cover
Article Per Year (5 Year)
All
Home Page
OAI Link
Editorial Team
Contact
Reviewer
Google Scholar
Contact Name
Ni Putu Diantariani
Contact Email
jurnalkimia@unud.ac.id
Phone
+628123640424
Journal Mail Official
jurnalkimia@unud.ac.id
Editorial Address
Program Studi Kimia Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Udayana Kampus Bukit Jimbaran, Jimbaran, Bali, Indonesia
Location
Kota denpasar,
Bali
INDONESIA
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry)
Published by Universitas Udayana
ISSN : 19079850     EISSN : 25992740     DOI : 10.24843/JCHEM
Core Subject : Science,
Chemistry
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) publishes papers on all aspects of fundamental and applied chemistry. The journal is naturally broad in scope, welcomes submissions from across a range of disciplines, and reports both theoretical and experimental studies.
Arjuna Subject : Kimia(semua kategori) - Kimia (Lain-Lain)
Articles 518 Documents
 48   49   50   51   52 
AKTIVITAS ANTIBAKTERI EKSTRAK n-HEKSANA KULIT PISANG HIJAU LUMUT (Musa × paradisiaca L.) Rita, W. S.; Pardede, A. O.; Santi, S. R.
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol. 18, No.1, Januari 2024
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24843/JCHEM.2024.v18.i01.p08

Abstract

Kulit Pisang Hijau lumut (Musa x paradisiaca L.) merupakan limbah organik yang belum banyak dimanfaatkan. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan Konsentrasi Hambat Minimum (KHM) dan Konsentrasi Bunuh Minimum (KBM) ekstrak kasar n-heksana kulit pisang hijau lumut, dan mengetahui kandungan senyawa yang terdapat dalam ekstrak kasar n-heksana. Ekstraksi kulit pisang hijau lumut dilakukan dengan metode maserasi dan partisi, uji aktivitas antibakteri dilakukan dengan metode sumur difusi agar, dan identifikasi senyawa dalam ekstrak n-heksana dilakukan dengan skrining fitokimia. Maserasi 1000 gram serbuk kulit pisang hijau lumut dengan 10 liter metanol menghasilkan 120,34 gram ekstrak kental metanol. Partisi ekstrak kental metanol menghasilkan 23,41 gram ekstrak kental n-heksana. Hasil uji aktivitas antibakteri menunjukkan bahwa KHM dari ekstrak kasar n-heksana kulit pisang hijau lumut sebesar 3,125% baik terhadap bakteri S. aureus maupun E. Coli, sedangkan KBM ekstrak terhadap bakteri S. aureus dan E. coli masing-masing sebesar 50%. Hasil uji fitokimia ekstrak kasar n-heksana mengandung senyawa fenol, steroid, dan triterpenoid. Antibakteri, Escherichia coli, phytochemical, Staphylococcus aureus
EFEKTIVITAS INHIBITOR KOROSI DARI EKSTRAK DAUN JERUK LEMON (Citrus limon L.) PADA BAJA ST-37 DALAM MEDIA NaCl DAN HCl Cahyanti, N. N. A. T.; Asih, I. A. R. A.; Widihati, I. A. G.
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol. 18, No.2, Juli 2024
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

