cover
Contact Name
Dinia R Dwijayanti,
Contact Email
biotropika@gmail.com
Phone
+62341-575841
Journal Mail Official
biotropika@gmail.com
Editorial Address
Departemen Biologi FMIPA UB, Jalan Veteran, 65145, Malang, Jawa Timur
Location
Kota malang,
Jawa timur
INDONESIA
Biotropika
Published by Universitas Brawijaya
ISSN : 23027282     EISSN : 25498703     DOI : 10.21776/ub.biotropika.
Biotropika: Journal of Tropical Biology invites research articles, short communication, and reviews describing new findings/phenomena of biological sciences in tropical regions, specifically in the following subjects, but not limited to biotechnology, biodiversity, microbiology, botany, zoology, biosystematics, ecology, and environmental sciences.
Arjuna Subject : -
Articles 22 Documents
Search results for , issue "Vol 3, No 1 (2015)" : 22 Documents clear
STRUKTUR KOMUNITAS MAKROINVERTEBRATA BENTOS DI SALURAN MATA AIR NYOLO DESA NGENEP KECAMATAN KARANGPLOSO KABUPATEN MALANG Noviana Nur Rahmawati; Catur Retnaningdyah
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 3, No 1 (2015)
Publisher : University of Brawijaya

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui profil struktur komunitas makroinvertebrata bentos untuk evaluasi kualitas air di mata air Nyolo dan salurannya yang terletak di Desa Ngenep Kecamatan Karangploso Kabupaten Malang. Pengambilan sampel makroinvertebrata bentos dilakukan pada enam stasiun meliputi sekitar mata air Nyolo (stasiun satu dan dua), Curah Glogo (stasiun tiga dan empat), dan Curah Lang-lang (stasiun lima dan enam). Sampel diambil sebanyak ±100 individu/stasiun menggunakan Jaring Surber dan handnet. Pengumpulan data tiap stasiun meliputi komposisi dan kerapatan tiap spesies selanjutnya digunakan untuk menghitung kekayaan taksa, INP (Indeks Nilai Penting), dan indeks diversitas (H’). Hasil penelitian menunjukkan bahwa kekayaan taksa makroinvertebrata bentos yang ditemukan sebanyak 28 taksa dan bervariasi pada tiap stasiun. Baetidae, Caenidae, Melanoides tuberculata, Odonata dari famili Euphaeidae, Planaria dan Hydropsychidae jenis Cheumatopsyche sp. ditemukan di semua stasiun. Pada setiap stasiun didominasi oleh jenis yang berbeda, di stasiun satu terdapat  kodominasi Chironomidae dan Cheumatopsyche sp., stasiun dua didominasi oleh Melanoides tuberculata, stasiun tiga terdapat kodominasi Lymnaea rubiginosa, Thiara scabra, dan Dugesia trigina, stasiun empat terdapat kodominasi Cheumatopsyche sp. dan Simuliidae, dan di stasiun lima dan enam didominasi oleh Baetidae. Tingkat pencemaran bahan organik semakin menurun pada saluran yang semakin jauh dari mata air berdasarkan taksa makroinvertebrata bentos dominan yang ditemukan, namun demikian tingkat pencemaran bahan toksik  berdasarkan indeks diversitas Shannon-Wiener semakin tinggi. Kata kunci: makroinvertebrata bentos, mata air Nyolo dan salurannya, struktur komunitas
Konstruksi Protein Transcription Activator-Like Effector (TALE) 1 dan 2 dengan Target Sekuen DNA strain HPV Tipe 16 dan 18 Agatha Mia Puspitasari; Nashi Widodo
Biotropika: Journal of Tropical Biology Vol 3, No 1 (2015)
Publisher : University of Brawijaya

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Kanker serviks dapat disebabkan oleh infeksi virus HPV tipe 16 dan 18 namun dapat dihindari dengan melakukan deteksi awal atau screening pada wanita. Penelitian ini bertujuan untuk mendesain protein Transcription Activator-Like Effector (TALE) sebagai detektor dari HPV 16 dan 18 dengan cara mencari sekuen target DNA HPV 16 dan 18 beserta konstruksi protein TALE tersebut. Metode yang dilakukan adalah analisa sekuen target HPV 16 dan 18 dengan software MEGA, konstruksi protein TALE pada plasmid pSB1C3, PCR, Golden Gate Cloning, dan elektroforesis. TALE yang dikonstruksi adalah 2 macam protein TALE, yaitu TALE 1 dan TALE 2, yang memiliki susunan basa DNA yang berbeda. Konstruksi TALE dilakukan dengan Golden Gate Cloning menggunakan GATE Assembly Kit. Sekuen target DNA diperoleh dari hasil alignment software MEGA yang terdiri dari 14 bp pada masing-masing TALE dengan Timin (T) pada ujung-ujung sekuen. Kemudian konstruksi TALE diperoleh dari tim Freiburg yang memiliki 6 bagian yang dapat mengkode protein TALE. Hasil yang didapatkan dari konstruksi adalah pita DNA sebesar 3kbp pada gel agarosa melalui elektroforesis.   Kata kunci: HPV 16,  HPV 18,  kloning, TALE 1, TALE 2

Page 3 of 3 | Total Record : 22