Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
0.444
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Vegetalika BERITA BIOLOGI
Kristianto Nugroho
Balai Besar Penelitian dan Pengembangan Bioteknologi dan Sumber Daya Genetik Pertanian
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology

Published : 2 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search

 1 
Keragaman Genetik 27 Aksesi Kedelai (Glycine max L. Merr.) Introduksi Subtropis berdasarkan Marka SSR Puji Lestari; Rizki Eka Putri; Innaka Ageng Rineksane; Etty Handayani; Kristianto Nugroho; Rerenstradika Tizar Terryana
Vegetalika Vol 10, No 1 (2021)
Publisher : Universitas Gadjah Mada

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22146/veg.58418

Abstract

Karakterisasi aksesi kedelai (Glycine max L. Merr.) dalam koleksi perlu dilakukan berdasarkan marka molekuler untuk mendukung karakter morfologi. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis keragaman genetik aksesi kedelai yang diintroduksi dari daerah subtropis menggunakan marka simple sequence repeats (SSR) yang didukung melalui informasi karakter morfologi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa sebanyak 15 SSR berhasil dideteksi polimorfismenya pada 27 aksesi kedelai dari daerah subtropis dengan total 158 alel berukuran antara 100-368 bp dengan kisaran jumlah 4-18 alel per lokus. Rata-rata polymorphism information content (PIC) ditemukan sebesar 0,92 dengan nilai tertinggi 0,96 (SATT463, SATT249, SATT063) dan nilai terendah 0,87 (SATT038). Semua marka SSR memiliki nilai PIC >0,8 yang mengindikasikan sebagai marka sangat informatif, artinya mampu mendiferensiasi antar aksesi dan dapat diaplikasikan dalam mendeteksi keragaman genetik plasma nutfah kedelai lainnya. Keragaman genetik aksesi kedelai terebut sangat tinggi seperti yang direfleksikan oleh rata-rata indeks diversitas gen sebesar 0,93. Analisis klaster dengan marka SSR berhasil membagi 27 aksesi kedelai menjadi dua kelompok utama yang sebagian besar dalam kelompok I (26 aksesi) dan kelompok II khusus aksesi D76-8070. Karakterisasi molekuler dengan SSR tersebut mendukung keragaman yang tinggi karakter morfologi yang memisahkan total aksesi menjadi empat kuadran. Informasi keragaman genetik berdasarkan marka S yang didukung karakter morfologi tersebut dapat menjadi dasar awal seleksi tetua persilangan aksesi dari daerah subtropis untuk pengembangan varietas baru melalui pemuliaan kedelai di iklim tropis Indonesia.
ANALISIS KERAGAMAN GENETIK AKSESI KEDELAI INTRODUKSI DARI WILAYAH SUBTROPIS BERBASIS MORFOLOGI DAN MOLEKULER Rerenstradika Tizar Terryana; Nickita Dewi Safina; Suryani Suryani; Kristianto Nugroho; Puji Lestari
BERITA BIOLOGI Vol 19, No 3B (2020)
Publisher : Research Center for Biology-Indonesian Institute of Sciences

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.14203/beritabiologi.v19i3B.3894

Abstract

Genetic diversity information on soybean germplasm will establish the success of soybean breeding program. In the present study, four qualitative morphological traits information collected from Germplasm Resources Information Network (GRIN), United States Department of Agriculture (USDA) database (www.ars-grin.gov) and 10 microsatellite markers were used to analyze the relationship among 45 accessions of subtropical introduced soybean. The morphological characters of introduced soybean accessions contributed to support the result of molecular characterization. The introduced soybean accessions used in this study were diverse based on morphological and molecular characters. Based on principle component analysis, the flower color, pod color, and growth habit contributed most of the total genetic diversity. All introduced accessions were overlap into four quadrants based on principal coordinate analysis. All microsatellite primers showed polymorphism on total accession observed. High allele variation (9–27 alleles) was observed among tested accessions, with an average allele number and Polymorphic Information Content (PIC) value of 20.7 and 0.95 (0.92–0.97), respectively. All microsatellite markers showed PIC value >0.7 indicating that these markers were suitable for soybean diversity studies with high differentiation and with the average value of genetic diversity of 0.95. The phylogenetic analysis revealed that 45 soybean accessions could be divided into two major groups. Soybean accessions belonging to the same area did not always occupy the same group. The results confirmed that both morphology and molecular genetic diversity in a combined way could efficiently evaluate the variation present in different soybean accessions in any breeding program.
Co-Authors Etty Handayani Innaka Ageng Rineksane Nickita Dewi Safina Puji Lestari Puji Lestari Rerenstradika Tizar Terryana Rizki Eka Putri Suryani Suryani