Perkembangan teknologi digital telah mendorong pemanfaatan Learning Management System(LMS) dalam pembelajaran, termasuk pada pembelajaran Ilmu Pengetahuan Alam (IPA) yangmenuntut pemahaman mendalam. Namun, kajian mengenai bagaimana LMS secara spesifikmendukung pembelajaran mendalam (deep learning) masih terbatas. Penelitian ini bertujuanuntuk mengkaji dan mensintesis berbagai hasil penelitian terkait pemanfaatan LMS dalammendukung pembelajaran IPA yang berorientasi pada deep learning. Penelitian inimenggunakan pendekatan systematic literature review dengan mengacu pada alur PRISMA.Data dikumpulkan melalui basis data Google Scholar menggunakan aplikasi Publish or Perishdengan rentang publikasi tahun 2019 sampai 2025. Dari 200 artikel yang teridentifikasi,diperoleh 10 artikel yang memenuhi kriteria inklusi dan dianalisis secara mendalam. Hasilpenelitian menunjukkan bahwa LMS berkontribusi dalam meningkatkan pemahaman konsep,keterlibatan siswa, dan kemampuan berpikir tingkat tinggi (HOTS). Selain itu, LMSmendukung pembelajaran mendalam melalui proses interaksi, kolaborasi, dan refleksi yangdifasilitasi oleh fitur-fitur digital. Namun, efektivitas LMS sangat bergantung pada desainpembelajaran, kompetensi guru, serta dukungan infrastruktur dan literasi digital. Penelitian inimenghasilkan kontribusi baru berupa model konseptual integrasi LMS dalam pembelajaran IPAyang mencakup komponen input, proses, output, dan faktor moderator. Model ini memberikankerangka sistematis dalam mengoptimalkan LMS sebagai ekosistem pembelajaran yangmendukung deep learning.