Claim Missing Document
Check
Articles

Found 6 Documents
Search

IDENTIFIKASI BAKTERI ASAM LAKTAT DARI HASIL FERMENTASI SELADA ROMAIN (Lactuca sativa var. longifolia Lam.) MENGGUNAKAN GEN 16S rRNA Gani, Maria A; Tallei, Trina E; Fatimawali, Fatimawali
PHARMACON Vol 8, No 1 (2019): PHARMACON
Publisher : UNIVERSITAS SAM RATULANGI

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.35799/pha.8.2019.29237

Abstract

ABSTRACT            Lactic acid bacteria (LAB) is a group of bacteria that produce lactic acid as the major metabolic end product of carbohydrate fermentation. LAB are highly beneficial because of their probiotic potential properties and as functional starter cultures in food fermentation. This study was aimed to identify the LAB species isolated from romaine lettuce fermented product by using molecular identification method with 16S rRNA gene marker. The fermented product was diluted and spread onto MRS agar supplemented with 1% of CaCO3 and then purified by using streak method. Both isolates were positive Gram bacteria and gave negative results from catalase test. The result of molecular identification showed that LAB from romaine lettuce fermented product have each 99 and 100% similarity to Enterococcus faecium that known have properties as probiotic potential and functional culture starter.Key words: lactic acid bacteria, fermentation, probiotic, Enterococcus faecium, Lactuca sativa var. Longifolia Lam.             ABSTRAK             Bakteri asam laktat (BAL) merupakan bakteri yang menghasilkan asam laktat sebagai metabolit utamanya dalam fermentasi karbohidrat. BAL merupakan bakteri yang menguntungkan karena memiliki aktivitas probiotik potensial dan dapat berguna sebagai starter dalam proses fermentasi makanan. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies BAL yang diisolasi dari hasil fermentasi selada romain menggunakan metode identifikasi molekuler dengan gen penanda 16S rRNA. Cairan hasil fermentasi diencerkan dan ditebar pada media MRS agar yang telah dicampur dengan CaCO3 1% dan kemudian dimurnikan menggunakan metode streak plate. Kedua isolat merupakan bakteri Gram positif dan menunjukkan hasil negatif pada uji katalase. Hasil identifikasi molekuler menunjukkan bahwa  kedua BAL hasil fermentasi selada romain memiliki kemiripan masing-masing 99 dan 100 % dengan Enterococcus faecium yang diketahui memiliki aktivitas probiotik.Kata Kunci: bakteri asam laktat, fermentasi, probiotik, Enterococcus faecium, Lactuca sativa var. longifolia Lam.
Uji Antibakteri Nanopartikel Kitosan terhadap Pertumbuhan Bakteri Staphylococcus aureus dan Escherichia coli. Magani, Alce K; Tallei, Trina E; Kolondam, Beivy J
JURNAL BIOS LOGOS Vol 10, No 1 (2020): JURNAL BIOS LOGOS
Publisher : Universitas Sam Ratulangi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.35799/jbl.10.1.2020.27978