ABSTRAK Korosi merupakan fenomena alam yang dapat merusak material logam seperti baja St-37 dan juga menyebabkan degradasi struktur serta penurunan kinerja material logam. Beberapa penelitian telah dilakukan untuk mengembangkan inhibitor korosi sebagai solusi yang efektif. Salah satu bahan alam yang digunakan sebagai inhibitor korosi adalah ekstrak daun lemon, yaitu senyawa kimia yang ditambahkan ke lingkungan korosif untuk menghambat atau mencegah reaksi oksidasi logam. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui laju korosi baja St-37 dalam media korosif NaCl dan HCl serta efisiensi inhibisi penggunaan inhibitor ekstrak daun lemon dengan berbagai konsentrasi untuk mencegah korosi. Daun lemon diekstraksi menggunakan metode maserasi, kemudian ekstrak tersebut diuji kandungan metabolit sekundernya. Laju korosi ditentukan menggunakan metode kehilangan berat. Hasil uji fitokimia menunjukkan bahwa ekstrak daun lemon positif mengandung alkaloid, fenol, flavonoid, tanin, dan tanin terkondensasi. Laju korosi terendah baja St-37 pada media korosif NaCl dan HCl masing-masing sebesar 0,1685 dan 0,0658 mmpy (millimetre per year), dan efisiensi inhibibisi tertinggi untuk melindungi media korosif masing-masing sebesar 96,6963 dan 40,3065%, dicapai pada konsentrasi inhibitor 500 ppm. Pengurangan laju korosi dan efisiensi penghambatan oleh ekstrak daun lemon pada baja S-37 dalam media korosif HCl lebih baik daripada dalam media NaCl. Kata kunci: Efisiensi inhibisi, Inhibitor, Korosi, Laju korosi, Lemon ABSTRACT Corrosion is a natural phenomenon that can damage metal materials such as St-37 steel and also causes structural degradation and decreased performance of metal materials. Several studies have been conducted to develop corrosion inhibitors as an effective solution. One of the natural products used as a corrosion inhibitor is lemon leaf extract, a chemical compound added to corrosive environments to inhibit or prevent metal oxidation reactions. This study aimed to determine the corrosion rate of St-37 steel in NaCl and HCl corrosive media and the inhibition efficiency of using lemon leaf extract inhibitors with varying concentrations to prevent corrosion. Lemon leaves were extracted using the maceration method, and then the extract was tested for secondary metabolite content. The corrosion rate was determined using the weight loss method. The results of the phytochemical test showed that lemon leaf extract positively contained alkaloids, phenols, flavonoids, tannins, and condensed tannins. The lowest corrosion rate of the St-37 steel in the NaCl and HCl corrosive media of 0.1685 and 0.0658 mmpy (millimeter per year), respectively, and the highest efficiency of the inhibitor to protect corrosive media of 96.6963 and 40.3065%, respectively, were achieved at the inhibitor concentration of 500 ppm. The corrosion rate reduction and the inhibition efficiency by lemon leaf extract on the S-37 steel in HCl corrosive media was better than in NaCl media. Keywords: Corrosion, Corrosion rate, Inhibition efficiency, Inhibitor, Lemon
SEARCH FOR TOXIC EXTRACT COMPOUNDS IN TARO LEAF ETHANOL (Colocasia esculenta L) BY BRINE SHRIMP LETHALITY TEST METHOD Simalango, N. T. H.; Puspawati, N. M.; Sukadana, I M.
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol. 18, No.2, Juli 2024
