Analisis Filogenetik In Silico Berbasis Sekuens Genetik terhadap Afiliasi Evolusioner Lichen dan Fungi

Trina Ami Khamaliah (Biologi, Universitas Pendidikan Indonesia)
Amalia Jamilah (Biologi, Universitas Pendidikan Indonesia)
Avarel Azra Wibawa (Biologi, Universitas Pendidikan Indonesia)
Putri Alia Hakim (Biologi, Universitas Pendidikan Indonesia)
Wulan Elizabeth (Biologi, Universitas Pendidikan Indonesia)
Topik Hidayat (Biologi, Universitas Pendidikan Indonesia)

JURNAL PENDIDIKAN TAMBUSAI
Vol. 9 No. 3 (2025): Desember

Lichen merupakan organisme simbiotik yang posisi filogenetiknya masih diperdebatkan. Penelitian ini bertujuan merekonstruksi hubungan filogenetik lichen serta menilai afiliasinya terhadap fungi menggunakan pendekatan in silico berbasis sekuens genetik. Analisis filogenetik dilakukan dengan metode Maximum Parsimony menggunakan data sekuens lichen, fungi, alga, dan tumbuhan paku, dengan protista sebagai outgroup. Hasil menunjukkan bahwa lichen tidak membentuk klad monofiletik tersendiri, melainkan berasosiasi dekat dengan fungi. Nilai Consistency Index (CI) sebesar 0,4545 mengindikasikan homoplasi sedang, sedangkan Retention Index (RI) sebesar 0,8022 menunjukkan sinyal filogenetik yang relatif kuat. Hasil ini mendukung afiliasi filogenetik lichen dengan fungi.