Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search

Desain Primer In Silico Untuk Amplifikasi Genus Andaliman Dengan Aplikasi Bioinformatika Batubara, Jesica; Gultom, Reinelda; Hutagaol, Aprinia; Parapat, Gita; Marpaung, Rivaldi; Hafzari, Rini; Ningsih, Ayu; Pasaribu, Rio
Jurnal Biologi Vol. 1 No. 4 (2024): August
Publisher : Indonesian Journal Publisher

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.47134/biology.v1i4.3283

Abstract

Desain primer merupakan tahapan awal dalam proses amplifikasi dan analisis segmen DNA. Desain primer pada proses PCR merupakan hal yang sangat penting karena primer tersebut yang akan menempel pada DNA template lalu mengamplifikasi sekuen target. Penelitian ini bertujuan merancang primer spesifik untuk amplifikasi gen target pada Andaliman, guna mendukung studi molekuler lebih lanjut. Desain primer dilakukan secara in silico menggunakan software MEGA X, Primer3Plus, dan Clone Manager Demo 9. Sekuen gen Andaliman diperoleh dari database NCBI. Hasil analisis menunjukkan bahwa pasangan primer yang dirancang memenuhi kriteria panjang, temperatur leleh, dan kandungan GC yang ideal untuk reaksi PCR. Selain itu, primer juga tidak membentuk dimer atau hairpin yang dapat mengganggu efisiensi amplifikasi. Primer yang telah diperoleh dapat digunakan sebagai dasar untuk pengembangan marka molekuler pada Andaliman, yang berguna untuk identifikasi varietas, analisis filogenetik, dan program pemuliaan.
Pengaruh BAP (Benzil Amino Purine) dan Ekstrak Tauge (Phaseolus aureus) terhadap Multiplikasi Tanaman Nilam (Pogostemon cablin Benth.) Secara In Vitro Hutagaol, Aprinia; Edi, Syahmi
Biocaster : Jurnal Kajian Biologi Vol. 6 No. 1 (2026): January
Publisher : Lembaga Pendidikan, Penelitian, dan Pengabdian Kamandanu

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.36312/biocaster.v6i1.1034

Abstract

Patchouli (Pogostemon cablin Benth.) is a promising export commodity, so techniques such as tissue culture are needed to increase its production. This study aims to determine the effect of BAP (Benzyl Amino Purine) and bean sprout extract (Phaseolus aureus) on the multiplication of patchouli (Pogostemon cablin Benth.) in vitro. This study used a factorial Completely Randomized Design (CRD) with 4 levels of BAP concentration (0 ppm, 0.5 ppm, 1 ppm, 1.5 ppm) and 3 levels of bean sprout extract concentration (0%, 12%, 15%), each treatment was repeated 3 times. Data analysis used ANOVA and further testing with 5% DMRT test. The results showed that the administration of BAP significantly affected the increase in the number of shoots, leaves, and roots. BAP concentration of 0.5 ppm gave the best results on the growth of shoots and leaves, but the treatment without BAP actually produced the best growth in the number of roots. The combination of BAP and bean sprout extract significantly affected the number of shoots and leaves. The combination of 0.5 ppm BAP and 15% bean sprout extract produced the highest number of shoots and leaves, producing 2.92 shoots and 4.28 leaves. The interaction between BAP and bean sprout extract creates natural auxin and synthetic cytokinin hormones derived from BAP, which maintain hormonal balance to support patchouli growth.