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Colocasia esculenta L yang dikenal sebagai Talas merupakan tanaman herba menahun yang secara tradisional seluruh bagian tanaman dimanfaatkan sebagai bahan obat. Pada peneltian ini, toksisitas ekstrak etanol daun talas dan hasil partisinya diuji dan kandungan senyawa aktif pada ekstrak yang paling toksik diidentifikasi. Pengujian toksisitas dilakukan dengan metode Brine Shrimp Lethality Test (BSLT) dan identifikasi senyawa aktif dengan Liquid Chromatography Mass Spectrometry Tandem Mass Spectrometry (LC-MS/MS). Sampel daun talas sebanyak 1 kg dimaserasi dengan etanol 96% menghasilkan 60,01 g ekstrak kental etanol yang bersifat toksik dengan nilai LC50 sebesar 89,52 ppm. Toksisitas hasil partisi ekstrak etanol dengan pelarut n- heksana, etil asetat, n-butanol, dan air memberikan nilai LC50 berturut-turut 68,13; 191,69; 425,80; dan 678,36 ppm sehingga ekstrak n-heksana dapat dikatakan bersifat paling toksik dibandingkan ekstrak lainnya. Pemisahan senyawa aktif pada ekstrak n-heksana dilakukan dengan metode kromatografi kolom dengan silica gel sebagai fase diam dan dielusi secara gradien dengan fase gerak n-heksana dan kloroform menghasilkan 12 fraksi gabungan dengan toksisitas yang relatif tinggi terdapat pada fraksi C dan D dengan nilai LC50 berturut-turut 23,88 dan 106,18 ppm. Fraksi aktif C diduga mengandung senyawa N,N-dimetil-2- [6- metil-2-(4-metilphenil) imidazol [1,2-a] piridin-3-il] asetamide (zolpidem) dan pada fraksi D diduga mengandung senyawa asam (9Z,12Z,15Z)- oktadeka-9,12,15-trienoat (asam linolenat). Kata Kunci: Artemia salina Leach, Brine Shrimp Lethality Test (BSLT), Colocasia esculenta L, daun talas, toksisitas ABSTRACT Colocasia esculenta L, known as taro, is a perennial herb traditionally used in its entirety for medicinal purposes. This study tested the toxicity of taro leaf ethanol extract and its fractions, and identified the active compounds in the most toxic extract. Brine Shrimp Lethality Test (BSLT) was used to test for toxicity, and LC-MS/MS was used to identify active compounds. A sample of 1 kg of taro leaves was macerated with 96% ethanol, yielding 60.01 g of toxic ethanol extract with an LC50 value of 89.52 ppm. Toxicity partitioning of the ethanol extracts using n-hexane, ethyl acetate, n-butanol and water as solvents gave LC50 values of 68.13, 191.69, 425.80 and 678.36 ppm, respectively, indicating that the n-hexane extract was the most toxic. Separation of the active compounds in the n-hexane extract was performed using column chromatography with silica gel as the stationary phase and gradient elution with n-hexane and chloroform as the mobile phases, resulting in 12 combined fractions. The fractions with relatively high toxicity were fractions C and D with LC50 values of 23.88 and 106.18 ppm respectively. The active fraction C may contain the compound N,N-dimethyl-2-[6-methyl-2-(4-methylphenyl)imidazole [1,2-a]pyridin-3-yl]acetamide (zolpidem) and the fraction D probably contains compounds (9Z,12Z,15Z)-octadeca-9,12,15- trienoic acid (linolenic acid). Keywords: Artemia salina Leach, Brine Shrimp Lethality Test (BSLT), Colocasia esculenta L, taro leaves, toxicity
PENGARUH PEMBERIAN EKSTRAK METANOL DAUN TENGGULUN (Protium javanicum Burm f.) TERHADAP KADAR MALONDIALDEHIDA DAN AKTIVITAS SUPEROKSIDA DISMUTASE PADA DARAH TIKUS WISTAR YANG TERPAPAR ASAP ROKOK Puspawati, N. M.; Paramartha, I. D. G. Y.; Rustini, N. L.; Wijaya, P. S.
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol. 18, No.1, Januari 2024
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24843/JCHEM.2024.v18.i01.p05

