Jambura Journal of Chemistry
Vol 6, No 2 (2024): August

Analisis Kemiripan Obat, Prediksi Toksisitas dan Studi Molecular Docking Metabolit Sekunder Dari Streptomyces carpaticus Terhadap Protein Caspase-3 Sebagai Antikanker Leukemia

Suduri, Adam (Unknown)
Darusman, Huda Shalahudin (Unknown)
Mariya, Silmi (Unknown)



Article Info

Publish Date
11 Oct 2025

Abstract

Caspase-3 merupakan enzim protease yang berperan dalam proses apoptosis, dan menjadi target senyawa metabolit dalam menghambat pertumbuhan sel kanker. Tujuan penelitian adalah untuk mengetahui sifat kemiripan obat metabolit sekunder hasil produksi Streptomyces carpaticus yang diperoleh berdasarkan analisis klaster gen biosintesis pada program antiSMASH version 7.1.0, mengetahui hasil prediksi mutagenicity dan toxicity serta mengetahui hasil interaksi metabolit sekunder dengan protein Caspase-3 yang merupakan reseptor terkait sel kanker leukemia menggunakan molecular docking. Hasil analisis kemiripan obat dan prediksi ADME menunjukkan bahwa ketiga metabolit memenuhi aturan Lipinski Rule of Five dan memiliki kemiripan dengan obat. Ketiga metabolit tergolong pada Toxicity Class 5, dan memiliki sifat mutagenic inactive dengan probability Pristinol: 0.93, Raimonol: 0.91 dan Cyslabdan: 0.80 dan toxicity inactive dengan probability Pristinol: 0.75, Raimonol: 0.94 dan Cyslabdan: 0.76. Hasil studi molecular docking, analisis dan validasi situs ikatan dengan protokol penambatan ulang (redocking) ligan standar 5-[4-(1-carboxymethyl-2-OXO-propylcarbamoyl)-benzylsulfamoyl]-2-Hydroxy-Benzoic Acid memiliki nilai RMSD yaitu 0.000. Energi ikatan bebas masing-masing ligan yaitu sebesar -8,9 kkal/mol -9.2 kkal/mol, -7.0 kkal/mol, -7.1 kkal/mol, dan -7.0 kkal/mol. Hasil ini menunjukan bahwa energi ikatan hasil penambatan metabolit sekunder dengan protein Caspase-3 yang paling baik adalah metabolit cyslabdan dengan nilai ikatan bebas -7.4 kkal/mol dan jumlah interaksi 12.

Copyrights © 2024






Journal Info

Abbrev

jjc

Publisher

Subject

Chemistry

Description

Jambura Journal of Chemistry is peer-reviewed and open access journal published by Chemistry Depertment, Faculty Mathematic and Natural Science. Jam.J.Chem that publishes original research articles, review articles, as well as short communication in all areas of chemistry including applied ...