Claim Missing Document
Check
Articles

Found 4 Documents
Search

CONSERVED REGION OF ELEPHANT ENDOTHELIOTROPIC HERPESVIRUS (EEHV) BASED ON BIOINFORMATICS ANALYSIS Ika Agus RINI
Partner Vol 24, No 1 (2019): Edisi Juli
Publisher : Politeknik Pertanian Negeri Kupang

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.35726/jp.v24i1.336

Abstract

Gajah adalah salah satu hewan yang dilindungi di Indonesia. Endotheliotropic Herpesvirus (EEHV) merupakan salah satu penyakit yang menyebabkan kematian pada gajah. Hingga saat ini, belum banyak penelitian tentang penyakit tersebut, termasuk cara mendeteksi infeksinya. Penelitian ini bertujuan untuk mencari daerah lestari gen U38 dari DNA polimerase berdasarkan sekuens DNA di Gene Bank, sehingga dapat digunakan sebagai primer untuk deteksi dini penyakit yang disebabkan oleh infeksi EEHV pada gajah. Urutan genom EEHV dikumpulkan dari GeneBank, NCBI. Sekuens tersebut dianalisis dengan penyelarasan berganda menggunakan clustalX.2 dan dianalisis lebih lanjut dengan BioEdit. Beberapa daerah lestari yang ditemukan kemudian dianalisis lebih lanjut dengan Blastn untuk mengevaluasi daerah yang akan digunakan sebagai primer. Hasil penelitian menunjukkan bahwa satu sekuens memenuhi kriteria primer yang baik dan sesuai dengan standar yang umumnya digunakan. Sehingga, untuk kedepannya dapat digunakan sebagai kandidat dalam deteksi EEHV pada gajah.
PENGENALAN MEDIA PEMBELAJARAN DARING BERBASIS STEM UNTUK GURU IPA DI SMAN 9 BANDAR LAMPUNG Indah Oktaviani; Ika Agus Rini; Mia Maria Ulfah; Ahmad Dodi Andriana
Jubaedah : Jurnal Pengabdian dan Edukasi Sekolah (Indonesian Journal of Community Services and School Education) Vol. 1 No. 1 (2021): Jurnal Pengabdian dan Edukasi Sekolah (Jubaedah)
Publisher : LPPM Universitas Bina Bangsa

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.46306/jub.v1i1.16

Abstract

Meluasnya pandemi Covid-19 memaksa proses pembelajaran di sekolah dilakukan secara daring. Hal ini menuntut guru untuk lebih kreatif dalam menggunakan media pembelajaran yang berbasis teknologi agar pembejaran lebih interaktif terutama pada kondisi pandemi. Akan tetapi tidak banyak guru di sekolah yang menguasi perangkat lunak sebagai media pembejaran, sehingga perlu dilakukan pelatihan dalam pemanfaatan teknologi dalam Pembelajaran Jarak Jauh. Metode yang dilakukan antara lain perancangan dan persiapan yang meliputi survei terhadap kondisi guru dalam memanfaatkan media pembelajaran, pelaksanaan kegiatan, dan evaluasi. Hasil survei awal menunjukkan bahwa guru IPA masih sangat terbatas dalam memanfaatkan metode pembelajaran dengan perangkat lunak interaktif, sehingga dilakukan pelatihan dengan modul yang sudah disediakan dan perangkat lunak yang dapat mewakili pembelajaran IPA berbasis STEM dengan penggunaan Nearpod dan Laboratorium virtual simulasi PhET. Hasil Pelatihan menunjukkan adanya peningkatan pemahaman dan kreatifitas guru IPA dalam proses pembelajaran daring
ISOLASI DAN KARAKTERISASI BAKTERI PENGHASIL IAA (INDOLE ACETIC ACID) DARI RHIZOSFER TANAMAN AKASIA (Acacia mangium) Ika Agus Rini; Indah Oktaviani; Muhammad Asril; Revi Agustin; Fina Khaerunissa Frima
Agro Bali : Agricultural Journal Vol 3, No 2 (2020)
Publisher : Universitas Panji Sakti

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (422.046 KB) | DOI: 10.37637/ab.v3i2.619

Abstract

IAA adalah produk paling umum dari metabolisme L-triptofan yang dapat diproduksi oleh beberapa mikroorganisme. Beberapa mikroorganisme yang memiliki potensi menghasilkan IAA adalah bakteri rhizosfer pada tanaman Leguminosae, salah satunya adalah akasia. Acacia mangium, juga dikenal sebagai akasia, adalah pohon yang tumbuh cepat. Namun, akasia adalah tanaman invasif. Tanaman akasia memiliki bintil yang merupakan hasil simbiosis akar tanaman dan bakteri. Simbiosis ini dapat mempengaruhi kesuburan tanah. Banyak potensi yang dapat digali dari bakteri tanah, khususnya di rhizosfer. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengisolasi dan mengidentifikasi bakteri pada rizosfer tanaman akasia yang mampu menghasilkan IAA sebagai salah satu potensi untuk kandidat PGPR (Plant Growth Promoting Rhizobacteria). Metode yang digunakan meliputi pengambilan sampel, isolasi bakteri penghasil IAA, pemurnian bakteri, identifikasi bakteri dan uji biokimia, pembuatan kurva tumbuha bakteri, dan uji isolat bakteri pelarut fosfat. Hasil isolasi bakteri rhizosfer diperoleh sebanyak 10 isolat bakteri yang memiliki karakteristik berbeda secara morfologi.  Berdasarkan hasil identifikasi bakteri berdasarkan pewarnaan Gram, bakteri tersebut masuk ke dalam genus Bacillus dan terdapat 5 isolat bakteri yang memiliki kemampuan menghasilkan IAA dan melarutkan fosfat sehingga bakteri tersebut memiliki potensi sebagai pupuk hayati.
DNA Barcoding for Selected Mangrove-Based Estuary Fishes from Way Kambas National Park, Lampung Province, Indonesia Yanti Ariyanti; Ika Agus Rini; Indah Oktaviani; Sovia Santi Leksikowati
Journal of Tropical Life Science Vol. 11 No. 2 (2021)
Publisher : Journal of Tropical Life Science

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.11594/jtls.11.02.04

Abstract

Over the past decade, DNA barcoding has provided new insight into fish ecology and biosystematics and led to new species' discovery. DNA barcoding is a method for the recognition and identification of species using short, standardised DNA fragments. The correct taxonomic identification of species is critical for the assessment and monitoring of biodiversity. This study applied DNA barcoding techniques to identify selected fish species from a mangrove-based estuary in Way Kambas National Park, Lampung Province, Indonesia. The gene encoding cytochrome c oxidase subunit I (COI) was amplified and bi-directionally sequenced from 22 specimens. The resulting 680 base pairs (bp) sequence was used to identify species, obtain phylogenetic information, and analyse genetic distances. A neighbour-joining tree was constructed based on the mitochondrial COI gene using the Kimura two-parameter model. This study also exhibits conservation status for those identified species. Our findings will facilitate future studies of fish species diversity in mangrove estuary-based ecosystems and provide preliminary data in policymaking in conservation areas such as National Park.