Article Per Year (5 Year)
p-Index From 2020 - 2025
0.835
P-Index
This Author published in this journals
All Journal JURNAL PENDIDIKAN MIPA Journal On Teacher Education (Jote) Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi Jurnal Ilmiah Medicamento
Maria Marcelina Dua Nurak
Universitas Nusa Nipa
Agriculture, Biological Sciences & Forestry Biochemistry, Genetics & Molecular Biology Education Health Professions Immunology & microbiology Languange, Linguistic, Communication & Media Mathematics Medicine & Pharmacology Public Health Social Sciences Other

Published : 5 Documents Claim Missing Document
Claim Missing Document
Check
Articles

Found 5 Documents
Search

 1 
Eksplorasi Senyawa Kulit Kopi sebagai Anti Covid-19 Melalui Penghambatan 3C-Like Protease Yohanes Bare; Frederiksen Novenrius Sini Timba; Maria Marcelina Dua Nurak; Marsiana Coo Mogi
JURNAL PENDIDIKAN MIPA Vol 12 No 2 (2022): JURNAL PENDIDIKAN MIPA
Publisher : Pusat Publikasi Ilmiah, STKIP Taman Siswa Bima

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.37630/jpm.v12i2.563

Abstract

Corona virus 19 menjadi pandemic di dunia saat ini, oleh karena itu perlu dilakukan terapi sehingga menurunkan prevalensi di Indonesia dengan menghambat protein yang terlibat dalam virus corona (3CL Protease). Salah satunya pemanfaatan bahan alam yang tidak terpakai. Kulit kopi merupakan material sisa dari pengolahan biji kopi. Satu ton ampas kopi akan terbentuk dari 2 ton kopi yang diproduksi dan berdampak terhadap masalah lingkungan. Kulit kopi memiliki berbagai macam senyawa yang masih dibutuhkan. Produksi kopi Tujuan penelitian ini adalah pemanfaatan bahan aktif kulit kopi sebagai nutrisi tingkat gen dengan menghambat kinerja 3C-like protease (3CLPro). Metode penelitian in silico, senyawa kulit kopi Hexosa (ID. 206), Malic acid (ID. 525), D-manitol (ID. 88038555) diunduh dari PubChem, protein 3CL Protease diunduh dari database protein data bank (PDB) dengan ID 2zu2 diimport ke software Molegro virtual docker 5 dan dilakukan preparasi. Selanjutnya protein target diprediksi cavity (sisi aktif protein) dengan parameter expand van der Waals maximum 10. Hasil docking dilakukan superimposed dengan protein yang telah dipreparasi menggunakan software PyMol. Visualisasi hasil docking dilakukan menggunakan perangkat lunak HEX 8.0.0.0. Hasil penelitian senyawa yang terkandung dalam kulit kopi memiliki potensi sebagai anti covid-19, hal ini dibuktikan dengan aktivitas senyawa Hexosa, Malic acid, D-manitol yang mengikat masing-masing enam residu asam amino. Pengikatan terhadap delapan belas residu asam amino yang berbeda diprediksi menjadi alternatif nutrisi dengan menghambat 3CL Protease.
Potential of Sechium edule as Hypertensive Therapy: In Silico Study Maria Marcelina Dua Nurak; Maria Alvensia Lute; Margaretha Nona Eci; Yohanes Bare
SPIZAETUS: JURNAL BIOLOGI DAN PENDIDIKAN BIOLOGI Vol 3, No 2 (2022): Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi
Publisher : Universitas Nusa Nipa

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55241/spibio.v3i2.60

Abstract

Hipertensi didefinisikan sebagai tekanan darah tinggi dan menjadi salah satu pembunuh di dunia. Terapi hipertensi berfokus pada protein Angiotensin Converting Enzim (ACE) yang memiliki fungsi modulator konversi AT1-AT2. Pengobatan memanfaatkan kandungan kalium buah labu yang memiliki fungsi supresi ACE. Tujuan penelitian ini eksplorasi kalium dalam labu siam sebagai inhibitor ACE. Penelitian bioinformatika, kalium (CID: 5462222) diunduh dari database PubChem sedangkan protein ACE (ID: 3bkk) diperoleh dari Protein Data Bank. Ligan dan protein didocking menggunakan perangkat lunak HEX, hasil penelitian divisualisasikan menggunakan Discovery studio. Hasil penelitian menunjukan bahwa labu siam memiliki kandungan kalium yang memiliki potensi sebagai salah satu terapi hipertensi melalui penghambatan kinerja ACE sehingga tidak terjadi konversi angiotensin I menjadi angiotensin II. Labu siam dapat dijadikan alternatif dalam pengobatan hipertensi. 
Interaksi Molekuler Senyawa D-Manitol (Kulit Kopi) terhadap PLPro Yohanes Bare; Frederiksen Novenrius Sini Timba; Maria Marcelina Dua Nurak; Dewi Ratih Tirto Sari; Marsiana Coo Mogi
SPIZAETUS: JURNAL BIOLOGI DAN PENDIDIKAN BIOLOGI Vol 3, No 3 (2022): Spizaetus: Jurnal Biologi dan Pendidikan Biologi
Publisher : Universitas Nusa Nipa