Abstract

Asap rokok merupakan salah satu penyedia radikal bebas eksogen yang dapat menimbulkan stres oksidatif dan berpotensi menyebabkan penyakit degenerative. Tenggulun (Protium javanicum Burm. f.) merupakan salah satu tanaman yang berpotensi sebagai antioksidan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh pemberian ekstrak metanol daun tenggulun terhadap kadar malondialdehid (MDA) dan aktivitas superoksida dismutase (SOD) pada darah tikus Wistar yang dipapar asap rokok. Penelitian ini merupakan penelitian eksperimental dengan rancangan acak kelompok dengan posttest-only control group design. 24 ekor tikus putih jantan galur Wistar dibagi dalam 4 kelompok yaitu kelompok kontrol P0 (hanya diberi paparan asap rokok); kelompok perlakuan P1, P2, dan P3 (diberi ekstrak metanol daun tenggulun dengan dosis berturut-turut 50, 100, dan 200 mg/kgBB dan paparan asap rokok). Semua kelompok dipapar asap rokok dengan dosis 3 batang per hari selama 15 menit selama 14 hari. Pada hari ke-15, darah masing-masing tikus diambil untuk dianalisis kadar MDA dan aktivitas SOD. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kelompok kontrol P0 memiliki kadar MDA tertinggi yaitu 6,73 ± 0,47 µM dan aktivitas SOD terendah yaitu 1,01 ± 0,12 ng/mL dibandingkan dengan kelompok perlakuan P1, P2, dan P3. Hal ini menunjukkan bahwa paparan asap rokok menyebabkan stress oksidatif. Pemberian ekstrak dengan dosis 50, 100, dan 200 mg/Kg BB secara signifikan (p<0,05) menurunkan kadar MDA dan meningkatkan aktivitas SOD jika dibandingkan dengan kontrol. Semakin tinggi dosis ekstrak yang diberikan, maka kadar MDA cenderung semakin menurun dan aktivitas SOD meningkat. Pemberian ekstrak metanol daun tenggulun dengan dosis 200mg/Kg BB (P3) memberikan hasil terbaik dengan kadar MDA terendah yaitu sebesar 2,91 ± 0,22 µM dan aktivitas SOD tertinggi sebesar 2,73 ± 0,23 ng/mL pada tikus Wistar yang terpapar asap rokok. Pada penelitian ini dapat disimpulkan bahwa ekstrak metanol daun tenggulun secara signifikan mampu menurunkan kadar MDA dan meningkatkan aktivitas SOD pada tikus yang terpapar asap rokok. Kata kunci: asap rokok, malondialdehida, Protium javanicum Burm.f, superoksida dismutase. ABSTRACT Cigarette smoke is a source of free radicals that trigger oxidative stress which can cause inflammation and lung damage. Tenggulun (Protium javanicum Burm. f.) is a plant that is known to have potential as an antioxidant. This study aims to determine the effect of giving tenggulun leaf methanol extract on malondialdehyde (MDA) levels and superoxide dismutase (SOD) activity in the blood of Wistar rats exposed to cigarette smoke. This research is a randomized posttest-only control group design using 24 male white Wistar rats which were divided into 4 groups namely the control group (P0), only given exposure to cigarette smoke; the treatment group (P1; P2, and P3) were exposed to cigarette smoke and given 50, 100, and 200 mg/Kg BW of methanol extract of tenggulun leaves respectively. All groups were exposed to cigarette smoke at a dose of 3 cigarettes per day for 15 minutes for 14 days. On the 15th day, the blood of each rat was taken to analyze its MDA level and SOD activity. The results showed that the control group (P0) had the highest MDA level of 6.73 ± 0.47 µM and the lowest SOD activity of 1.01 ± 0.12 ng/mL compared to the treatment groups P1, P2, and P3. Administration of the extract at doses of 50, 100, and 200 mg/Kg BW significantly (p<0.05) reduced MDA levels and boosted SOD activity when compared to control. The higher the extract dose given, the levels of MDA reduced and SOD activity tends to increase. In this study, the administration of methanol leaves extract of tenggulun with a dose of 200mg/Kg BW (P3) on Wistar rats exposed to cigarette smoke gave the best results with MDA level of 2.91 ± 0.22 µM and SOD activity of 2.73 ± 0.23 ng/mL. The study concluded that the methanol extract of tenggulun leaves significantly reduced MDA levels and boosted SOD activity in rats exposed to cigarette smoke. Keywords: cigarette smoke, malondialdehyde Protium javanicum Burm.f, superoxide dismutase.
PENDEKATAN TOP-DOWN DALAM ESTIMASI KETIDAKPASTIAN PENGUKURAN SUHU LELEH DAN PERUBAHAN ENTALPI MENGGUNAKAN DIFFERENTIAL SCANNING CALORIMETRY Warmiati, W.
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol. 18, No.2, Juli 2024
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

