This Author published in this journals
All Journal Zuriat
M. B. Pabendon
Unknown Affiliation

Published : 2 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 2 Documents
Search

Diteksi Tingkat Heterosigositas dan Variasi Alil 73 Genotip Jagung Melalui Marka SSRs (Simple Sequence Repeats) M. B. Pabendon; Murdaningsih H. K.; A. Baihaki; G. Suryatmana
Zuriat Vol 15, No 1 (2004)
Publisher : Breeding Science Society of Indonesia (BSSI) / PERIPI

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24198/zuriat.v15i1.6814

Abstract

Identifikasi 73 genotipe jagung untuk mengetahui tingkat heterosigositas dan variasi alil dengan menggunakan marka 30 SSRs telah dilakukan. Persentase heterosigositas menunjukkan 36 genotip, sebagian besar genotip yang dibuat di Indonesia, kemurniannya kurang dari 80% yang ditunjukkan oleh munculnya 2 sampai 4 alil per genotip. Ada 37 genotip dan 6 genotip standard dari CIMMYT yang dianalisis lebih lanjut. Skoring alil dilakukan berdasarkan sequencered-based, alil standard (yang diperoleh dari laboratorium service AMBIONET). Dari total 43 genotip tersebut, diperoleh 145 alil dengan kisaran 2 sampai 8 alil per lokus dengan rata-rata 4.8 alil. Ditemukan juga 10 alil unik yaitu alil yang tidak ditemukan pada genotip-genotip yang telah dideteksi di AMBIONET. Nilai polimorfisme berkisar dari 0.21 (umc1161) sampai 0.97 (umc1196), dengan ratarata 0.62. Marka SSRs dapat bermanfaat dalam menentukan tingkat heterosigositas dan variasi alil yang bermanfaat dalam program pengembangan hibrida.
MOLECULAR CHARACTERIZATION OF QUALITY PROTEIN MAIZE AND DOWNY MILDEW RESISTANCE LINES BASED ON SIMPLE SEQUENCE REPEATS (SSRs) MARKER D. Ruswandi; N. Wicaksana; M. B. Pabendon; M. Azrai; M. Rachmadi; A. Ismail; N. Carsono; F. Damayanti; F. Kasim
Zuriat Vol 16, No 1 (2005)
Publisher : Breeding Science Society of Indonesia (BSSI) / PERIPI

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24198/zuriat.v16i1.6779

Abstract

The information on germplasm diversity and genetic relatedness among elite breeding materials is an important element in maize breeding. Molecular characterization and genetic relationship of 11 QPM-DMR lines were analysed using thirty three SSRs markers. Genetic relationship was determined using Jaccard’s similarity coefficient, and dendogram was then constructed based on the unweighted pair-group method with arithmetical averages (UPGMA). Result showed that (i) all SSRs loci were informative for describing the genotypic variation as showed by their PIC, which ranged from 0.19 for umc1304 to 0.93 for phi112; (ii) the eleven maize inbred lines were clustered into one major group A and small groups B and C that corresponds well with the breeding programs adopted at different institutes of release, and (iii) thus, SSRs marker system is a valuable marker for varietals identification and for genetic diversity study of elite breeding materials.