Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
0.817
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Journal Of Vocational Health Studies Jurnal SOLMA Jurnal Riset Kesehatan Poltekkes Depkes Bandung
Fusvita Merdekawati
Unknown Affiliation
Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Dentistry Health Professions Immunology & microbiology Medicine & Pharmacology Nursing Public Health Other

Published : 7 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 7 Documents
Search

 1 
OPTIMASI VOLUME TEMPLAT DNA DAN SUHU DENATURASI UNTUK DETEKSI Brugia malayi MENGGUNAKAN REAL-TIME PCR Shafira Azzahra; Fusvita Merdekawati; Acep Tantan Hardiana; Yuliansyah Sundara Mulia; Ernawati Ernawati
JURNAL RISET KESEHATAN POLTEKKES DEPKES BANDUNG, Online ISSN 2579-8103 Vol 11 No 2 (2019): Jurnal Riset Kesehatan Poltekkes Depkes Bandung
Publisher : Poltekkes Kemenkes Bandung

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (588.338 KB) | DOI: 10.34011/juriskesbdg.v11i2.740

Abstract

Filariasis limfatik telah menjadi masalah kesehatan masyarakat di Indonesia sejak lama, lebih dari 70% kasus filariasis di Indonesia disebabkan oleh Brugia malayi. Tes PCR memiliki sensitivitas dan spesfitas yang lebih tinggi daripada kebanyakan tes lainnya. Real-time PCR adalah suatu metode dengan menggunakan fluoresens yang dapat mendeteksi DNA Brugia malayi. Volume templat DNA dan suhu denaturasi adalah komponen yang perlu dioptimasi karena keduanya menentukan kualitas produk real-time PCR. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan volume templat DNA dan suhu denaturasi yang optimal untuk deteksi Brugia malayi. Jenis penelitian yang digunakan adalah eksperimen perbandingan kelompok statis. Variasi dari volume templat DNA yang dioptimasi adalah 2 µL, 3 µL, 4 µL dan 5 µL sedangkan variasi dari suhu denaturasi yang dioptimasi adalah 93ºC, 95ºC dan 97ºC. Pada penelitian ini templat DNA yang digunakan adalah templat DNA murni Brugia malayi. Data yang digunakan adalah data primer yang didapatkan dari pengukuran nilai Ct (cycle threshold) pada setiap reaksi yang di optimasi. Hasil menunjukkan bahwa volume templat DNA 5 µL dan suhu denaturasi 93°C memiliki nilai Ct yang paling kecil. Pada penelitian ini, kondisi optimum untuk volume templat DNA adalah 5 µL dan suhu denaturasi adalah 93°C.
OPTIMASI VOLUME TEMPLAT DNA DAN JUMLAH SIKLUS AMPLIFIKASI UNTUK DETEKSI Wuchereria bancrofti METODE REAL-TIME PCR Anisa Safanah; Ai Djuminar; Fusvita Merdekawati; Entuy Kurniawan; Ernawati Ernawati
JURNAL RISET KESEHATAN POLTEKKES DEPKES BANDUNG, Online ISSN 2579-8103 Vol 11 No 2 (2019): Jurnal Riset Kesehatan Poltekkes Depkes Bandung
Publisher : Poltekkes Kemenkes Bandung

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (418.883 KB) | DOI: 10.34011/juriskesbdg.v11i2.741

Abstract

Filariasis yang disebabkan oleh Wuchereria bancrofti masih menjadi masalah kesehatan di Indonesia. Pemeriksaan mikroskopis darah sebagai gold standard memiliki beberapa kelemahan, sehingga diagnosis klinis berbasis Biologi Molekuler mulai dikembangkan, khususnya metode Real-Time PCR. Pada penelitian ini untuk mencapai hasil terbaik dilakukan optimasi terhadap volume templat DNA dan jumlah siklus amplifikasi. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui berapa volume templat DNA dan jumlah siklus amplifikasi yang optimum untuk deteksi Wuchereria bancrofti dengan menggunakan metode Real-Time PCR. Jenis penelitian yang digunakan adalah eksperimen semu. Desain penelitian yang dilakukan yaitu dibuat matriks terhadap volume templat DNA dan jumlah siklus amplifikasi yaitu 2;30, 3;30, 4;30, 2;35, 3;35, 4;35, 2;40, 3;40, 4;40, kemudian dilakukan pemeriksaan dari produk templat DNA Wuchereria bancrofti. Analisis data menggunakan grafik hasil amplifikasi berupa nilai Ct (cycle threshold). Dari hasil penelitian menunjukkan kondisi optimal untuk volume templat DNA adalah 2µL, sedangkan untuk jumlah siklus amplifikasi adalah 35 siklus.
OPTIMASI SUHU ANNEALING DAN KONSENTRASI PRIMER UNTUK DETEKSI Brugia malayi MENGGUNAKAN REAL-TIME PCR Yesicha Putri Siswanto; Fusvita Merdekawati; Ernawati Ernawati; Acep Tantan Hardiana; Entuy Kurniawan
JURNAL RISET KESEHATAN POLTEKKES DEPKES BANDUNG, Online ISSN 2579-8103 Vol 11 No 1 (2019): Jurnal Riset Kesehatan Poltekkes Depkes Bandung
Publisher : Poltekkes Kemenkes Bandung