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.55241/spibio.v3i3.79

Abstract

Perkembangan virus dalam proses replikasi menjadi target dalam menghambat siklus hidup virus. Protein yang memiliki peran dalam replikasi adalah PLPro. Terapi PLPro dilakukan dengan memanfaatkan limbah kopi yang diprediski memilki bioaktif D-manitol dengan sifat farmakologis. Tujuan penelitian ini adalah mengalisis potensi senyawa D-manitol yang terkandung dalam kulit kopisebagai kandidat terapi corona melalui penghambatan PLPro. Metode penelitian Ligan D-manitol (CID: 88038555) sedangkan Protein Papain like protease (PLPro) (PDB ID 6w9c), sebagai target protein anti-coronavirus diunduh struktur tiga dimensinya di Protein Data Bank. Selanjutnya struktur protein dipreparasi protein atau ligan, docking, visualisasi mengikuiti penelitian. Hasil docking senyawa dan protein menggunakan program PyMol versi 2.2. analisis docking dilakukan dengan mengeksplorasi interaksi kompleks baik 3D dan 2d, jenis ikatan, jumlah interaksi. Analisis menggunakkan program Discovery Studio ver 21.1.1.). Senyawa D-manitol memiliki potensi sebagai salah satu terapi covid-19 melalui penghambatan PLPro sehingga menyebabkan terhambatnya replikasi virus corona. Potensi ini didukung dengan adanya energi ikatan yang terbentuk sehingga meningkatkan stabilitas ikatan sebesar -156 Kj/mol. Penelitian lanjutan perlu dilakukan untuk konfirmasi terhadap aktivitas D-manitol sebagai terapi virus.
Kajian in silico Penghambatan Spesifik 3C-like Protease SARS-CoV-2 Senyawa Quinic Acid, Gluconic Acid, dan Ferulic Acid pada Kulit Kopi Yohanes Bare; Frederiksen Novenrius Sini Timba; Dewi Ratih Tirto Sari; Oktavius Yoseph Tuta Mago; Maria Marcelina Dua Nurak
Jurnal Ilmiah Medicamento Vol 8 No 2 (2022): Jurnal Ilmiah Medicamento
Publisher : Fakultas Farmasi Universitas Mahasaraswati Denpasar

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.36733/medicamento.v8i2.3971

Abstract

This study aims to explore the chemical compounds of the coffee pulp as an anti-covid-19 (anti-3C-like protease). In silico modeling was carried out by structure retrieval, protein preparation, and docking simulation. Specific Grid docking was used for ligands – protein interacting by using Molegro Virtual Docker 5, followed by visualizing Discovery studio version 21.1.1. Compounds contained in coffee pulp, quinic acid, gluconic acid, and ferulic acid separately bind to the same amino acid residues of 3CL Protease or each other. Furthermore, three compounds inhibited 3CLPro activity by catalytic site blocking of 3CLPro, indicating that coffee compounds have potential as molecular therapeutic materials for the coronavirus by inhibiting SARS-CoV-2 genome replication.
Pengembangan LKPD Berbasis Guided Inquiry Materi Pewarisan Sifat Maria Marcelina Dua Nurak; Yohanes Bare; Sukarman Hadi Jaya Putra
Journal on Teacher Education Vol. 4 No. 2 (2022): Journal on Teacher Education
Publisher : Universitas Pahlawan

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.31004/jote.v4i2.9332

Abstract

Media pembelajaran yang digunakan dalam pembelajaran harus sesuai dengan kondisi sekolah, peserta didik serta pemilihan media harus disesuaikan dengan tujuan pembelajaran. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis kerangka pengembangan dan kelayakan media LKPD berbasis guided inquiry pada materi pewarisan sifat pada makhluk. Penelitian ini dilakukan di SMP Yapenthom 2 Maumere. Jenis penelitian berupa pengembangan atau Research and Develompment dengan mengikuti model Borg and Gall. Hasil penelitian menunjukan bahwa produk produk LKPD berbasis guided inquiry dinyatakan sangat valid dengan rerata persentase kevalidan sebesar 93,76%. Selanjutnya dilakukan uji coba tahap 1 yang presentase kelayakan LKPD berbasis guided inquiry masing-masing sebesar 100% dan 98,67% dengan kategori sangat layak. Uji coba tahap kedua memperoleh rerata presentase kelayakan masing-masing sebesar 100% dan 99,50% dengan kategori sangat layak.
Co-Authors Bare, Yohanes Frederiksen Novenrius Sini Timba Margaretha Nona Eci Maria Alvensia Lute Marsiana Coo Mogi Oktavius Yoseph Tuta Mago Sari, Dewi Ratih Tirto