IJCCS (Indonesian Journal of Computing and Cybernetics Systems)
Vol 20, No 2 (2026): April

Preliminary Evaluation of an LLM-Based Annotation Framework for Medical NER in Bahasa Indonesia

Ningtyas, Annisa Maulida (Unknown)
Salim, Marko Ferdian (Unknown)
Syairaji, M (Unknown)
Santoso, Dian Budi (Unknown)



Article Info

Publish Date
30 Apr 2026

Abstract

Keterbatasan data beranotasi berkualitas menghambat pengembangan model Named Entity Recognition (NER) medis untuk Bahasa Indonesia. Penelitian ini menyajikan desain evaluasi untuk framework anotasi semi-otomatis berbasis Large Language Models (LLMs) untuk terminologi medis Indonesia. Framework mengintegrasikan pre-anotasi LLM dengan validasi manusia melalui web interface. Tujuan utama penelitian ini adalah mengevaluasi konsistensi dari LLM pada 21 posting forum Alodokter terkait NER dengan lima kategori entitas: penyakit, gejala, anatomi, obat, dan prosedur, menggunakan ensembel tiga varian model Gemini (Gemini-2.5-Flash, Gemini-2.0-Flash, dan Gemini-2.5-Flash-Lite). Evaluasi menggunakan Inter-Annotator Agreement (IAA) Cohen’s Kappa dan F1 score.  Hasil menunjukkan konsistensi internal model yang tinggi, dengan Gemini-2.5-Flash-Lite mencapai konsistensi internal tertinggi (strict F1 = 0.970, kappa = 0.977). Kesepakatan antar-model signifikan tetapi lebih rendah (rata-rata F1 ketat = 0.716, kappa = 0.756), dengan deteksi batas sebagai sumber utama ketidaksepakatan. Analisis posting dengan kesepakatan terendah mengidentifikasi tiga faktor: ambiguitas identifikasi entitas pada posting berbentuk pertanyaan, ambiguitas klasifikasi jenis entitas, dan strategi segmentasi batas untuk bahasa medis Indonesia informal.

Copyrights © 2026






Journal Info

Abbrev

ijccs

Publisher

Subject

Computer Science & IT Control & Systems Engineering

Description

Indonesian Journal of Computing and Cybernetics Systems (IJCCS), a two times annually provides a forum for the full range of scholarly study . IJCCS focuses on advanced computational intelligence, including the synergetic integration of neural networks, fuzzy logic and eveolutionary computation, so ...