Abstract

Uji Antibakteri Nanopartikel Kitosan terhadap Pertumbuhan Bakteri Staphylococcus aureus dan Escherichia coli.(Antibacterial Test of Chitosan Nanoparticles against Staphylococcus aureus and Escherichia coli) Alce K. Magani*, Trina E. Tallei, Beivy J. KolondamProgram Studi Biologi, FMIPA Universitas Sam Ratulangi, Manado 95115*Email korespondensi: alcemagani@gmail.com (Article History: Received 30-12-2019; Revised 15-01-2020; Accepted 23-01-2020) Abstrak Antibakteri merupakan zat yang dapat menghambat pertumbuhan bakteri dan dapat membunuh bakteri penyebab infeksi. Staphylococcus aureus dan Escherichia coli merupakan bakteri Gram positif dan Gram negatif yang dapat menimbulkan infeksi atau penyakit dalam tubuh. Penelitian ini bertujuan untuk menguji aktivitas bakteri patogen dengan memakai nanopartikel kitosan sebagai antibakteri yang dibuat dalam empat konsentrasi (0,5%, 1%, 1,5% dan 2%) serta penggunaan kontrol asam asetat 1%, ciprofloxacin dan air steril sebagai pembanding. Metode penelitian yang digunakan yaitu metode gelasi ionik untuk pembuatan nanopartikel kitosan dan difusi agar untuk pengujian antibakteri. Data dianalisis dengan One Way Anova yang dilanjutkan dengan metode BNT (Beda Nyata Terkecil). Hasil penelitian diperoleh penghambatan pertumbuhan bakteri S. aureus dan E. coli tertinggi pada konsentrasi 0,5%, dengan diameter zona hambat hari pertama sampai hari ketiga 12,31 mm, 9,98 mm, dan 20,46 mm pada S. aureus dan 15,88 mm, 18,71 mm, dan 20,43 mm pada E. coli, kategori kuat, dan bersifat bakteriostatik dan penghambatan terendah pada konsentrasi 2% dengan diameter zona hambat pada S. aureus yaitu 5,56 mm, 5,50 mm, dan 5,40 mm, dan pada E. coli yaitu 5,93 mm, 9,64 mm, dan 12,58 mm, kategori sedang, dan bersifat bakteriostatik. Kata kunci: Kitosan, nanopartikel kitosan, aktivitas antibakteri.  Abstract Antibacteria is a substance that can inhibit the growth of bacteria and able to kill bacteria that cause infections. Staphylococcus aureus and Escherichia coli are Gram positive and Gram negative bacteria that able to cause infections or diseases. This study aimed to examine the activity of pathogenic bacteria by using chitosan nanoparticles as antibacterial. The treatments were made in four concentrations (0.5%, 1%, 1.5% and 2%) and, for comparison, there were also acetic acid control, ciprofloxacin and sterile water. The research method used is the ionic gelation method for the manufacture of chitosan nanoparticles and agar diffusion for antibacterial testing. Data were analyzed with One Way Anova followed by LSD (Least Significant Difference) method. The results showed the highest inhibition of growth of S. aureus and E. coli bacteria at a concentration of 0.5%, with a diameter of inhibition zones of the first day to the third day of 12.31 mm, 9.98 mm, and 20.46 mm in S. aureus and 15,88 mm, 18,71 mm, and 20,43 mm in E. coli, the strong category, and are bacteriostatic and the lowest inhibition was at 2% concentration with inhibition zone diameters in S. aureus namely 5.568 mm, 5.50 mm, and 5, 40 mm, and in E. coli, 5.93 mm, 9.63 mm and 12.58 mm, the medium category and bacteriostatic.Key words: Chitosan, nanoparticles chitosan, antibacterial activity.
Isolasi dan identifikasi bakteri asam laktat hasil fermentasi kol merah (Brassica oleracea L.) sebagai probiotik potensial (Isolation and identification lactic acid bacteria from red cabbage (Brassica oleracea L.) fermentation as potential probiotic) Rambitan, Grisella; Pelealu, Johanis J; Tallei, Trina E
JURNAL BIOS LOGOS Vol 8, No 2 (2018): JURNAL BIOSLOGOS
Publisher : Universitas Sam Ratulangi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.35799/jbl.8.2.2018.21447

Abstract

AbstrakBakteri asam laktat merupakan kelompok bakteri yang menghasilkan asam laktat sebagai produk utama dalam fermentasi. Bakteri ini sering disebut probiotik sebab memberikan dampak positif bagi tubuh manusia. Setiap spesies bakteri asam laktat memiliki efek probiotik yang berbeda-beda sehingga diperlukan seleksi dan identifikasi untuk mendapatkan strain probiotik yang baik. Identifikasi bakteri asam laktat dalam penelitian ini menggunakan metode identifikasi molekuler dengan gen penanda 16S rRNA. Bakteri asam laktat dari fermentasi kol merah memiliki kemiripan 100% dengan Weissella cibaria dan Weissella confusa. Analisis filogenetik menunjukkan hubungan kekerabatan antara isolat bakteri asam laktat dari fermentasi kol merah dengan bakteri genus Weissella yang lain.Kata kunci: bakteri asam laktat, fermentasi, 16S rRNA, probiotik AbstractLactic acid bacteria is a group of bacteria that produce lactic acid as the main product in fermentation. These bacteria are often called probiotics because can confer a positive impact on the human body. Each species of lactic acid bacteria has a different probiotic effect that requires selection and identification to obtain a good probiotic strain. The identification of lactic acid bacteria in this study used a method of molecular identification with a marker gene of 16S rRNA. Lactic acid bacteria from red cabbage fermentation have a 100% similarity to Weissella cibaria and Weissella confusa. Phylogenetic analysis showed a relationship between lactic acid bacteria isolates from red cabbage fermentation with bacteria from the other Weissella genus.Keywords: lactic acid bacteria, fermentation, 16S rRNA, probiotics
Variasi Gen matK dan Filogenetik Tumbuhan Kantong Semar (Nepenthes sp.) dari Gunung Mahawu dan Gunung Soputan di Sulawesi Utara (The Variation of matK Gene and the Phylogeny of Nepenthes sp. Obtained from Mount Mahawu and Mount Soputan in North Sulawesi) Tambuwun, Jenifer; Kolondam, Beivy J; Tallei, Trina E
JURNAL BIOS LOGOS Vol 7, No 1 (2017): JURNAL BIOSLOGOS
Publisher : Universitas Sam Ratulangi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.35799/jbl.7.1.2017.15816

