Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search

Phylogenetic Position of Eurihaline Rotifer Brachionus sp. Originated From Tumpaan Waters, South Minahasa, North Sulawesi Herlina Pasaribu; Inneke Rumengan; Stenly Wullur; Henki Manoppo; Joice Rimper; Reiny Tumbol
JURNAL BIOS LOGOS Vol. 13 No. 1 (2023): JURNAL BIOS LOGOS
Publisher : Universitas Sam Ratulangi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.35799/jbl.v13i1.45792

Abstract

This study aims to determine the phylogenetic position of rotifer Brachionus sp. sample originated from Tumpaan coastal water, North Sulawesi in the phylogenetic tree of Brachionus spp. from 27 samples of rotifer selected from 100 samples available in NCBI Genbank. The phylogeny tree was constructed on the basis of COI (Cytochrome Oxidase I) gene sequences using MEGA7 software and the neighbor-joining method. Results show that the phylogeny tree was divided into 2 clades, the group (closely related group) and out-group (distantly related group). It is confirmed that the position of the rotifer originating from Tumpaan Coastal Water is within in group, which has closely related to the B. plicatilis complex BUS06 indicated by a bootstrap value of 80%. The group belongs to SS-type rotifers with an average body size of 149±1.3 μm. This rotifer group has been known as live prey for fish larvae with a mouth-opening size of 150 μm.
KEMAMPUAN MENGHAMBAT DARI PEPTIDA SIKLIK YANG DIHASILKAN Prochloron didemni TERHADAP RESEPTOR KANKER KOLOREKTAL DAN PENYAKIT VIRUS DENGAN PENDEKATAN ANALISIS IN SILICO Inneke Rumengan; Angelina Goei; Rosita Lintang; Chatrien Sinjal; Trezya Pangemanan
JURNAL PESISIR DAN LAUT TROPIS Vol. 12 No. 2 (2024): JURNAL PESISIR DAN LAUT TROPIS
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.35800/jplt.12.2.2024.57696

Abstract

Mikroba endosimbion pada golongan Tunikata dari kelas Ascidiacea sudah ditemukan di Pesisir Malalayang, Teluk Manado. Prochloron didemni sebagai salah satu spesies mikroba fotosimbion pada ascidia dilaporkan menghasilkan berbagai peptida siklik seperti patelamida A, B, C, D, E, F, G dan H, serta ulitiasiklamida. Sebagai bagian dari eksplorasi potensi molekuler mikroba endosimbion tersebut, telah dilakukan analisis in silico untuk prediksi awal kemampuan hambat senyawa-senyawa peptida siklik tersebut terhadap reseptor-reseptor pada kanker kolorektal dan virus dengue dengan menggunakan perangkat lunak AutoDock Vina. Afinitas pengikatan molekul ligan terhadap reseptor yang ditunjukkan dengan nilai ΔG.   Besaran nilai ΔG terkecil diperoleh dari hasil penambatan patelamida A terhadap reseptor virus dengue (ΔG = -14,84), jelas mengindikasikan betapa efektifnya senyawa ini dapat menghambat virus tersebut. Kemampuan ulitiasiklamida juga ternyata sama kuatnya dalam menghambat kedua reseptor kanker kolorektal (ΔG = -14,1 dan -14,42), setara dengan obat, irinotecan. Kemampuan antikanker dan antivirus juga dimiliki oleh senyawa-senyawa patelamida lainnya, sehingga dapat disimpulkan peptida siklik yang dihasilkan oleh mikroba endosimbion P. didemni mempunyai peluang untuk dikembangkan sebagai obat antikanker dan antivirus. Tentu saja, dalam hal ini perlu dilakukan uji-uji  klinik standar ke depan. Kata kunci: peptida siklik, Prochloron didemni, in silico, antikanker, antivirus