam hal kesegaran buah. Namun, masyarakat lebih tertarik dengan warna kulit jeruk sehingga masyarakat lebih memilih jeruk impor ketimbang jeruk lokal, khususnya di Sumatera. Oleh karena itu, perlu dilakukan upaya pelestarian dan peningkatan karakteristik jeruk ini untuk meningkatkan kualitasnya melalui pemuliaan tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk mengoptimalkan metode isolasi DNA sampel buah jeruk dengan Chelex-TE dan untuk mengetahui profil genetik jeruk lokal Sumatera dan jeruk impor menggunakan genotipe RAPD. Sampel yang digunakan adalah beberapa jeruk lokal di Sumatera (Citrus Siam Gunung Omeh, Citrus Madu, Citrus Keprok Maga, Citrus Keprok Brastepu dan Citrus Pasaman) dan Citrus impor (Citrus Sunkist, Citrus Clemengold, Citrus Murkot dan Citrus Wokam). DNA diisolasi menggunakan metode Chelex-TE 10% yang dioptimalkan untuk beberapa parameter seperti ukuran butir, kulit buah dan daun. RAPD dilakukan dengan menggunakan 10 primer RAPD. Hasil penelitian menunjukkan bahwa metode isolasi Chelex Chelex-TE 10% yang optimal adalah ukuran sampel 1 butir. Amplifikasi jeruk lokal Sumatera dan jeruk impor menggunakan 10 primer tunggal menghasilkan pita polimorfik. Nilai kesamaan jaccard menunjukkan bahwa kelima sampel jeruk tersebut merupakan varietas lokal Sumatera yang diamati memiliki variasi genetik yang tinggi dibandingkan dengan keempat jeruk impor tersebut.
Genotyping of Sumatera local variety of citrus using random amplified polymorphism DNA (RAPD) technique Rinti Mutiara Sari; Afifatul A Achyar; Yuni Ahda; Dwi Hilda Putri
Tropical Genetics Vol. 2 No. 2 (2022):
Publisher : Genetikawan Muda Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24036/tg.v2i2.29

Abstract

Indonesia has local varieties of citrus that are no less than imported citrus, especially in terms of fruit freshness. However, people are more interested in the color of citrus peel so people prefer imported citrus to local citrus, especially in Sumatera. Therefore, it is necessary to carry out efforts to conserve and improve the characteristics of these citrus to improve their quality through plant breeding. This study aims to optimize DNA isolation methods for citrus fruit samples with Chelex-TE and to determine the genetic profile of local Sumatera citrus and imported citrus using the genotyping RAPD. The samples used were several local citrus in Sumatera (Citrus Siam Mountain Omeh, Citrus Madu, Citrus Keprok Maga, Citrus Keprok Brastepu and Citrus Pasaman) and imported Citrus (Citrus Sunkist, Citrus Clemengold, Citrus Murkot and Citrus Wokam). DNA was isolated using the 10% Chelex-TE method which was optimized for several parameters such as grain size, fruit skin and leaves. RAPD was performed using 10 RAPD primers. The results showed that the optimum 10% Chelex Chelex-TE isolation method was a sample size of 1 grain. The amplification of local Sumatran citrus and imported citrus using 10 single primers produced polymorphic bands. The value of jaccard's similarity indicates that the five samples of Sumatera local variety of citrus and imported citrus have high genetic variation. Indonesia has local varieties of citrus that are no less than imported citrus, especially in terms of fruit freshness. However, people are more interested in the color of citrus peel so people prefer imported citrus to local citrus, especially in Sumatera. Therefore, it is necessary to carry out efforts to conserve and improve the characteristics of these citrus to improve their quality through plant breeding. This study aims to optimize DNA isolation methods for citrus fruit samples with Chelex-TE and to determine the genetic profile of local Sumatera citrus and imported citrus using the genotyping RAPD. The samples used were several local citrus in Sumatera (Citrus Siam Mountain Omeh, Citrus Madu, Citrus Keprok Maga, Citrus Keprok Brastepu and Citrus Pasaman) and imported Citrus (Citrus Sunkist, Citrus Clemengold, Citrus Murkot and Citrus Wokam). DNA was isolated using the 10% Chelex-TE method which was optimized for several parameters such as grain size, fruit skin and leaves. RAPD was performed using 10 RAPD primers. The results showed that the optimum 10% Chelex Chelex-TE isolation method was a sample size of 1 grain. The amplification of local Sumatran citrus and imported citrus using 10 single primers produced polymorphic bands. The value of jaccard's similarity indicates that the five samples of Sumatera local variety of citrus and imported citrus have high genetic variation.
Co-Authors Achyar, Afifatul Dwi Hilda Putri Yuni Ahda