Analisis Morfologi dan Molekuler Mangifera sp. VII.E.180 Koleksi Kebun Raya Bogor Menggunakan Penanda Internal Transcribed Spacer (ITS) nrDNA

Rifka Farhani (Program Studi Biologi, Fakultas Sains dan Teknologi, UIN Sultan Maulana Hasanuddin Banten. Jalan Syech Nawawi Al Bantani Kampung Andamu'i, Kelurahan Sukawana, Kecamatan Curug, Kota Serang, Banten, 42171)
Eri Sulistiati (Program Studi Biologi, Fakultas Sains dan Teknologi, UIN Sultan Maulana Hasanuddin Banten. Jalan Syech Nawawi Al Bantani Kampung Andamu'i, Kelurahan Sukawana, Kecamatan Curug, Kota Serang, Banten, 42171)
Muhammad Rifqi Hariri (Pusat Riset Biosistematika dan Evolusi, Badan Riset dan Inovasi Nasional (BRIN), Jalan Ir. H. Juanda No. 13, Paledang, Kecamatan Bogor Tengah, Kota Bogor, Jawa Barat, 16911)

Konservasi Hayati
Vol 22 No 1 (2026): April

Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi status taksonomi spesimen Mangifera sp. VII.E.180 asal Sulawesi koleksi Kebun Raya Bogor menggunakan pendekatan morfologi dan molekuler berbasis penanda Internal Transcribed Spacer (ITS) nrDNA. Urgensi penelitian ini terletak pada pentingnya validasi taksonomi sampel koleksi ex situ yang mengalami hambatan identifikasi akibat kegagalan pembungaan jangka panjang. Metode molekuler menggunakan ekstraksi CTAB termodifikasi, PCR primer universal 17SE/26SE, sekuensing, dan BLASTn. Konstruksi filogenetik dilakukan terhadap 1 spesimen target, 13 sekuen Mangifera (ingroup), dan Anacardium occidentale (outgroup) menggunakan MEGA 11 dengan metode Neighbor-Joining (NJ) dan Maximum Likelihood (ML) berbasis bootstrap 1000  ulangan. Hasil BLASTn menunjukkan kemiripan tertinggi dengan M. foetida sebesar 97,56% (di bawah ambang batas spesies ≥ 98%). Analisis NJ/ML menempatkan spesimen pada klad M. foetida dan M. laurina dengan nilai bootstrap lemah (48). Namun, morfologi vegetatifnya menunjukkan kesesuaian kuat dengan deskripsi Mangifera sulavesiana. Spesimen VII.E.180 disimpulkan memiliki afinitas erat dan diduga kuat merupakan M. sulavesiana. Untuk penelitian selanjutnya, disarankan melakukan konfirmasi lanjutan spesifik menggunakan pendekatan multi-marker (seperti rbcL atau trnL-F) atau data genomik luas guna mengatasi keterbatasan resolusi marka ITS.