Prosiding Seminar Nasional Kusuma
Vol 1 (2023): Prosiding Seminar Nasional Kusuma

Identifikasi Polimorfisme Gen Interleukin-6 -385A/T dan -386A/T pada Wanita Postmenopause Suku Jawa dengan Osteoporosis

Sri Lestari Utami (Fakultas Kedokteran, Universitas Wijaya Kusuma Surabaya)



Article Info

Publish Date
29 Jun 2024

Abstract

Penelitian tentang variasi genotip pada polimorfisme gen IL-6 -174G/C, -572G/C, -597A/G dan -634C/G dan hubungannya dengan jumlah mRNA, kadar protein IL-6 dan nilai skor-T leher femoral pada wanita postmenopause Suku Jawa dengan osteoporosis telah dilakukan. Studi ini bertujuan untuk mengidentifikasi variasi genotip lainnya pada polimorfisme gen IL-6 pada wanita postmenopause Suku Jawa dengan osteoporosis. Penelitian dilakukan pada wanita postmenopause Suku Jawa sebanyak 66 orang. Diagnosis osteoporosis ditegakkan dengan DEXA pada skor-T leher femoral. Genotip polimorfisme promoter gen IL-6 akan diidentifikasi dengan metode Sanger sekuensing satu arah dari PCR produk yang telah dipurifikasi. Primer yang digunakan untuk promoter gen IL-6 terdiri dari 2 sekuen, yaitu Primer 1: 5’ – TCTGAACCAGCTTGAC CCAA – 3’ dan 5’ – CTGTGAGGGGCTGTTGTAGA – 3’ dan Primer 2: 5’ – AGCAGC CAACCTCCTCT AAG – 3’ dan 5’ – GAGCTTCTCTTTCGTTCCCG – 3’. Hasil sekuensing akan dihomologikan dengan bank gen. Single nucleotide polymorphism baru diidentifikasi pada promoter gen IL-6 di posisi 385 dan 386 dengan perubahan basa dari A menjadi T. Ukuran sekuen produk PCR dengan primer 1 dan 2 adalah 572 bp dan 760 bp. Jumlah dan persentase genotip AA, AT dan TT pada polimorfisme gen IL-6-385A/T berturut-turut adalah 51 (77,27%), 8 (12,12%) dan 7 (10,6%). Sedangkan genotip pada IL-6-386A/T adalah AA dan AT dengan frekuensi dan persentase berturut-turut adalah 60 (95,45%) dan 3 (4,5%). Jumlah alel A pada polimorfisme gen IL-6-385A/T dan IL-6-386A/T adalah 110 dan 129, sedangkan alel Tnya berjumlah 22 dan 3. SNP baru promoter gen IL-6 ditemukan di postmenopausal Suku Jawa dengan osteoporosis adalah -385A/T dan -386A/T.

Copyrights © 2023






Journal Info

Abbrev

kusuma

Publisher

Subject

Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Economics, Econometrics & Finance Languange, Linguistic, Communication & Media Law, Crime, Criminology & Criminal Justice

Description

Prosiding Seminar Nasional KUSUMA merupakan terbitan berkala setiap tahun sekali pada bulan Oktober. Prosiding ini berisi kumpulan artikel hasil penelitian dan kegiatan pengabdian pada masyarakat yang telah dipresentasikan dalam Seminar Nasional KUSUMA yang diselenggarakan oleh Lembaga Penelitian ...