Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
0
P-Index
This Author published in this journals
All Journal JURNAL KIMIA SAINS DAN APLIKASI
Dwi Hudiyanti
Chemistry Department, Faculty of Sciences and Mathematics, Diponegoro University Jl. Prof. Soedarto, SH., Tembalang, Semarang
Chemical Engineering, Chemistry & Bioengineering Chemistry Engineering

Published : 3 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 3 Documents
Search

 1 
Interaction Studies Between Cyclic Peptide ADT-C3 (Ac-CADTPC-NH2) with E-Cadherin Protein using the Molecular Docking Method Simulated on 120ns Parsaoran Siahaan; Vivitri Dewi Prasasty; Atiatul Manna; Dwi Hudiyanti
Jurnal Kimia Sains dan Aplikasi Vol 21, No 2 (2018): Volume 21 Issue 2 Year 2018
Publisher : Chemistry Department, Faculty of Sciences and Mathematics, Diponegoro University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (744.917 KB) | DOI: 10.14710/jksa.21.2.85-91

Abstract

The treatment of diseases that attack the brain is very difficult, because the delivery of drug molecules to the brain is often hindered by the blood-brain barrier (BBB). So that the drug delivery is not right on the target cell. Thus, was developed a method in modulation of intercellular junctions using ADTC3 cadherin peptide, Where the cadherin peptide is derived from the cadherin sequence itself. The method used in this research is molecular dynamics (DM) and molecular docking. In this study have been evaluated some peptide conformation in modulating intercellular junction. The results show that cyclic peptide ADT-C3 (Ac-CADTPC-NH2) was conducted DM for 120 ns (120000 ps), which has considerable activity in modulating intercellular junctions with binding energies of -33.10 kJ.mol-1 and Ki of 1.58 μM at the 79187 ps conformation. The binding site on residues Asp1, Trp2, Ile4, Lys25, Ser26, Asn27, Met92 in the adhesion arm-acceptor pocket region.
Molecular Docking of Interaction between E-Cadherin Protein and Conformational Structure of Cyclic Peptide ADTC3 (Ac-CADTPC-NH2) Simulated on 20 ns Atiatul Manna; Marlyn Dian Laksitorini; Dwi Hudiyanti; Parsaoran Siahaan
Jurnal Kimia Sains dan Aplikasi Vol 20, No 1 (2017): Volume 20 Issue 1 Year 2017
Publisher : Chemistry Department, Faculty of Sciences and Mathematics, Diponegoro University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (695.527 KB) | DOI: 10.14710/jksa.20.1.30-36

Abstract

Pengobatan penyakit yang menyerang otak sangat sulit dilakukan karena penghantaran molekul obat menuju otak terhalang oleh molekul-molekul blood-brain barrier (BBB). Untuk mengatasinya telah dikembangkan metode baru dengan memodulasi junction antar sel menggunakan peptida. Salah satu peptida yang diperkirakan mampu memodulasi adalah ADTC3, yang diturunkan dari susunan asam amino kadherin. Modulasi terjadi diduga karena interaksi antara ADTC3 dengan E-kadherin. Pada penelitian ini telah dihitung energi interaksi antara ADTC3 dengan E-kadherin. Metode yang digunakan adalah dinamika molekul (DM) dan molecular docking. Hasil penelitian menunjukkan bahwa peptida siklik ADTC3 (Ac-CADTPC-NH2) hasil simulasi 20 ns (20.000 ns) berinteraksi kuat dengan domain EC1 E-kadherin dengan energy binding sebesar -31,55 kJ.mol-1 dan tetapan inhibisi Ki sebesar 2,96 µM pada konformasi ke-4487. Interaksi yang kuat ini diperkirakan sebagai daya penggerak memodulasi junction antar sel. Interaksi antara ADTC3 dengan E-kadherin terjadi pada situs residu E-kadherin Asp1, Trp2, Val3, Ile4, Lys25, Met92 yang berada pada daerah adhesion arm-acceptor pocket.
Studi Pendahuluan tentang Enkapsulasi Vitamin C dalam Liposom Kelapa (Cocos nucifera L.) Dwi Hudiyanti; Desita Triana; Parsaoran Siahaan
Jurnal Kimia Sains dan Aplikasi Vol 20, No 1 (2017): Volume 20 Issue 1 Year 2017
Publisher : Chemistry Department, Faculty of Sciences and Mathematics, Diponegoro University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (425.414 KB) | DOI: 10.14710/jksa.20.1.5-8

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari enkapsulasi vitamin C dalam liposom kelapa (Cocos nucifera L.). Efisiensi enkapsulasi liposom kelapa diperoleh sebesar 80,76%. Penambahan kolesterol pada membran liposom mempengaruhi besarnya efisiensi enkapsulasi. Penambahan kolesterol sebesar 30% meningkatkan efisiensi enkapsulasi menjadi sebesar 92,71%. Suhu mempengaruhi kemampuan liposom kelapa untuk menyimpan vitamin C dalam 8 hari. Penyimpanan pada suhu 5°C menurunkan kebocoran liposom kelapa.Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari enkapsulasi vitamin C dalam liposom kelapa (Cocos nucifera L.). Efisiensi enkapsulasi liposom kelapa diperoleh sebesar 80,76%. Penambahan kolesterol pada membran liposom mempengaruhi besarnya efisiensi enkapsulasi. Penambahan kolesterol sebesar 30% meningkatkan efisiensi enkapsulasi menjadi sebesar 92,71%. Suhu mempengaruhi kemampuan liposom kelapa untuk menyimpan vitamin C dalam 8 hari. Penyimpanan pada suhu 5°C menurunkan kebocoran liposom kelapa.
Co-Authors Atiatul Manna Desita Triana Marlyn Dian Laksitorini Parsaoran Siahaan Vivitri Dewi Prasasty