Berdasarkan SNI ISO/IEC17025:2017, laboratorium harus menerapkan sejumlah prosedur untuk pengendalian mutu internal. Salah satu persyaratannya adalah evaluasi ketidakpastian pengukuran Penelitian ini bertujuan untuk megevaluasi ketidakpastian pengukuran suhu leleh dan perubahan entalpi menggunakan alat Differential Scanning Calorimetry untuk mengestimasi tingkat ketidakpastian yang terkait dengan hasil pengukuran dan memahami sejauh mana hasil pengukuran merepresentasikan nilai sebenarnya dari suatu besaran. Penelitian ini dilakukan dengan pendekatan top-down menggunakan data intra-reprodusibilitas dengan bahan acuan standar kontrol Reference Material Certificate Indium Lot BD147. Estimasi ketidakpastian pengukuran dilakukan terhadap metode analisa penentuan suhu leleh dan perubahan entalpi menggunakan differential scanning calorimetry berdasarkan (ISO11357-3, 2018) tentang penentuan suhu dan perubahan entalpi peleburan dan kristalisasi. Berdasarkan parameter uji sesuai dengan ISO 11357-3 terhadap standar kontrol indium diperoleh hasil suhu leleh sebesar 156,55°C dengan besar ketidakpastian ± 0,71 dan perubahan entalpi sebesar 28,42 J/g dengan besar ketidakpastian ± 1,31 J/g pada tingkat kepercayaan 95%. Hasil ini dapat digunakan untuk memperkirakan rentang nilai benar pengukuran suhu leh dan perubahan entalpi berada. Kata kunci: Differential Scanning Calorimetry, ketidakpastian pengukuran, pendekatan top-down, suhu leleh, perubahan entalpi ABSTRACT Based on the National Standard of SNI ISO/IEC17025:2017, laboratories must implement several procedures for internal quality control. One of which is the evaluation of measurement uncertainty. This research aimed to evaluate the measurement uncertainty on the melting temperature and enthalpy changes using Differential Scanning Calorimetry to estimate the uncertainty associated with measurement results and understand to what extent the measurement results represent a true quantity value. A top-down approach with intra-reproducibility data using the Reference Material Certificate Indium Lot BD147 control standard material was applied. The analytical method for determining the melting temperature and enthalpy change using differential scanning calorimetry was carried out based on ISO 11357-3, 2018, regarding the determination of melting and crystallization temperatures and enthalpy changes. Based on the test parameters by ISO 11357-3 for the indium control standard, the melting temperature result was 156.55°C with an uncertainty of ± 0.71, and the enthalpy change was 28.42 J/g with an uncertainty of ± 1.31 J/g at a 95% confidence level. These results can be used to estimate the true value range of the melting temperature and enthalpy change measurements. Keywords: Differential Scanning Calorimetry, uncertainty, top-down approach, melting temperature, enthalpy change
DESTILASI MINYAK ATSIRI DARI DAUN DAN BIJI ADAS (FOENICULUM VULGARE MILLER) BERBANTU GELOMBANG MIKRO SEBAGAI ANTIMICROBIAL EDIBLE COATING PADA BAKSO Rahayuningtyas, N.; Amelia, D.; Ramadhanti, N.; Maharani, F.
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol. 18, No.1, Januari 2024
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24843/JCHEM.2024.v18.i01.p10

Abstract

Adas (Foeniculum vulgare Miller) adalah tumbuhan herbal yang mengandung minyak atsiri dengan kandungan senyawa anetol sebagai antimikrobial. Penambahan minyak atsiri adas pada edible coating. merupakan cara untuk melapisi permukaan produk pangan dengan tujuan mencegah kontaminasi patogen sehingga dapat memperpanjang masa simpan. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui pengaruh penambahan minyak atsiri adas (Foeniculum vulgare Miller) sebagai edible coating pada bakso. Destilasi minyak atsiri adas dilakukan dengan metode Microwave Assisted Extraction (MAE). Destilasi ini menggunakan variabel daun segar dan biji adas. Variabel yang digunakan dalam destilasi adalah daya (80, 240, 400) watt dan waktu (20, 25, 30) menit. Hasil penelitian menunjukkan, rendemen tertinggi dihasilkan dari minyak atsiri adas yaitu sebanyak 1% pada daya 400 watt dengan waktu 20 menit. Minyak atsiri adas memiliki sifat mudah menguap sehingga identifikasi senyawa dapat diketahui dengan metode Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS) . Berdasarkan hasil analisa gugus fungsi diketahui bahwa minyak atsiri mengandung senyawa utama yaitu trans anetol yang memiliki sifat antimikrobial. Kata kunci: adas, antimikrobial, edible coating, Microwave Assisted Extraction (MAE) ABSTRACT Fennel (Foeniculum vulgare Miller) is an herbal plant consists of essential oil containing anethole as an antimicrobial. Adding fennel essential oil to edible coatings is a way to coat the surface of food products to prevent pathogen contamination, thus extending the shelf life. This research aimed to analyze the effect of adding fennel essential oil (Foeniculum vulgare Miller) as an edible coating on meatballs. Distillation of essential oil from fennel leaves and seeds was carried out using the Microwave Assisted Extraction (MAE) method. This distillation uses variable fresh leaves of 100 grams and fennel seeds of 50 grams with variable power of 80 watts, 240 watts, and 400 watts. The time used in distillation is 20 minutes, 25 minutes, and 30 minutes. The results showed that the highest yield obtained was as much as 1% of fennel essential oil at a power of 400 watts with a time of 20 minutes. The identification of chemical compounds contained in the funnel essential oils was done by using the Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS) method. The results showed that the funnel essential oil contained the main compound of trans-anethole with antimicrobial properties. Keywords: antimicrobial, edible coating, fennel, Microwave Assisted Extraction (MAE)
THE EFFECT OF THE D185 MUTATION ON THE STABILITY AND FUNCTIONALITY OF RUBISCO LIKE PROTEIN (RLP) FROM CHROMOHALOBACTER SALEXIGEN BKL 5 Sudarmanto, I.; Rohman, M. S.; Artama, W. T.
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol. 18, No.1, Januari 2024
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar | DOI: 10.24843/JCHEM.2024.v18.i01.p01

