Jurnal Pustaka Data : Pusat Akses Kajian Database, Analisa Teknologi, dan Arsitektur Komputer
Vol 5 No 1 (2025): Jurnal Pustaka Data (Pusat Akses Kajian Database, Analisa Teknologi, dan Arsitekt

Analisis Data Biologis dalam Mengidentifikasi Gen atau Protein yang Memiliki Pola Ekspresi Serupa

Akmal, Muhammad Haikal (Unknown)
Pangestu, Dimas (Unknown)
Siregar, Dzilhulaifa (Unknown)
Harahap, Khaila Mukti (Unknown)
Furqan, Mhd. (Unknown)



Article Info

Publish Date
19 Jun 2025

Abstract

Ekspresi protein dalam data biologis umumnya memiliki kompleksitas tinggi dan dimensi besar, sehingga menyulitkan pengenalan pola secara langsung. Studi ini memanfaatkan algoritma Spectral Clustering untuk mengeksplorasi struktur tersembunyi dalam kumpulan data ekspresi protein. Langkah awal mencakup pembersihan data dengan imputasi nilai hilang menggunakan metode rata-rata serta normalisasi fitur numerik menggunakan StandardScaler. Dataset terdiri dari 1.080 observasi dan 77 atribut numerik hasil percobaan pada tikus. Proses pengelompokan dilakukan dengan pendekatan berbasis graf, menggunakan parameter empat klaster dan afinitas nearest neighbors. Selanjutnya, dilakukan reduksi dimensi melalui teknik Principal Component Analysis (PCA) untuk menghasilkan representasi dua dimensi yang mudah divisualisasikan. Hasil pengelompokan memperlihatkan pemisahan yang mencerminkan perbedaan biologis antar sampel. Hal ini menunjukkan bahwa metode tak terawasi seperti Spectral Clustering efektif dalam mengungkap struktur laten pada data ekspresi protein dan dapat menjadi dasar bagi analisis klasifikasi berbasis karakteristik biologis.

Copyrights © 2025






Journal Info

Abbrev

pustakadata

Publisher

Subject

Computer Science & IT Control & Systems Engineering Electrical & Electronics Engineering Industrial & Manufacturing Engineering Mechanical Engineering

Description

Jurnal Pustaka Data adalah sebuah jurnal Double blind peer-review yang didedikasikan untuk publikasi hasil penelitian yang berkualitas dalam bidang ilmu komputer. Semua publikasi di Jurnal Pustaka Data bersifat akses terbuka yang memungkinkan artikel tersedia secara bebas online tanpa berlangganan ...