Diversity Analysis of Genus Vibrio in Enterocytozoon Hepatopenaei (EHP) Infected Shrimp with Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus Polymerase Chain Reaction (ERIC PCR) Method

Fenny Amelia (Program Studi Biologi, Fakultas Ilmu Hayati, Universitas Surya, Jl. M.H. Thamrin Km 2.7, Kota Tangerang 15143, Indonesia)
Beni Halalludin (Animal Health Service Laboratory, PT. Central Proteina Prima, Jl. Anggerek 3 Blok EA No.11, Kota Tangerang 15560, Indonesia)
Sidrotun Naim (Program Studi Biologi, Fakultas Ilmu Hayati, Universitas Surya, Jl. M.H. Thamrin Km 2.7, Kota Tangerang 15143, Indonesia Program Studi Teknik Lingkungan, Fakultas Teknik, Universitas Surya, Jl. M.H. Thamrin Km 2.7, Kota Tangerang 15143, Indonesia)
Rega Permana (Departemen Perikanan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Universitas Padjadjaran, Jalan Raya Bandung-Sumedang KM.21 Jatinangor, Kabupaten Sumedang 45363, Indonesia)

Journal of Aquaculture and Fish Health
Vol. 9 No. 3 (2020): JAFH Vol. 9 No. 3 September 2020

Udang merupakan salah satu komoditas unggulan nasional dan memiliki nilai ekonomi yang tinggi. Produksi udang budidaya di Indonesia tahun 2012-2017 mengalami kenaikan secara signifikan. Meski mengalami kenaikan, masih terdapat masalah yang harus diatasi, salah satunya adalah penyakit yang disebabkan oleh parasit Enterocytozoon Hepatopenaei (EHP). Infeksi EHP mengganggu sel tubulus hepatopankreas. Lesi yang disebabkan oleh EHP dapat menjadi tempat pertumbuhan koloni Vibrio sehingga meningkatkan kemungkinan munculnya penyakit lain. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keanekaragaman Vibrio pada udang terinfeksi EHP yang dianalisis dengan Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus Polymerase Chain Reaction (ERIC PCR). ERIC PCR dapat membedakan strain bakteri yang berkerabat dekat, prosedur kerja yang sederhana, cepat dan murah. Bakteri Vibrio diisolasi dari hepatopankreas, feses dan air udang terinfeksi EHP dan udang sehat (kontrol), dilanjutkan dengan ekstraksi DNA, ERIC PCR, elektroforesis dan konstruksi pohon filogenetik. Hasil penelitian menunjukkan bahwa jumlah bakteri Vibrio pada hepatopankreas, air dan feses udang terinfeksi EHP lebih tinggi dibandingkan dengan udang sehat. Udang terinfeksi EHP memiliki keanekaragaman Vibrio yang lebih rendah dari pada udang sehat. Hal ini menunjukkan adanya spesies Vibrio spesifik yang mendominasi pada udang terinfeksi EHP.