Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
0
P-Index
This Author published in this journals
All Journal Media Penelitian dan Pengembangan Kesehatan Jurnal Biotek Medisiana Indonesia
Ervi Salwati
Basic Technology Center for Biomedical and Health, National Institute of Health and Research and Development
Decision Sciences, Operations Research & Management Health Professions Public Health

Published : 4 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 4 Documents
Search

 1 
DETEKSI P.VIVAX SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM (SNP) Y976F DARI SAMPEL MONITORING PENGOBATAN DIHIDROARTEMISININ-PIPERAKUIN DI KALIMANTAN DAN SULAWESI Salwati, Ervi; Herman, Reni; Handayani, Sarwo; Tjitra, Emiliana
Media Penelitian dan Pengembangan Kesehatan Vol 22, No 3 Sep (2012)
Publisher : Badan Penelitian dan Pengembangan Kesehatan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | http://ejournal.litbang.depkes.go.id/index.php/MPK/article/view/2905

Abstract

Abstract This study was a part of the activity of monitoring Dihydroartemisinin-Piperaquine (DHP) treatment in subjects infected with P.falciparum and P.vivax in Kalimantan and Sulawesi. SNP Y976F had been proved as the mutation in pvmdr1 gene which was related to P. vivax resistance chloroquine in Papua. Data of spreading pvmdr1 SNP Y976F outside Papua is needed for using Dihidroartemisinin-Piperakuin policy in the treatment of vivax malaria in Indonesia. Detection of SNP Y976F was done against 95 day0-samples of subjects confirmed infected with P.vivax or mixed infection of P.vivax and P.falciparum by PCR. The results showed that 88 (93%) of a total 95 samples were positive detected 976F mutant which were distributed in all sentinel sites of West Kalimantan (2of 3), Central Kalimantan (6 of 8), North Sulawesi (63 of 65), and Central Sulawesi (17 of 19).  In conclusion,  pvmdr1 SNP Y976F has been spreaded in all sentinel sites. Key words: P.vivax, pvmdr1, Single Nucleotide Polymorphism Abstrak Penelitian ini merupakan bagian kegiatan dari monitoring pengobatan Dihidroartemisinin-Piperakuin (DHP) pada subyek yang terinfeksi dengan P.vivax atau infeksi campuran P.falciparum dan P. vivax di Kalimantan dan Sulawesi. SNP Y976F merupakan mutasi pada gen pvmdr1 yang terbukti berhubungan dengan P. vivax resisten klorokuin di Papua. Dalam rangka kebijakan penggunaan Dihidroartemisinin-Piperakuin untuk pengobatan malaria vivaks di seluruh Indonesia, perlu data penyebaran parasit SNP Y976F pada gen pvmdr1 di luar Papua. Deteksi SNP Y976F dilakukan terhadap 95 sampel H0 subyek terinfeksi P. vivax atau infeksi campuran P.vivax dan P.falciparum yang telah dikonfirmasi dengan PCR. Hasil menunjukkan bahwa 88 dari 95 sampel (93%)  terdeteksi positif galur mutan 976F yang tersebar di  Kalimantan Barat (2 dari 3), Kalimantan Tengah (6 dari 8), Sulawesi Utara (63 dari 65) dan Sulawesi Tengah (17 dari 19). Kesimpulannya bahwa P.vivax galur Y976F sudah tersebar di setiap sentinel penelitian.   Kata kunci: P.vivax, pvmdr1, Single Nucleotide Polymorphism
KERAGAMAN GENETIK PETANDA P. falciparum DARI SPECIMEN SUBYEK PENELITIAN MONITORING DIHIDROARTEMISININ-PIPERAKUIN DI KALIMANTAN DAN SULAWESI Handayani, Sarwo; Salwati, Ervi; Tjitra, Emiliana
Media Penelitian dan Pengembangan Kesehatan Vol 22, No 3 Sep (2012)
Publisher : Badan Penelitian dan Pengembangan Kesehatan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | http://ejournal.litbang.depkes.go.id/index.php/MPK/article/view/2906

