Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2021 - 2026
0.23
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Bioeksperimen: Jurnal Penelitian Biologi
Alfino Sebastian
Research Center For Biotechnology, Gadjah Mada University
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Education

Published : 1 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 1 Documents
Search

 1 
Optimasi Primer OsAP2, OsERF3 dan OsEREBP2 pada Cempo Ireng (Oryza sativa L.) Menggunakan qPCR Arifa Rizqi Nafisa; Alfino Sebastian; Putri Wijayanti; Rosy Feraningsih Patigu; Yekti Asih Purwestri
Bioeksperimen: Jurnal Penelitian Biologi Vol 8, No 1: March 2022
Publisher : Universitas Muhammadiyah Surakarta

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.23917/bioeksperimen.v8i1.15800

Abstract

qPCR merupakan metode yang akurat untuk mendeteksi ekspresi gen. Analisis ekspresi gen pengkode faktor transkripsi pada padi saat ini banyak dilakukan. OsAP2, OsERF3 dan OsEREBP2 merupakan faktor transkripsi pada padi yang termasuk kedalam kelompok AP2/ERF yang berperan penting dalam proses biologis pada tanaman. Penelitian mengenai analisis ekspresi gen OsAP2, OsERF3 dan OsEREBP2 pada Cempo Ireng belum pernah dilakukan. Dalam melakukan analisis ekspresi gen menggunakan RT-PCR dibutuhkan primer spesfiik sesuai dengan gen yang diinginkan. Primer merupakan salah satu komponen penting dalam melakukan metode PCR. Gagalnya penempelan primer pada tahapan annealing menyebabkan kegagalan amplifikasi. Optimasi primer perlu untuk dilakukan untuk mendapatkan suhu annealing yang optimal. Pada penelitian ini akan dilakukan optimasi suhu anealing pada 3 gen pengkode faktor transkripsi pada padi yakni OsAP2, OsERF3 dan OsEREBP2. Optimasi dilakukan dengan menggunakan cDNA sebagai template. Konfirmasi hasil qPCR dilakukan dengan menggunakan elektroforesis. Hasil optimasi menunjukkan bahwa suhu annealing optimal pada primer OsAP2, OsERF3 dan OsEREBP2 berada pada kisaran 53,9 – 60 °C.
Co-Authors Arifa Rizqi Nafisa Putri Wijayanti Rosy Feraningsih Patigu Yekti Asih Purwestri