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (672.684 KB) | DOI: 10.34011/juriskesbdg.v11i1.791

Abstract

Filariasis disebabkan oleh infeksi cacing filarial dan ditularkan melalui nyamuk. Di Indonesia, 70% Filariasis disebabkan oleh Brugia malayi. Dari berbagai metode diagnosis yang ada, Real-time PCR banyak digunakan karena lebih sensitif dan spesifik. Perlu dilakukan optimasi sebelum melakukan pengujian, diantaranya optimasi suhu annealing dan konsentrasi primer. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui suhu annealing dan konsentrasi primer yang optimal untuk deteksi B. malayi. Jenis penelitian yang dilakukan adalah eksperimen semu (quasi eksperiment) dengan menentukan reaski optimal berdasarkan nilai Cycle threshold yang diamati melalui kurva amplifikasi. Optimasi suhu annealing dilakukan dengan variasi suhu 53oC, 54oC, 55oC, 56oC, 57oC. Sedangkan primer SLX-F dan SLX-R, yang digunakan dalam penelitian ini, dibuat variasi konsentrasi 10µM; 7,5µM; 5µM Real-time PCR ESCO Swift Spectrum 48. Berdasarkan hasil penelitian diketahui, konsentrasi primer 10µM pada suhu 55oC menghasilkan nilai Ct optimal (14,4) dibandingkan dengan semua variasi reaksi yang diujikan
OPTIMIZATION OF CONCENTRATION AND SOAKING TIME OF HARRIS HEMATOXYLIN IN DNA BAND EXAMINATION USING ELECTROPHORESIS Fajri, Siti Nuristiqomah; Asep Iin Nur Indra; Fusvita Merdekawati; H. , Acep Tantan
Journal of Vocational Health Studies Vol. 8 No. 1 (2024): July 2024 | JOURNAL OF VOCATIONAL HEALTH STUDIES
Publisher : Faculty of Vocational Studies, Universitas Airlangga

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.20473/jvhs.V8.I1.2024.35-41

Abstract

Background: Deoxyribonucleic acid (DNA) molecules can be effectively visualized when stained and observed under ultraviolet light during the electrophoresis process. The commonly used dye Ethidium bromide (EtBr) is considered hazardous due to its potential to cause mutations, cancer, and congenital disabilities. Various alternative dyes have been reported, one of which is hematoxylin. Hematoxylin compounds do not have mutagenic potential and are easier to apply than EtBr. However, there is no optimal variation in concentration and duration of staining for clear and effective visualization of DNA bands. Purpose: To find the concentration and staining time of harris hematoxylin staining for DNA bands from agarose gel electrophoresis. Method: An experimental method with a group comparison statistical design. The amplified DNA I6S rRNA gene from Escherichia coli (584 bp), which had undergone electrophoresis, was stained using harris hematoxylin dye at 0.01%; 0.02%; 0.03%; 0.04%; and 0.05% concentrations and immersion times soaking times of 10, 15, 20, and 30 minutes variations. The intensity of the DNA bands was analyzed using ImageJ. The staining power of the experimental groups was compared to the intensity of control dye and given a grading score of 1 - 4. The experiment was repeated twice, and the mean grading score was calculated. The highest mean value was considered the most optimal value. Result: A concentration of 0.02% showed relatively constant staining intensity for each soaking time. A mean value of 3.5 was obtained for a 0.01% concentration for 15 minutes. A 0.03% and 0.04% concentrations for 20 minutes. Conclusion: The highest mean value of 4 was obtained for Harris hematoxylin at 0.05% for 15 minutes.
OPTIMIZATION OF DENATURATION TEMPERATURE AND TIME USING REAL-TIME PCR METHOD IN HEPATITIS B TEST Tanti Yulia Dewi; Fusvita Merdekawati; Ai Djuminar; Yogi Khoirul Abror
Journal of Vocational Health Studies Vol. 8 No. 2 (2024): November 2024 | JOURNAL OF VOCATIONAL HEALTH STUDIES
Publisher : Faculty of Vocational Studies, Universitas Airlangga

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.20473/jvhs.V8.I2.2024.131-136

