JURNAL AGROHITA
Vol 7, No 4 (2022): JURNAL AGROHITA

STUDI VARIABILITAS GENETIK 30 GENOTIPE PADI (ORYZA SATIVA L.) MENGGUNAKAN BEBERAPA MARKA SSR (SIMPLE SEQUENCE REPEAT) TERPAUT ZN

Tiwi Rumondang Pangaribuan (Universitas Singaperbangsa Karawang)
Muhammad Syafi'i (Universitas Singaperbangsa Karawang)
Elia Azizah (Universitas Singaperbangsa Karawang)
Untung Susanto (Balai Besar Penelitian Tanaman Padi)
Furry Pramudyawardani (Balai Besar Penelitian Tanaman Padi)
Desi Prastika (Balai Besar Penelitian Tanaman Padi)



Article Info

Publish Date
19 Dec 2022

Abstract

Padi merupakan salah satu komoditas penting di Indonesia. analisis keragaman genetik padi diperlukan untuk keberhasilan program pemuliaan  varietas padi lokal. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi variabilitas genetik dan pola kekerabatan tiga puluh genotipe padi (Oryza sativa L) menggunakan beberapa marka SSR terpaut Zink. Penelitian dilaksanakan pada bulan September - Desember 2021 di Laboratorium DNA  Balai Besar Penelitian Tanaman Padi, Sukamandi. Sebanyak 30 genotipe padi lokal dengan kandungan Zn yang beragam telah dianalisis menggunakan eksperimen laboratorium. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat variasi alel yang berbeda  (2 - 8) di antara genotipe-genotipe yang di uji dengan rerata jumlah alel 4,5, sedangkan rerata nilai Polymorphism Information Content (PIC) sebesar 0,48  (0,20 - 0,70). Terdapat 4 marka SSR yang memiliki nilai PIC > 0,5 yaitu RM162, RM38, RM30 dan RM80 yang menunjukkan bahwa marka-marka tersebut informatif untuk studi keragaman genetik padi dengan ragam kandungan Zn dengan rerata nilai diversitas gen sebesar 0,53. Hasil analisis filogenetik menunjukkan bahwa 30 genotipe tersebut mengelompok menjadi lima kelompok dengan koefisien kemiripan 0,68.

Copyrights © 2022






Journal Info

Abbrev

agrohita

Publisher

Subject

Control & Systems Engineering Decision Sciences, Operations Research & Management Economics, Econometrics & Finance Industrial & Manufacturing Engineering Other

Description

Teknologi adalah hal yang lumrah di era ini. Teknologi telah mengikat setiap aspek kehidupan manusia. Teknologi sendiri merupakan salah satu cara untuk memudahkan pekerjaan manusia agar dapat menghasilkan keluaran yang efisien. Teknologi juga memberikan banyak kemudahan, sekaligus cara baru dalam ...