Sainstech Farma: Jurnal Ilmu Kefarmasian
Vol 15 No 2 (2022): Sainstech Farma: Jurnal Ilmu Kefarmasian

Molecular Docking Senyawa Caboxamycin Pada Mycobacterium tuberculosis Polyketide Synthase 13 (Pks13)

Puspitasari, Lia (Unknown)
Nur Aripin, Iis Sumiyati (Unknown)
Setyaningsih, Erwi Putri (Unknown)



Article Info

Publish Date
20 Aug 2022

Abstract

Senyawa caboxamycin merupakan antibiotik baru yang termasuk dalam kelompok benzoxazole yang diproduksi oleh Streptomyces sp. NTK 937 (marine strain). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui mekanisme penghambatan senyawa caboxamycin terhadap Mycobacterium tuberculosis polyketide synthase 13 (Pks13) secara in silico dengan metode molecular docking. Tahapan molecular docking dimulai dengan optimasi struktur senyawa caboxamycin dan streptomisin (kontrol positif) 3D, preparasi protein Pks13, validasi metode, serta docking senyawa caboxamycin dan streptomisin yang teroptimasi pada protein Pks13. Hasil docking protein Pks13 pada ligan standar adalah -144,0 kkal/mol, pada streptomisin adalah -101,7 kkal/mol, dan pada caboxamycin adalah -75,9 kkal/mol. Streptomisin dan caboxamycin memiliki ikatan hidrogen yang sama terhadap residu asam amino protein Pks13 yaitu ASN-1640 dan HIS-1664, sehingga caboxamycin memiliki mekanisme kerja dalam menghambat Pks13 pada M.tuberculosis secara in silico. Senyawa caboxamycin memiliki mekanisme molekuler dalam menghambat protein Pks13 yang ditunjukkan dengan adanya pembentukkan ikatan hidrogen, sehingga senyawa caboxamycin berpotensi sebagai antituberkulosis secara in silico.

Copyrights © 2022






Journal Info

Abbrev

saintechfarma

Publisher

Subject

Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Immunology & microbiology Medicine & Pharmacology Public Health

Description

Jurnal ini memuat artikel penelitian kefarmasian meliputi kimia farmasi, biologi farmasi, bahan alam farmasi, teknologi farmasi, farmasi komunitas dan klinis, serta bioteknologi ...