Abstract

Background: The hepatitis B test can be conducted using the real-time PCR method. In chronic cases, the test is performed by detecting one of the Hepatitis B Virus (HBV) specific genes, HBcAg. The real-time PCR method requires optimization to obtain optimal results. Purpose: This research aims to determine the optimal temperature and time for denaturation in the hepatitis B test using the real-time PCR method. Method: The research method used was a quasi-experiment involving variations in temperature (94 °C, 95 °C, and 96 °C) and time (10 seconds, 15 seconds, and 20 seconds) for denaturation. Data processing resulted in static group comparisons based on 27 primary data from the Cycle Threshold (CT) value. Result: Variations in temperature conditions, specifically at 94 °C, 95 °C, and 96 °C, combined with a denaturation time of 10 seconds, yielded the mean CT values of 26.495, 26.355, and 26.003, respectively. When the temperature conditions were maintained at 94 °C, 95 °C, and 96 °C, with a denaturation time of 15 seconds, yielded the mean CT values of 25.962, 25.641, and 25.396. Similarly, under temperature conditions of 94 °C, 95 °C, and 96 °C with a denaturation time of 20 seconds, yielded the mean CT values of 26.544, 26.505, and 25.830 were obtained. Conclusion: Optimal results in this study are obtained through the acquisition of the smallest CT value, namely at temperature conditions of 96 °C and 15 seconds.
OPTIMIZATION OF ANNEALING TEMPERATURE AND PRIMER CONCENTRATION OF CYTOCHROME B (CYT B) GENE FOR PIG DNA DETECTION WITH REAL-TIME PCR METHOD Novia Azahra Fatoni; Ai Djuminar; Acep Tantan Hardiana; Fusvita Merdekawati
Journal of Vocational Health Studies Vol. 8 No. 3 (2025): March 2025 | JOURNAL OF VOCATIONAL HEALTH STUDIES
Publisher : Faculty of Vocational Studies, Universitas Airlangga

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.20473/jvhs.V8.I3.2025.164-170

Abstract

Background: One company in Indonesia has developed a pig DNA detection kit by designing primers with the real-time Polymerase Chain Reaction (PCR) method using the cytochrome b (cyt b) gene. It is necessary to optimize the PCR process to optimize pig DNA detection, including annealing temperature and primer concentration, which can increase sensitivity, specificity, and precision. Purpose: This research aims to determine the optimum annealing temperature and primer concentration for the detection of pig DNA using cyt b gene. Method: In this research, the extracted sample isolates were subjected to 12 treatments with 2 repetitions. Optimal data analysis was based on the lowest Cycle Threshold (CT) value in the amplification curve. Result: Out of a total of 24 samples, an increase in the CT value was observed at annealing temperatures of 57 °C, 59 °C, and 60 °C compared to 58 °C, across various primer concentrations. The primer concentrations with the lowest CT values were successively found to be 0.4 μM, 0.3 μM, and 0.2 μM. Conclusion: The results of the research that has been conducted indicate that the optimal annealing temperature for detecting pig DNA using the cyt b gene in this research is 58 °C, and the optimal concentrations of forward and reverse primers are 0.4 μM.
Optimalisasi Laboratorium Poltekkes Kemenkes Bandung dalam Pemeriksaan COVID-19 Pada Era Adaptasi Kebiasaan Baru Entuy Kurniawan; Dewi, Novi Utami; Fusvita Merdekawati
Jurnal SOLMA Vol. 12 No. 1 (2023)
Publisher : Universitas Muhammadiyah Prof. DR. Hamka (UHAMKA Press)

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22236/solma.v12i1.9042

Abstract

Background: Real Time PCR merupakan metode yang diakui secara cepat dan akurat mendeteksi infeksi COVID-19. Untuk mempercepat penanganan Covid-19 dengan melaksanakan pemeriksaan Real time PCR seiring dengan era adaptasi kebiasaan baru khususnya di Kota Cimahi. Metode: Peningkatan kapasitas SDM dalam melakukan pemeriksaan PCR dengan mengikuti pelatihan daring yang diselenggarakan oleh Pusat Litbang Biomedis dan Teknologi Dasar Kesehatan, Gugus Tugas Percepatan Penanganan Covid-19/BNPB, Organisasi profesi Perguruan Tinggi serta BBKPM Bandung. Hasil: Cakupan pelayanan pemeriksaan PCR specimen dari Kota Cimahi di Tahun 2020 sampai 2 Agustus 2021 sebesar 5,95 %. Tercapainya target hasil dapat diselesaikan maksimal 2 x 24 jam serta input data All record TC-19 100%. Kesimpulan: Laboratorium Biomolekuler Poltekkes Kemenkes Bandung telah membantu mengatasi permasalahan mitra berkenaan dengan keterbatasan laboratorium pemeriksaan yang memiliki standar kualifikasi Biosafety laboratory level 2, untuk penanganan COVID-19 lebih baik.
Co-Authors Acep Tantan Hardiana Ai Djuminar Anisa Safanah Asep Iin Nur Indra Entuy Kurniawan Ernawati Ernawati Fajri, Siti Nuristiqomah H. , Acep Tantan Novi Utami Dewi Novia Azahra Fatoni Shafira Azzahra Tanti Yulia Dewi Yesicha Putri Siswanto Yogi Khoirul Abror Yuliansyah Sundara Mulia