Analisis Variasi Genetik Gen L1 HPV (Human Papillomavirus) TIPE 16 Asal Sumatera Barat

Andre Prima Rahmadhana (Fakultas Farmasi Universitas Andalas Padang)
Marlina Marlina (Fakultas Kedokteran Universitas Andalas Padang)
Akmal Djamaan (Agroekoteknologi Fakultas Pertanian Universitas Andalas)
Andani Eka Putra (universitas andalas)
Ifan Aulia Candra (universitas andalas)

Menara Ilmu
Vol 20, No 2 (2026): Vol 20 No. 02 APRIL 2026

Variasi nukleotida gen L1 terhadap data terkait di Gene Bank dilakukan dengan menggunakan 5 isolat DNA tipe 16 asal sumbar dimana setelah diamplifikasi hanya 2 yang berhasil di amplifikasi dan dilanjutkan dengan tahap sekuensing yakni sampel 3 dan sampel 4. Analisis dilakukan  menggunakan data sekuensing untuk kemudian dilakukan blast, konstruksi pohon filogenetik. Hasil analisis data sekuensing menunjukkan  sampel 3 memiliki kekerabatan dengan sekuen L1 di Gene Bank KU.9551191.1 dan sampel 4 memiliki kekerabatan dengan sekuen L1 JX313706.1. Kata Kunci: Gen L1, pohon filogenetik, primer BLAST, HPV 16, sekuensing.