Abstract

In the case of Rubisco Like Protein (RLP) Chromohalobacter salexigen BKL 5 (RLP CS), which is halophilic, the presence of salt bridges (SB) is not too numerous but efficient enough to maintain stability in high salt stress. This study was to determine the effect of mutations SB at position 185 (D185/WT) on the stability and activity of RLP CS through an in-silico approach by replacing aspartic acid with glutamic acid and alanine (D185E and D185A). The methods used were Molecular Dynamics Simulations (MDS) and Molecular Docking (MD). The MDS was used to study molecular characteristics at the atomic level, while MD was for the interaction patterns of proteins and ligands. The results of the MDS analysis carried out at 10ns showed that the mutation at position 185 with alanine and glutamic acid changed the size/dimensional of RLP CS and affected its overall geometric structure. Interestingly, even though the structure has changed, the activity of the protein remains relatively constant, which is indicated by the results of MD, and has a relatively similar binding energy value of around -6.3 Kcal/mol. Keywords: Chromohalobacter salexigen BKL 5, molecular docking, molecular dynamic simulation, mutation, saltbridge
INHIBITION OF CYCLOOXYGENASE-2 USING BIOACTIVE COMPOUND DERIVED MORINGA OLEIFERA THROUGH MOLECULAR DOCKING APPROACH Antari, L.; Utami, W.; Marni, L. G.; Ismed, G. H. M.
Jurnal Kimia (Journal of Chemistry) Vol. 18, No.2, Juli 2024
Publisher : Program Studi Kimia, FMIPA, Universitas Udayana (Program of Study in Chemistry, Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Udayana University), Bali, Indonesia

