Partner
Vol 24, No 1 (2019): Edisi Juli

CONSERVED REGION OF ELEPHANT ENDOTHELIOTROPIC HERPESVIRUS (EEHV) BASED ON BIOINFORMATICS ANALYSIS

Ika Agus RINI (Institut Teknologi Sumatera)



Article Info

Publish Date
01 Jul 2019

Abstract

Gajah adalah salah satu hewan yang dilindungi di Indonesia. Endotheliotropic Herpesvirus (EEHV) merupakan salah satu penyakit yang menyebabkan kematian pada gajah. Hingga saat ini, belum banyak penelitian tentang penyakit tersebut, termasuk cara mendeteksi infeksinya. Penelitian ini bertujuan untuk mencari daerah lestari gen U38 dari DNA polimerase berdasarkan sekuens DNA di Gene Bank, sehingga dapat digunakan sebagai primer untuk deteksi dini penyakit yang disebabkan oleh infeksi EEHV pada gajah. Urutan genom EEHV dikumpulkan dari GeneBank, NCBI. Sekuens tersebut dianalisis dengan penyelarasan berganda menggunakan clustalX.2 dan dianalisis lebih lanjut dengan BioEdit. Beberapa daerah lestari yang ditemukan kemudian dianalisis lebih lanjut dengan Blastn untuk mengevaluasi daerah yang akan digunakan sebagai primer. Hasil penelitian menunjukkan bahwa satu sekuens memenuhi kriteria primer yang baik dan sesuai dengan standar yang umumnya digunakan. Sehingga, untuk kedepannya dapat digunakan sebagai kandidat dalam deteksi EEHV pada gajah.

Copyrights © 2019






Journal Info

Abbrev

jp

Publisher

Subject

Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Environmental Science Immunology & microbiology Social Sciences Veterinary

Description

Jurnal Pertanian Terapan PARTNER menerima artikel hasil-hasil penelitian dalam bidang pertanian terapan maupun critical reviews yang berhubungan dengan: Produksi Ternak Nutrisi dan Pakan Ternak Teknologi Pakan Ternak Kesehatan Hewan Sosial Ekonomi Pertanian/ Peternakan Agronomi Perlindungan Tanaman ...