Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2021 - 2026
0.23
P-Index
This Author published in this journals
All Journal BIOMA : Jurnal Biologi Makassar
Brian Rahardi
Departemen Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Brawijaya
Agriculture, Biological Sciences & Forestry

Published : 1 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search

 1 
Optimasi Suhu Annealing Primer matK dan ITS1 pada DNA Melothria pendula L. (Cucurbitaceae) dengan Metode Polymerase Chain Reaction (PCR) Sitri Hasugian; Brian Rahardi; Turhadi Turhadi
BIOMA : JURNAL BIOLOGI MAKASSAR Vol. 11 No. 2 (2026): Bioma : Juli - Desember 2026
Publisher : Department of Biology, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Hasanuddin University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Melothria pendula L. merupakan tumbuhan merambat dari famili Cucurbitaceae yang memiliki potensi biologis tinggi, namun identifikasinya sulit dilakukan secara morfologi terutama pada fase vegetatif. Identifikasi molekuler berbasis DNA menjadi alternatif yang lebih akurat, dengan teknik polymerase chain reaction (PCR) sebagai tahap penting untuk mengamplifikasi fragmen gen target. Keberhasilan PCR sangat dipengaruhi oleh optimasi suhu annealing, karena suhu yang tidak sesuai dapat menyebabkan amplifikasi nonspesifik atau kegagalan pembentukan produk. Penelitian ini bertujuan menentukan suhu annealing optimum primer matK dan ITS1 dalam amplifikasi DNA M. pendula menggunakan metode gradient PCR. DNA diisolasi dari daun segar menggunakan metode CTAB dengan hasil konsentrasi 1.091,50 ng/µL dan rasio kemurnian A260/A280 sebesar 1,958. Proses amplifikasi dijalankan pada rentang suhu 40-60°C. Hasil menunjukkan bahwa suhu annealing optimum untuk primer matK adalah 51,2°C menghasilkan pita target ~900 bp, sedangkan ITS1 optimal pada 56°C dengan pita target ~300 bp. Kedua suhu menghasilkan pita tunggal yang tebal, jelas, dan tanpa multiband atau primer dimer. Optimasi suhu annealing berperan penting dalam meningkatkan efisiensi dan spesifisitas amplifikasi PCR untuk mendukung identifikasi molekuler M. pendula.
Co-Authors Sitri Hasugian Turhadi Turhadi