Abstract

Abstract Treatment failure in falciparum malaria may be caused by parasite resistant to antimalarial drug or new infection. Polymorphism genetic marker of P. falciparum namely MSP1, MSP2 and GLURP locus genes in the population should be identified as a baseline to distinguish the cause of treatment failure. A nested Polymerase Chain Reaction (PCR) method was applied to each locus gene separately. A total 121 dried blood spot specimens from subjects infected with P. falciparum in monitoring Dihydroartemisinin-Piperaquine treatment in Kalimantan and Sulawesi Islands were analyzed. Locus genes of MSP1, MSP2 and GLURP were successful identified 82.6%, 96.7% and 81.0% respectively. However, the three (MSP1, MSP2 and GLURP) locus genes were only found in 71.9% (87 of 121) samples. All of MSP1 locus gene had just one allele, two alleles on most of MSP2 (67.5%) and few of GLURP (14.3%). Multi genotype infection was likely dominant than a single genotype infection (65.5% vs. 34.5%). Based on allele length classification, MSP2 locus gene shows more variety of allele class (12 alleles) than GLURP (9 alleles) and MSP1 (7 alleles), with an allele length mostly for MSP1: 440 - 479 bp, MSP2: 480–519 bp and GLURP: 580–639 bp. In this study, falciparum malaria cases were commonly as multi-genotype infection, and MSP2 was a dominant and polymorphic genetic marker of P.falciparum. Keywords: P. falciparum, PCR, MSP1, MSP2, GLURP, allele     Abstrak Gagal pengobatan pada malaria falsiparum dapat disebabkan oleh parasit yang resisten terhadap obat antimalaria atau oleh infeksi baru. Keragaman genetik petanda Plasmodium falciparum yaitu lokus gen MSP1, MSP2 dan GLURP dalam suatu populasi perlu diidentifikasi sebagai dasar untuk membedakan penyebab gagal pengobatan. Metode pemeriksaan yang digunakan adalah nested Polymerase Chain Reaction (PCR) terhadap masing-masing lokus gen secara terpisah. Telah dianalisis 121 spesimen resapan darah kering pada kertas filter dari subyek terinfeksi P.falciparum pada studi monitoring pengobatan dengan Dihidroartemisinin-Piperakuin di Kalimantan dan Sulawesi. Masing-masing lokus gen MSP1, MSP2 dan GLURP yang dapat diidentifikasi sebanyak 82,6%, 96,7% and 81,0%. Sedangkan ketiga lokus gen tersebut ditemukan hanya pada 71,9% (87/121) sampel. Lokus gen MSP1 semuanya mempunyai 1 alel, sedangkan dua alel ditemukan pada sebagian besar MSP2 (67,5%) dan sebagian kecil GLURP (14,3%). Infeksi multi-genotip oleh dua atau lebih genotip P.falciparum ditemukan pada 65,5% sampel dan infeksi tunggal hanya 34,5% sampel. Keragaman klas alel paling banyak ditemukan pada lokus gen MSP2 sebanyak 12 klas alel, GLURP sebanyak 9 klas alel, dan MSP1 sebanyak 7 klas alel. Alel pada lokus gen MSP1 sebagian besar pada kisaran 440 - 479 bp, MSP2: 480 – 519 bp, dan GLURP: 580–639 bp. Pada penelitian ini kasus malaria falsiparum umumnya merupakan infeksi multi-geotip, dan MSP2 merupakan petanda gen P.falciparum yang dominan dan beragam.   Kata kunci : P. falciparum, PCR, MSP1, MSP2, GLURP, alel
Identifikasi Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Gen pvmdr1 pada Penderita Malaria Vivaks di Minahasa Tenggara (Sulawesi Utara) Salwati, Ervi; Handayani, Sarwo; Jekti, Rabea Pangerti
Jurnal Biotek Medisiana Indonesia Vol 3, No 2 (2014)
Publisher : Central Basic Biomedical and Health Technology

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | Full PDF (507.862 KB)

Abstract

Parasite resistance to antimalarial drugs is an obstacle to malaria elimination. In Plasmodium vivax, up to now, a marker to distinguish between resistant and susceptible is no available yet. Identify Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) in P. vivax for multidrug resistance (pvmdr1)is potential approach due to pvmdr1 gene is orthologous to the pfmdr1 of P.falciparum, have been related to multidrug resistance. The purpose of this study was to identify SNPs/mutations on pvmdr1 gene of malaria vivax patients who came to the Primary Healthe Centers, Touluaan and Tombatu Minahasa Tenggara (North Sulawesi).Blood samples and slide of blood smears were collected from patients who infected with P.vivax or mixed infection of P.vivax and P.falciparum. After the species were cross checked by certified microscopist then confirmed by PCR, SNP identification were performed by sequencing technique. Only 83 of 99 recruited subjects were included inclution criteria. Sequensing result showed that 59 of 83 subjects were analysed to identify the SNP. We found 5 nonsynonymous SNPs, namely at the point G698S, M908L, Y976F, L1076F, and K1261E.Key words: Plasmodium vivax, Single Nucletide Polymorphism, Gen pvmdr1, Mutation AbstrakResistensi parasit terhadap obat anti malaria merupakan salah satu kendala untuk eliminasi malaria. Pada Plasmodium vivax, sampai saat ini penanda parasit yang resisten dengan yang masih sensitif belum tersedia. Identifikasi Single Nucleotide (SNP) gen pvmdr1 P.vivax multidrug resistance (pvmdr1) merupakan pendekatan yang potensial, karena gen pvmdr1 ortolog dengan gen pfmdr1 P. falciparum yang telah terbukti berkaitan dengan multidrug resisten. Tujuan penelitian adalah untuk mengidentifikasi SNP/mutasi pada gen pvmdr1 dari pasien malaria vivax yang berobat ke Puskesmas Touluaan dan Tombatu di Minahasa Tenggara (Sulut). Sampel darah dan sediaan apusan darah tebal dan tipis dikumpulkan dari pasien yang terinfeksi P.vivax atau infeksi campuran P.vivax dan P.falciparum. Setelah spesies dicek ulang oleh mikroskopis pusat dan dikonfirmasi dengan teknik PCR, dilanjutkan dengan identifikasi SNP dengan teknik sekuensing Dari 99 subjek yang dikumpulkan hanya 83 subjek yang memenuhi kriteria inklusi. Hasil sekuensing memperlihatkan bahwa 59 dari 83 sampel dianalisa untuk identifikasi SNP. Kami menemukan 5 SNP nonsynonymous yaitu pada titik G698S, M908L,Y976F, L1076F, dan K1261E.Kata kunci: Plasmodium vivax, Single Nucletide Polymorphism, Gen pvmdr1, Mutasi
DETEKSI DAN SPESIASI PARASIT MALARIA SAMPEL MONITORING PENGOBATAN DIHYDROARTEMISININ-PIPERAQUINE DI KALIMANTAN DAN SULAWESI: MIKROSKOPIS VS POLYMERASE CHAIN REACTION Herman, Reni; Ariyanti, Endah; Salwati, Ervi; -, Delima; Tjitra, Emiliana
Media Penelitian dan Pengembangan Kesehatan Vol 21, No 3 Sept (2011)
Publisher : Badan Penelitian dan Pengembangan Kesehatan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.22435/mpk.v21i3 Sept.91.

