Proceeding Biology Education Conference
Vol 20, No 1 (2023): Proceeding Biology Education Conference

Inverse Docking dan Identifikasi Protein Target Metabolik Sekunder Senna siamea terhadap Propionibacterium acnes

Neila Putri Shofiyana (Universitas Islam Negeri Sayyid Ali Rahmatullah Tulungagung)
Achmad Nurul Yaqin (Universitas Sebelas Maret)



Article Info

Publish Date
29 Dec 2023

Abstract

Tanaman johar (Senna siamea) diketahui memiliki aktivitas antibakteri dan telah banyak dimanfaatkan sebagai obat tradisional khususnya daunnya. Aktivitas antibakteri ekstrak daun johar telah banyak dilaporkan mampu menghambat pertumbuhan baik bakteri Gram positif dan Gram negatif. Dibandingkan bakteri lain, Konsentrasi Hambat Minimum (MIC) ekstrak daun johar terhadap Propionibacterium acnes dilaporkan jauh lebih rendah. Namun, mekanisme antibakteri dan protein reseptor targetnya belum diketahui. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan protein target utama dan senyawa aktif dalam S. siamea untuk memahami mekanisme antibakterinya. Metode yang digunakan adalah molekuler docking senyawa yang dilaporkan pada ekstrak S. siamea pada beberapa protein bakteri P. acnes menggunakan Swissdock. Hasil dengan konformasi paling stabil dianalisis lebih lanjut dengan metode Density Functional Theory (DFT) menggunakan Gaussian 09 pada level teori HF/3-21G dan semiempirik PM6 dilanjutkan dengan analisis Interaksi Non-Kovalen (NCI) menggunakan Multiwfn. Kesimpulan dari penelitian ini adalah lipase pembentuk biofilm adalah protein target dari senyawa polar dalam daun S. siamea terutama siamosida A.

Copyrights © 2023






Journal Info

Abbrev

prosbi

Publisher

Subject

Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Materials Science & Nanotechnology Medicine & Pharmacology Public Health

Description

Proceeding Biology Education Conference was published since 2003, with title Prosiding Seminar Nasional Biologi. The early number of the journal were published ...