Jurnal Riset Akuakultur
Vol 8, No 1 (2013): (April 2013)

KARAKTERISTIK GENETIK Kappaphycus alvarezii SEHAT DAN TERINFEKSI PENYAKIT ICE-ICE DENGAN METODE Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP)

Emma Suryati (Balai Penelitian dan Pengembangan Budidaya Air Payau, Maros)
Lida Puspaningtyas (Departemen Biologi, Institut Pertanian Bogor, Bogor)
Utut Widyastuti (Departemen Biologi, Institut Pertanian Bogor, Bogor)
Suharsono Suharsono (Departemen Biologi, Institut Pertanian Bogor, Bogor)



Article Info

Publish Date
30 Mar 2013

Abstract

Infeksi penyakit ice-ice pada Kappaphycus alvarezii seringkali menyebabkan penurunan produksi yang sangat signifikan. K. alvarezii merupakan alga merah penghasil karaginan yang memiliki nilai ekonomi tinggi dan banyak dimanfaatkan dalam berbagai industri, seperti farmasi, makanan, stabilizer, dan kosmetik. Perbaikan genetik sangat diperlukan untuk meningkatkan produksi. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik kemiripan genetik K. alvarezii sehat dan terinfeksi penyakit dari Balai Penelitian dan Pengembangan Budidaya Air Payau (BPPBAP), Maros dengan metode Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP). Pada penelitian ini juga dianalisis K. alvarezii asal Bone (BNE), Gorontalo (GRL), Tambalang (TMB), dan Kendari (KND) sebagai kontrol rumput laut sehat. Metode AFLP menggunakan enzim restriksi Psti dan Mset, preamplifikasi dan amplifikasi selektif diawali dengan isolsi DNA, uji genimoc DNA, restriksi dan ligasi. Hasil yang diperoleh menunjukkan penggunaan marker AFLP dengan primer forward P11 dan primer reverse M48, M49 dan M50 terhadap K. alvarezii yang berasal dari Takalar (TKL), dan Mataram (MTR), tanpa infeksi (sehat) dan terinfeksi penyakit Takalar ice (TKL+), Mataram ice (MTR+), serta K. alvarezii kontrol (BNE), (GRL), (TMB), dan (KND) menghasilkan 519 fragmen dalam 122 lokus dengan ukuran 50 - ~370 pb. Kemiripan genetik K. alvarezii yang terinfeksi penyakit ice-ice lebih rendah jika dibandingkan dengan yang sehat. Kemiripan genetik K. alvarezii dari Takalar sehat (TKL) dan terinfeksi ice-ice (TKL+) adalah 0,8176 dan MTR-MTR+ adalah 0,8033.

Copyrights © 2013






Journal Info

Abbrev

jra

Publisher

Subject

Agriculture, Biological Sciences & Forestry Environmental Science

Description

Jurnal Riset Akuakultur as source of information in the form of the results of research and scientific review (review) in the field of various aquaculture disciplines include genetics and reproduction, biotechnology, nutrition and feed, fish health and the environment, and land resources in ...