Aktinomicetes merupakan bakteri Gram positif dengan kandungan GC yang tinggi dan
dikenal sebagai penghasil senyawa metabolit sekunder. Namun potensi aktinomicetes laut
terutama dari lingkungan laut masih sangat terbatas dikembangkan. Penelitian yang telah
dilaksanakan menyatakan bahwa telah diketahui adanya asosiasi antara bakteri Gram positif
yang diduga kuat adalah aktinomisetes dengan rumput laut dan softcoral. Sehingga dari hasil
penelitian ini dapat dilanjutkan untuk deteksi dini gen penyandi penghasil senyawa metabolit
sekunder kelas PKSs dan NRPSs dan uji aktivitasnya sebagai antioksidan. Deteksi gen PKS I
dan NRPS ini dilakukan untuk mencari isolat aktinomisetes yang mempunyai potensi sistem
biosintetik senyawa poliketida dan non ribosomal peptida. Sampel untuk penelitian ini diambil
dari perairan Pangandaran, Jawa Barat. Sampel yang diperoleh adalah rumput laut, lamun.
Metode yang digunakan dalam penelitian ini mulai dari analisa mikrobiologi (isolasi
aktinomicetes, uji Gram) , analisa molekuler (rep-PCR , PCR gen NRPS). Berdasarkan
penelitian ini diperoleh total aktinomicetes sebanyak 90, dengan keragaman genetik bervariasi
koefisien similaritas hingga 1. Koefisien similaritas 1 menunjukkan kekerabatan genetik yang
dekat dan koefisien similaritas kurang dari 1 menunjukkan kekerabatan genetik yang jauh. Hasil
PCR gen NRPS diperoleh 6 isolat terdeteksi pembawa gen NRPS.
Copyrights © 2012