Faramitha Nur Izzaty
Unknown Affiliation

Published : 2 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search

Akurasi Pemeriksaan Polymerase Chain Reaction Menggunakan Primer IS6110 dan MPB64 untuk Mendeteksi Mycobacterium tuberculosis pada Spesimen Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Timotius Benedict Djitro; Faramitha Nur Izzaty; Nur Rahadiani
Majalah Patologi Indonesia Vol 28 No 3 (2019): MPI
Publisher : Perhimpunan Dokter Spesialis Patologi Indonesia (IAPI)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (319.438 KB)

Abstract

ABSTRAKLatar belakangTantangan yang dihadapi dalam mengontrol penyakit tuberculosis (TB) adalah ketersediaan alat diagnostikyang cepat dan tepat. Pemeriksaan baku emas untuk diagnosis TB saat ini adalah kultur bakteri tahan asam,tetapi metode ini membutuhkan waktu yang lama dan tidak dapat digunakan pada jaringan yang telah difiksasidengan formalin. Pemeriksaan PCR memliki sensitivitas dan spesifisitas yang tinggi, membutuhkan waktu yanglebih singkat dibanding kultur, serta dapat digunakan pada jaringan yang telah difiksasi dengan formalin.Laporan ini bertujuan mengetahui akurasi pemeriksaan PCR menggunakan primer IS6110 dan MPB64 untukmendeteksi M.tuberculosis pada spesimen FFPE (formalin-fixed paraffin-embedded).MetodeDilakukan pencarian literatur pada basis data Pubmed, Scopus, Proquest, Springer Link dan Cochrane.Terdapat dua jurnal yang relevan dengan kasus, lalu dilakukan telaah kritis menggunakan Diagnostic StudyAppraisal Worksheet dari Centre for Evidence-based Medicine, University of Oxford, 2010.HasilDari kedua jurnal, akurasi PCR dengan primer IS6110 dan MPB64 saat ini masih kurang baik, Sensitivitasberkisar antara 45,5-88,9%, spesifisitas antara 88,1-100%. Rentang nilai sensitivitas yang luas ini kemungkinandisebabkan oleh volume dan proses embedding jaringan yang dapat menyebabkan kerusakan integritas DNAM.tuberculosis.KesimpulanPemeriksaan PCR dengan primer IS6110 dan MPB64 dapat digunakan sebagai konfirmasi pada spesimenFFPE karena nilai spesifisitas yang tinggi dari pemeriksaan ini. Nilai sensitivitas yang bervariasi berisikomenghasilkan negatif palsu apabila tidak ada pemeriksaan lain yang digunakan bersama dengan PCR padaspesimen FFPE.
Akurasi Pemeriksaan Polymerase Chain Reaction Menggunakan Primer IS6110 dan MPB64 untuk Mendeteksi Mycobacterium tuberculosis pada Spesimen Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Timotius Benedict Djitro; Faramitha Nur Izzaty; Nur Rahadiani
Majalah Patologi Indonesia Vol. 28 No. 3, September 2019
Publisher : Perhimpunan Dokter Spesialis Patologi Anatomik Indonesia (PDSPA)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

BackgroundOne of the chalangges faced in controlling tuberculosis (TB) is the availability of a fast and precise diagnostictool. The current gold standard for diagnosis of TB is acid-fast bacterial culture. However, FFPE (formalin-fixedparaffin-embedded) tissues are not ammenable for culture and the time required makes this method impracticalfor many centers. PCR is an alternative rapid diagnostic tool, and can be used with FFPE tissues. PCR hasshown high sensitivity and specificity for detecting M.tuberculosis, however there has been reports of lesssensitivity and specificity when using FFPE specimens. This report aims to determine the accuracy of PCRdetection of M.tuberculosis using primer IS6110 and MPB64 on FFPE specimens.MethodsLiterature searches were carried out on the Pubmed, Scopus, Proquest, Springer Link and Cochranedatabases. Two journals were relevant to the clinical scenario, then a critical review is carreid out using theDiagnostic Study Appraisal Worksheet from the Center for Evidence-based Medicine, University of Oxford,2010.ResultsCurrently, the accuracy of PCR primer IS6110 and MPB is not satisfactory. Sensitivity ranges from 45.5-88.9%and specificity is between 88.1% - 100. This broad sensitivity range is probably caused by tissue volume andembedding process that can cause damages to the integrity of M.tuberculosis DNA.ConclusionPCR examinations using IS6110 and MPB64 primers can be used as confirmation tests in FFPE specimensdue to its high specificity value. Broad sensitivity values can produce significant false negatives if no otherexamination is used in conjunction with PCR in FFPE specimens.