Abstract

Abstrak Kantong semar (Nepenthes sp.) merupakan salah satu tumbuhan langka yang dilindungi. Eksploitasi yang berlebihan, serta alih fungsi hutan menjadi ancaman bagi kehidupan Nepenthes sp. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan variasi gen matK dari tumbuhan Nepenthes sp. di Gunung Mahawu (JTM) dan Gunung Soputan (JTS) di Sulawesi Utara dan membandingkannya dengan kerabat terdekat di GenBank, serta membuat pohon filogenetiknya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa hanya terdapat satu perbedaan nukleotida sekuens gen matK antara Nepenthes sp. dari Gunung Mahawu dan Gunung Soputan. Selain itu, variasi juga ditunjukan pada Nepenthes sp. yang diperoleh dari basis data GenBank dengan adanya perbedaan 1-7 basa nukleotida dengan sampel penelitian ini. Hasil analisis menggunakan ABGD (Automatic Barcode Gap Discovery) menunjukkan bahwa variasi intraspesies untuk Nepenthes sp. berada dalam rentang 0,000 – 0,004. Apabila mempertimbangkan barcode gap tersebut sebagai pembatas spesies, maka diasumsikan bahwa JTM, JTS, N. fusca, N. pilosa, N. maxima, N. faizaliana, dan N. clipeata merupakan spesies yang sama. Hal ini ditunjang oleh rekonstruksi pohon filogenetik menggunakan gen matK.Kata Kunci: ABGD, barcode gap, gen matK, Nepenthes sp., pohon filogenetik, variasi sekuens. Abstract Tropical pitcher plant (Nepenthes sp.) is listed as one of the endangered and protected plants. Excessive exploitation and forest conversion threaten the life of this Nepenthes sp. This research was aimed to determine variation in matK gene of Nepenthes sp. obtained from Mount Mahawu (JTM) and Mount Soputan (JTS) North Sulawesi, and compare the matK sequences with their allied taxa in public domain data base. Analysis of matK gene showed that there was only one nucleotide difference of matK gene sequence between Mahawu and Soputan samples. There were 1-7 different nucleotides between those samples and their allied taxa. Analysis of barcode gap using ABGD (Automatic Barcode Gap Discovery) showed that the range of intraspecies variation of Nepenthes sp. was 0,000 – 0,004. Considering this barcode gap generated from ABGD as species delimination, it could be assumed that JTM, JTS, N. fusca, N. pilosa, N. maxima, N. faizaliana, dan N. clipeata were the same species. These results were also supported by the reconstruction of phylogenetic tree using matK gene.Keywords: ABGD, barcode gap, matK gene, Nepenthes sp., phylogeneteic tree, sequence variation. 
Isolasi dan Identifikasi Bakteri Rizosfir Arachis pintoi setelah Inokulasi Mikoriza Arbuskular dan Penambahan Pupuk Organik (Isolation and Identification of Rhizosphere Bacteria in Arachis pintoi after the Inoculation of Arbuscular Mycorrhiza and The Addition of Organic Fertilizer) Pelealu, Johan Bhayangkara; Butarbutar, Regina Rosita; Tallei, Trina E
JURNAL BIOS LOGOS Vol 7, No 2 (2017): JURNAL BIOSLOGOS
Publisher : Universitas Sam Ratulangi

