Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search

PEMANFAATAN PENANDA trnL-F DALAM ANALISIS MOLEKULER UNTUK IDENTIFIKASI TUMBUHAN LANGKA SECARA IN SILICO Kocha, Santana; Hidayat, Topik; Hernawati, Hernawati
BIOTIKA Jurnal Ilmiah Biologi Vol 23, No 2 (2025): BIOTIKA DESEMBER 2025
Publisher : Universitas Padjadjaran

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24198/biotika.v23i2.64272

Abstract

Penelitian ini bertujuan mengembangkan primer diagnostik berbasis penanda trnL-F secara in silico untuk mendeteksi tumbuhan langka. Biodiversitas mencakup variasi kehidupan di bumi, dari gen, spesies, hingga ekosistem. Semakin tinggi keanekaragaman hayati, semakin stabil dan produktif suatu ekosistem. Selain itu, variasi genetik membantu organisme beradaptasi terhadap perubahan lingkungan dan iklim. Menurut IUCN, lebih dari 40% spesies tumbuhan di dunia terancam punah akibat perubahan iklim, ketidakstabilan genom, deforestasi, dan aktivitas manusia. Gangguan ini dapat merusak fungsi gen penting dan mengurangi kemampuan adaptasi, membuat tumbuhan langka semakin rentan terhadap kepunahan. Maka dari itu upaya konservasi sangat dibutuhkan, namun identifikasi dan karakterisasi tumbuhan langka masih menjadi tantangan karena metode tradisional karena sering kurang akurat. Kelemahan penanda morfologi mendorong penggunaan penanda molekuler DNA. DNA barcode berbasis trnL-F memungkinkan identifikasi in silico secara cepat, akurat, dan non-destruktif. Teknik in silico PCR juga memungkinkan perancangan eksperimen secara efisien, murah, dan tanpa laboratorium. Sebanyak 30 sekuens DNA tumbuhan langka dari data IUCN dianalisis menggunakan perangkat lunak ClustalX, BioEdit, dan FastPCR. Hasil analisis ini dihasilkan 12 kandidat primer (6 forward dan 6 reverse). Uji in silico PCR terhadap 12 spesies langka menunjukkan satu pasangan primer terbaik, yaitu forward (1:F_255–277) dan reverse (1:R_355–375). Uji efektivitas terhadap 12 spesies non-langka menunjukkan spesifisitas 100% dengan hasil PCR negatif. Berdasarkan hal tersebut dapat diartikan bahwa temuan ini menunjukkan pasangan primer tersebut sangat potensial untuk deteksi dan konservasi tumbuhan langka secara efisien dan akurat.
Effect of Exogenous Bacillus sp. Addition on Bioremediation of Soil Contaminated by Used Cooking Oil Fauziah, Aisyah Fikria; Prameswari, Alfi Hanifah; Polandos, Chersy Tiffany; Kocha, Santana; Yuliandini, Sinta; Surakusumah, Wahyu; Dewina, Restu Utari
-
Publisher : Universitas Pendidikan Indonesia and Konsorsium Biologi Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Used cooking oil waste can be carcinogenic and toxic to living creatures in soil. Bioremediation is a way to treat used cooking oil-contaminated soil by using microorganisms that are safe for the environment. This research aimed to determine the effect of adding exogenous bacteria Bacillus sp. on the bioremediation process of soil contaminated with used cooking oil waste. Total Petroleum Hydrocarbons (TPH) measurement and effectiveness of Bacillus sp. in degrading hydrocarbons was calculated in this study. The results showed that Bacillus sp. has the ability to rapidly degrade used cooking oil TPH and increased the effectiveness of bioremediation in soil.