Abstract

In monitoring the treatment of malaria with Dihydroartemisinin-piperaquine (DHP), microscopic cross check and Polymerase Chain Reaction (PCR) performed to validate the results of laboratory examinations in the field. This study used finger prick samples from subjects with a diagnosis of malaria in monitoring the treatment of malaria with DHP in Kalimantan and Sulawesi. Samples taken at day 0, blood smears made on slides for microscopic and blood spot on filter paper for PCR examination. The PCR method used is a single-round multiplex polymerase chain reaction that has been modified, the examination of each species carried out in different tubes to distinguish the species P. falciparum or P. Vivax. Target of DNA amplification is a species-specific gene sequences in the small-subunit ribosomal RNA (SSUrRNA), 300 bp for P. falciparum and 276 bp for P.vivax.  P. falciparum and P.vivax identified in 229 samples of blood smears and blood spots. Microscopic and PCR gave the same results, positive 93.4% and negative 6.6% with a sensitivity of  99% and specificity 93.3%. P.falciparum sensitivity and specificity of 92% and 99%, P.vivax 97% and 94%, PCR as a gold standard. There are differences in the results of examination of 5 samples, ie with microscopic examination identified as P.vivax  while the PCR as P. falciparum. In this study, identification of  the microscopic parasite similar to the results of identification by PCR, but differ in determining the types of parasites. In general, the ability to microscopic diagnosis of malaria is very good, but confirmation by PCR is still needed.AbstrakPada monitoring pengobatan malaria  dengan Dihydroartemisinin-piperaquine (DHP),cek silang mikroskopis dan Polymerase Chain Reaction (PCR) dilakukan untuk memvalidasi hasil pemeriksaan di laboratorium lapangan. Penelitian ini menggunakan sediaan darah jari dari subyek dengan diagnosis malaria pada monitoring pengobatan malaria dengan DHP di Kalimantan dan Sulawesi. Sampel diambil pada hari 0, dibuat sediaan apus darah pada kaca benda dan sediaan tetes darah (Blood spot) pada kertas saring. Terhadap sediaan apus darah dilakukan pemeriksaan mikroskopis, dan terhadap sediaan tetes darah dilakukan pemeriksaan PCR. Metode PCR yang digunakan adalah multiplex single round Polymerase Chain Reaction yang telah dimodifikasi, pemeriksaan masing-masing spesies dilakukan pada tabung yang berbeda untuk membedakan spesies P.falciparum atau P. Vivax. Target amplifikasi DNA adalah gen species-specific sequences pada small-subunit ribosomal RNA (SSUrRNA), 300 bp untuk P.falciparum dan P.vivax. P.falciparum dan P.vivax diidentifikasi pada 229 sampel berupa sediaan apus darah pada kaca benda dan blood spot. Hasil identifikasi dengan mikroskopis dan PCR, sampel positif 93,4% dan negatif 6,6% dengan  sensitifitas 99% dan spesifisitas 93,3%. Sensitifitas dan spesifisitas P.falciparum adalah 92% dan 99%, P.vivax 97% dan 94%, dihitung dengan PCR sebagai baku standar. Terdapat perbedaan hasil pemeriksaan terhadap 5 sampel, yaitu dengan pemeriksaan mikroskopis diidentifikasi sebagai P.vivax sementara pada pemeriksaan PCR sebagai P.falciparum. Pada penelitian ini, hasil identifikasi parasit dengan mikroskopis sama dengan hasil identifikasi dengan PCR, namun berbeda pada penentuan jenis parasit. Secara umum kemampuan tenaga mikroskopis pusat untuk menegakkan diagnosis malaria sudah sangat baik, namun untuk penentuan jenis Plasmodium masih memerlukan konfirmasi PCR.
Co-Authors Delima -, Delima Emiliana Tjitra Endah Ariyanti Rabea Pangerti Jekti Reni Herman Sarwo Handayani