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.35799/jbl.7.2.2017.18575

Abstract

Abstrak Arachis pintoi (kacang pinto) sering digunakan sebagai pakan ternak, memiliki kemampuan hidup pada lahan marginal, dan mampu mengembalikan indeks kualitas tanah dari sangat rendah menjadi sedang tinggi, karena adanya bakteri dan fungi yang berperan di lingkungan rizosfir. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi bakteri rizosfir A. pintoi setelah inokulasi mikoriza arbuskular dan penambahan pupuk organik. Kacang pinto ditanam pada tanah yang diberi 20 g mikoriza arbuskular dan 500 g pupuk organik untuk setiap 3 kg tanah di dalam polibag. Setelah tanaman berusia 6 minggu, sebanyak 10 g tanah diambil dari lingkungan rizosfir kemudian dimasukan ke dalam gelas Erlenmeyer dan ditambahkan dengan 90 ml air suling steril. Sebanyak 1 ml suspensi hasil pengenceran 10-5 ditebar di atas media Nutrient Agar. Setiap koloni yang tumbuh dimurnikan dan diidentifikasi secara biokimiawi. Dari hasil identifikasi diperoleh 7 jenis bakteri rizosfir yaitu Azotobacter sp., Enterobacter sp., Rhizobium sp., Enterebocter sp., Azospirillum sp., Pseudomonas sp., dan Bacillus sp.Kata kunci: rizosfir, mikoriza arbuskular, Arachis pintoi, kacang pinto           Abstract Arachis pintoi (pinto bean) is often used as animal feed, has the ability to live on marginal land, and is able to provide soil quality from very low to high, due to the presence of bacteria and fungi that play a role in the rhizosphere. This study aims to identify the rhizosphere bacteria of A. pintoi after inoculation of arbuscular mycorrhizae and the addition of organic fertilizer. The pinto beans are grown on soil that has been given 20 g of arbuscular mycorrhizal and 500 g organic fertilizer for every 3 kg of soil in polybags. After the plants were 6 weeks old, 10 g of soil was taken from the rhizosphere environment then placed into the Erlenmeyer glass and added with 90 ml of sterile distilled water. A total of 1 ml 10-5 dilution, the suspension was spread over onto Nutrient Agar medium. Each growing colony is purified and identified biochemically. From this, 7 types of rhizosphere bacteria was identified, namely Azotobacter sp., Enterobacter sp., Rhizobium sp., Enterebocter sp., Azospirillum sp., Pseudomonas sp., and Bacillus sp.Keywords: rhizosphere, arbuscular mycorrhizae, Arachis pintoi, pinto bean
IDENTIFICATION OF POTENTIAL DIESEL OIL-DEGRADING BACTERIA ISOLATED FROM MANADO SEA PORT BASED ON 16S rRNA GENE Olivia H Abram; Trina E Tallei; Edwin de Queljoe; Beivy J Kolondam
JURNAL ILMIAH SAINS Volume 14 Nomor 2, Oktober 2014
Publisher : Sam Ratulangi University

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (289.928 KB) | DOI: 10.35799/jis.14.2.2014.5932

Abstract

ABSTRACT  Petroleum contamination and its derivate in ecosystem are considered as environmental threat all over the world. Some microorganisms exhibit potential to degrade hydrocarbon in contaminated environments. This study aims at identifying potential diesel oil-degrading bacteria grown on artificial media. Bacteria isolated from Manado Sea port were grown in nutrient agar containing artificial diesel oil plus salt water and diesel oil only, respectively. The growing bacteria were isolated and each of them was grown separately to obtain pure isolate. Three bacterial isolates namely AO2, OA3 and OA4 were identified using 16S rRNA gene as Pseudomonas aeroginosa, Klebsiella oxytoca, and Citrobacter sp, respectively. Keywords: diesel oil, diesel oil-degrading bacteria, Manado Sea Port, 16S rRNA gene IDENTIFIKASI BAKTERI YANG BERPOTENSI SEBAGAI PENDEGRADASI MINYAK DIESEL DI ISOLASI DARI PELABUHAN LAUT MANADO   ABSTRAK   Kontaminasi minyak bumi dan turunannya dalam ekosistem dianggap sebagai ancaman lingkungan di seluruh dunia. Beberapa mikroorganisme menunjukkan potensi yang dapat menurunkan hidrokarbon dalam lingkungan yang terkontaminasi. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi bakteri yang berpotensi sebagai pendegradasi minyak yang tumbuh pada media buatan. Bakteri diisolasi dari pelabuhan laut Manado dan ditumbuhkan dalam media NA yang mengandung minyak diesel dengan penambahan air garam buatan dan minyak diesel tanpa air garam buatan. Bakteri yang tumbuh diisolasi dan masing-masing ditanam secara terpisah untuk mendapatkan isolat murni. Tiga isolat bakteri yaitu AO2, AO3 dan AO4 yang telah diidentifikasi menggunakan 16S rRNA gen secara berturut-turut adalah  Pseudomonas aeroginosa, Klebsiella oxytoca, dan Citrobacter sp. Kata kunci: minyak diesel, bakteri pendegradasi minyak diesel, Pelabuhan Laut Manado, gen 16S rRNA