Show Abstract | Download Original | Original Source | Check in Google Scholar

Abstract

ABSTRAK Respon tubuh terhadap iritasi, radiasi, infeksi, dan cedera menyebabkan peradangan. Penelitian ini menggunakan pendekatan molecular docking untuk mengeksplorasi potensi senyawa bioaktif dari Moringa oleifera terhadap reseptor COX-2. Penelitian diawali dengan redocking untuk validasi metode. Sepuluh senyawa bioaktif diperoleh dari https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov dan reseptor COX-2 dari www.rcsb.com. Senyawa dari Moringa oleifera dianalisis menggunakan Lipinski's Rule of File dan properti ADMET. Energi pengikatan dan interaksi residu asam amino dihitung menggunakan Autodock Tools 1.5.6 dengan memanfaatkan Lamarckian Genetic Algorithm (LGA). Hasil perhitungan menunjukkan delapan senyawa bioaktif yang memenuhi Lipinski's Rule of Five. Benzil glukosinolat memiliki energi pengikatan yang lebih rendah daripada ligan asalnya, yaitu -8,06 kJ mol-1 dengan residu asam amino TYR385, SER530, TYR355, HIS90, ARG513, LEU352, dan GLN192. Studi ini menunjukkan bahwa benzil glukosinolat, senyawa yang diisolasi dari Moringa oleifera, menunjukkan potensi yang menjanjikan sebagai penghambat enzim COX-2. Analisis komputasional menunjukkan bahwa molekul yang terjadi secara alami ini kemungkinan memiliki sifat antiinflamasi yang signifikan dengan menargetkan jalur siklooksigenase-2 secara selektif. Penelitian ini memberikan dasar yang kuat untuk riset masa depan di bidang penemuan dan perancangan obat, khususnya dalam pencarian agen antiinflamasi alami. Metodologi dan hasil yang disajikan di sini dapat menjadi referensi berharga bagi para peneliti yang mengeksplorasi fitokimia lain, sebagai petunjuk potensial untuk mengembangkan terapi antiinflamasi yang lebih aman dan lebih efektif. Kata kunci: antiinflamasi, COX-2, docking molekuler, Moringa oleifera ABSTRACT The body's response to irritation, radiation, infection, and injury causes inflammation. This research used a molecular docking approach to explore the potential of bioactive compounds from Moringa oleifera against the COX-2 receptor. It was initiated with redocking for method validation. Ten bioactive compounds were obtained from https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov and COX-2 receptors from www.rcsb.com, respectively. The compounds from Moringa oleifera were analyzed using Lipinski's Rule of File and ADMET properties. The binding energy and amino acid residue interaction were calculated using Autodock Tools 1.5.6 utilizing the Lamarckian Genetic Algorithm (LGA). The calculation results showed eight bioactive compounds that fulfill Lipinski's Rule of Five. Benzyl glucosinolate has a lower binding energy than the native ligand, namely -8.06 kJ mol-1with amino acid residues TYR385, SER530, TYR355, HIS90, ARG513, LEU352, and GLN192. This study demonstrates that benzyl glucosinolate, a compound isolated from Moringa oleifera, exhibits promising potential as a COX-2 enzyme inhibitor. The computational analysis suggests that this naturally occurring molecule may possess significant anti-inflammatory properties by selectively targeting the cyclooxygenase-2 pathway. Furthermore, this research provides a solid foundation for future investigations in the field of drug discovery and design, particularly in the pursuit of natural anti-inflammatory agents. The methodology and results presented here can serve as a valuable reference for researchers exploring other phytochemicals as potential leads for developing safer and more effective anti-inflammatory therapeutics. Keywords: anti-inflammation, COX-2, molecular docking, Moringa oleifera

Page 52 of 52 | Total Record : 518

 48   49   50   51   52 

Filter by Year

2007 2024


Reset
Filter By Issues
All Issue Vol. 18, No.2, Juli 2024 Vol. 18, No.1, Januari 2024 Vol. 17, No.2, Juli 2023 Vol. 17, No.1, Januari 2023 Vol. 16, No.2, Juli 2022 Vol. 16, No.1, Januari 2022 Vol. 15, No.2, Juli 2021 Vol. 15, No.1, Januari 2021 Vol. 14, No. 2 Juli 2020 Vol.14 No.1 Januari 2020 Vol.13 No.2 Juli 2019 Vol.13 No.1 Januari 2019 Vol.12 No.2 Juli 2018 Vol. 12 No.1 Januari 2018 Vol. 11. No.2 Juli 2017 Vol. 11. No. 1 Januari 2017 Vol. 10, No. 2 Juli 2016 Vol. 10, No. 1 Januari 2016 Vol. 9, No. 2 Juli 2015 Vol. 9, no. 1 Januari 2015 Vol. 8, No. 2 Juli 2014 Vol. 8, No. 1 Januari 2014 Vol. 7, No. 2 Juli 2013 Vol. 7, No. 1 Januari 2013 Vol. 6, No. 2 Juli 2012 Vol. 6, No. 1 Januari 2012 Vol. 5, No. 2 Juli 2011 Vol. 5, No. 1 Januari 2011 Vol. 4, No. 2 Juli 2010 Vol. 4, No. 1 Januari 2010 Vol. 3, No. 2 Juli 2009 Vol. 3, No. 1 Januari 2009 Vol. 2, No. 2 Juli 2008 Vol. 2, No. 1 Januari 2008 Vol. 1, No. 2 Juli 2007 Vol. 1, No. 1 Januari 2007 More Issue